Characterization of actinomycetes antagonistic to Phytophthora fragariae var. rubi, the causal agent of raspberry root rot Caractérisation d’actinomycètes antagonistes au Phytophthora fragariae var. rubi causant un pourridié des racines chez le framboisier

Abstract

Eleven actinomycete strains that were previously shown to protect raspberry (Rubus strigosus) plants against Phytophthora infection were characterized. all were shown to belong to the genus Streptomyces. Two strains (EF-34 and EF-76) grew at 4, 15 and 30°C on V8 agar between pHs 5 to 9. Seven strains including EF-34 and EF-76 had both the ability to hydrolyze Phytophthora cell walls and to inhibit Phytophthora growth at 15°C between pHs 5 to 9. all actinomycetes inhibited the growth of P. fragariaevar. rubi and of Pythium ultimum. The growth of other fungal species and of Gram-negative bacteria was inhibited only in the presence of three strains (EF-14, EF-72, and EF-76). The eleven antagonistic actinomycetes were classified into four groups with regard to their resistance to various pesticides used to protect raspberry crops. Strain EF-76 was further characterized. This strain was identified as Streptomyceshygroscopicus var. geldanus, and it was shown to produce geldanamycin, a known antibiotic.

Résumé

Onze souches d'actinomycetes ayant la capacité de protéger les plants de framboisiers (Rubus strigosus) contre les infections causées par les Phytophthora ont été caractérisées. Il a été montré que toutes les souches appartenaient au genre Streptomyces. Deux souches (EF-34 et EF-76) croissaient à 4, 15 et 30°C sur un milieu V8 agar dont le pH avait été ajusté entre 5 et 9. Sept souches dont EF-34 et EF-76 pouvaient hydrolyser les parois cellulaires de Phytophthora et inhiber la croissance du champignon à 15°C et à des pH variant entre 5 et 9. Toutes les souches inhibaient la croissance du P. fragariae var. rubi et du Pythium ultimum. La croissance d'autres espèces fongiques et de bactéries à Gram négatif n'était inhibée qu'en présence de trois souches (EF-14, EF-72 et EF-76). Les onze actinomycetes antagonistes ont été classés en quatre groupes selon leur résistance à divers pesticides utilisés pour protéger les cultures de framboisiers. La souche EF-76 a été caractérisée plus en détail. Cette souche a été identifiée comme étant le Streptomyces hygroscopicus var. geldanus, et produisait l'antibiotique geldanamycine.