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2024 — Using linked-reads to detect and characterizecomplex structural events in pediatric brain cancersRésumé
Les variantes structurales (SVs) jouent un rôle important dans plusieurs cancers du cerveau chez l’enfant mais ces variantes à grandes échelle (généralement définit comme >10kb) peuvent être difficile à détecter en utilisant le séquençage standard Illumina. Le séquençage à « courtes lectures » Illumina sont typiquement plus petit que les variantes d’intérêt ce qui veut dire qu’ils sont difficiles à aligner précisément au génome. Une solution possible est l’utilisation du séquençage à « longues lectures » comme ce de Pacific Biosciences (PacBio, Menlo Park, États-Unis) et Oxford Nanopore (ONT, Oxford, Royaume-Unis). Cependant, ces technologies ont un coût par base, un … Lire la suite
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2024 — Long-term changes in native mussel assemblages following zebra mussel invasionRésumé
Freshwater mussels (Unionidae) are the most imperiled faunal group in North America, with >70% of species threatened, endangered, or extinct. Unionid mussels on this continent have evolved in the absence of dominant macrofouling organisms; prior to the invasion of the zebra mussel (Dreissena polymorpha), no byssally-attached molluscs existed in North American inland waters. Consequently, unionid mussels have no adaptive defenses against zebra mussel fouling and typically suffer substantial mortality or near total extirpation within 4-8 years following invasion of habitats that support dense dreissenid populations. Water chemistry, specifically low calcium concentration, limits the proliferation and impacts of Dreissena in invaded … Lire la suite
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2024 — Unraveling a magmatic system: Saba (Lesser Antilles)Résumé
Saba, l'île volcanique la plus septentrionale des Petites Antilles, présente un volcanisme actif avec des sources thermales sur ses versants nord et sud-ouest. Bien que l'éruption la plus récente soit estimée à l'époque des colons européens, aucun écrit historique ne la documente. Les éruptions passées sur les îles voisines soulignent le potentiel destructeur des éruptions insulaires, nécessitant une surveillance. Malgré une compréhension limitée du système magmatique de Saba, l'objectif de cette thèse est d'améliorer la compréhension de son histoire géologique et du risque associé.Saba, couvrant seulement 13 km², présente des dômes attribués à une activité volcanique de type péléen encerclant … Lire la suite