Résumés de communications

L’approche est une application des bactériophages lytiques spécifiques à la bactérie Erwinia carotovora ssp. carotovora, l’agent responsable de la pourriture molle des tubercules de la pomme de terre, pour lutter contre cette maladie. Pour atteindre cet objectif, 82 bactériophages lytiques spécifiques à Erwinia carotovora ssp. carotovora ont été isolés. Ces bactériophages ont été caractérisés par des tests d’infection envers les différentes souches de Erwinia carotovora disponibles au laboratoire, ce qui a permis de les regrouper en 7 catégories (A, B, C, D, E, F, G). Une analyse des patrons de digestion de leurs ADN a été effectuée, ce qui a permis de les regrouper en quatre classes. L’examen de leur morphologie par microscopie électronique a montré une forme sphérique avec capside isocaèdre. Le regroupement des différentes catégories et classes des bactériophages et les tests de lyse en bouillon des bactériophages contre les différentes souches de Erwinia carotovora ont permis de sélectionner les cinq plus virulents bactériophages. Des essais de traitement des tubercules entiers de pomme de terre en condition d’entreposage ont été effectués : avec chacune des souches ou avec l’ensemble des souches d’Erwinia carotovora ssp. carotovora et le mélange des cinq bactériophages sélectionnés. Les résultats ont montré une réduction significative des symptômes de la pourriture molle de la pomme de terre. L’étendue et la sévérité des symptômes ont permis d’estimer l’action protectrice des bactériophages contre le développement de la pourriture molle. Ainsi, cette étude a permis d’identifier un mélange des bactériophages présentant un potentiel comme agents de lutte biologique contre la pourriture molle de la pomme de terre en entrepôt. Une enquête portant sur les principaux agents pathogènes provoquant la pourriture des racines chez le soja a été effectuée dans 116 champs de production commerciale en 2001 et 2002 à l’est de l’Ontario et au Québec. Nous avons ajouté les racines de soja naturellement infectées par le Phytophthora sojae (CRECO, Ottawa) et le Fusarium agent de la mort subite du soja (Harrow). Ces échantillons ont été utilisés comme témoins positifs pour la détection moléculaire. De petites portions des racines de plantules échantillonnées ont été mises en culture sur les milieux sélectifs pour isoler le Fusarium et les Pythium / Phytophthora. Le restant des racines a été congelé à –20 ºC et utilisé pour le dépistage moléculaire. Nous avons isolé au total 876 souches de Fusarium et 357 souches de Pythium. Nous n’avons pas isolé le P. sojae, mais à l’aide de la méthode de l’ADN nous avons détecté sa présence dans les racines de soja récoltées en Ontario dans 28 % des champs et au Québec dans 36 % des champs. Nous avons aussi détecté d’autres espèces de Pythium pathogènes envers les céréales. L’identification de 219 des 876 souches de Fusarium par la méthode de séquençage du gène EF1-alpha nous a permis de trouver 11 espèces dont certaines étaient très pathogènes envers le soja, tel que démontré dans les essais en boîte de Pétri et en chambre de croissance. Avec les séquences EF1 de Fusarium de notre étude et d’autres du domaine public, nous avons développé 71 oligonucléotides et mis au point pour la première fois une méthode moléculaire pour détecter et identifier rapidement les principales espèces de Fusarium responsables de la pourriture des racines, y compris l’agent pathogène qui cause la mort subite du soja en Amérique du Nord. Les nématodes phytoparasites ou anguillules sont d’importants ravageurs des plantes en agriculture. À l’échelle de la planète, les nématodes occasionnent plus de $100 milliards en perte de production annuellement et environ $ 7 milliards pour les États-Unis seulement. Ces petits vers microscopiques, tous …