McGill University Theses and dissertations published in 2013

Hilke, Michael (Internal/Cosupervisor2)  Read more

In this thesis, we have developed a parallel GPU accelerated code for carrying out transport calculations within the Non-Equilibrium Green's Function (NEGF) framework using the Tight-Binding (TB) model. We also discuss the theoretical, modelling, and computational issues that arise in this implementation. We demonstrate that a heterogenous implementation with CPUs and GPUs is superior to single processor, multiple processor, and massively parallel CPU-only implementations. The GPU-Matlab Interface (GMI) developed in this work for use in our NEGF-TB code is not application specific and can be used by researchers in any field without previous knowledge of GPU programming or multi-threaded programming. …  Read more

When contemporary readers, both young and old, claim "crossover books" such as Harry Potter, Twilight, and The Hunger Games as their own (Beckett, 2009; Falconer, 2009), they subvert socially constructed borders that segregate child and adulthood (James & Prout, 1997; Jenks, 1996). Some adults are perplexed and alarmed by this culture-sharing, because it challenges the dominant perception that child and adulthood are, and should remain, distinct states (Danesi, 2003; Postman, 1982). In this dissertation, I identify cross-reading as a critical practice that can encourage intergenerational connections by illuminating a continuum of experience between life stages and facilitating community and conversation …  Read more

The rate of evolution is a fundamental unifying concept in evolutionary biology and sets the stage for the investigation of genotypic, phenotypic and taxonomic biodiversity. This thesis specifically examined the rate of phenotypic evolution using discrete morphological characters, which are relatively understudied for this purpose compared to continuously-valued characters and traits. I first focused on heterogeneity in rates among characters in phylogenetic analysis. I used Bayesian model selection tools and 77 matrices of discrete morphological characters to show that a) models incorporating rate-heterogeneity among characters in phylogenetic analysis were preferred over equal-rates models in 80–88% of matrices, suggesting rate heterogeneity …  Read more

Preposture, Postposture is a seventeen-minute piece for four violins, viola, two celli, contrabass, electric guitar, two percussionists and live electronics. The title references the work's form, which alternates two dichotomous types of music; one calm, and the other, cacophonous. One type predominates earlier in the piece, while the other type gains prominence later in the piece. Sharply contrasting approaches to the role of the electronics and style of orchestration distinguish the two musical types; these distinct approaches are conveyed to the performers through design elements of the score. is thesis comprises three volumes: volume one is a written analysis of …  Read more

Comprendre la pathogenèse d'une maladie dégénérative du cerveau telle la maladie d'Alzheimer est d'une importance primordiale pour notre population vieillissante. Le cerveau est l'organe du corps humain avec le plus haut taux de cholestérol, et la neurophysiologie normale dépend fortement de ce stérol. La dysrégulation du stérol a été largement impliquée dans la pathogenèse de la neurodégénérescence, mais les efforts de recherche n'ont pas réussi à déterminer comment ces perturbations nécessaires causent la maladie. Les oxygénases hème sont des capteurs dynamiques de stress oxydatif cellulaire et des médiateurs probables de l'homéostasie redox tissulaire à travers le spectre phylogénétique. Toutefois, le …  Read more

Gold, Ian Jeffrey (Internal/Supervisor)  Read more

Interactions of egg proteins (ovalbumin, conalbumin, egg white proteins, and egg yolk proteins) with selected phenolic compounds (flavone, chrysin, quercetin, and rutin) in aqueous media were examined by electrophoresis and fluorescence spectrophotometry. SDS-PAGE and native-PAGE results showed variable changes on the electrophoretic behaviour of egg white proteins in the presence of quercetin, while conalbumin-phenolic reaction products showed interactions under non-reducing conditions only. Fluorescence quenching technique was used to investigate the nature of egg protein-phenolic interactions and to estimate the effect of glycosylation and hydroxylation of phenolic compounds on the affinity to egg proteins. Stern-Volmer data revealed that the mechanism of …  Read more

This thesis is focused on the investigation of synthetic approaches for the preparation of oligonucleotides in solution. We describe our efforts to produce these valuable molecules in a more cost effective manner relative to the current industrial standards employing solid supported synthesis. We demonstrate that an ionic tag supported synthesis technique can be successfully applied to oligonucleotide synthesis using a phosphonium-based ionic tag, using simple precipitation and phase separation methods without the need for chromatography to obtain reasonably high product purity at each step. We also explore the optimization of the technique as it is moved to the gram scale …  Read more

"Reflection and Revision in the Novels of Frances Burney" constitutes the only comprehensive portrait of this major author as novelist at work (active 1778-1832), incorporating analysis of her revisions in manuscripts, proofs, and subsequent editions. Burney's Evelina, Cecilia, and Camilla are among a very small number of eighteenth-century novels with surviving manuscript drafts. The term "revision" is thus essential for my study, and I use it to describe Burney's process of composition, which is closely connected to the other key term in my study, "reflection." Reflection, a reflexive act often synonymous with self-awareness, is an important characteristic of the novel …  Read more

Lepage, Martin (Supervisor1)  Read more

Ethical decision-making is an important function of social workers in any domain of the health and social services field. The decision-making process is particularly challenging when working with elder abuse clients whose cases present various ethical dilemmas. This thesis explores the role of the social worker in working with victims of elder abuse, the dominant issues and the ethical decision-making models that are available to ensure that fundamental values and principles are respected while ensuring the well-being of the client. In doing so, this thesis supports the contribution of the ethics of care model as a theoretical framework available to …  Read more

This thesis questions the contemporary perception of climate change governance as a purely international responsibility, to be primarily addressed by multilateral negotiations of nation states. An engagement with the geographic theory of scale demonstrates sub-national governments' (SNG) role in the governance of local causes and effects of climate change. SNG networks are an emerging actor in climate change governance, as SNGs have grouped together to tackle climate change collectively. This thesis considers the value of these SNG networks in influencing the laws and policies of their members, as well as the international regime. More broadly, the membership of SNG networks …  Read more

The solidification behavior of an Aluminum-Lithium-Copper (Al-Li-Cu) alloy, AA2199, and the microstructural morphology and solute distributions resulting from three rapid solidification processing techniques were investigated. Controlled-Short-Circuiting Metal-Inert-Gas (CSC-MIG) welding, Laser Re-melting (LRM), and Electrospark Deposition (ESD) were investigated. The morphology of the rapidly solidified material was then compared with the Kurz-Giovanola-Trivedi (KGT) model for microstructural development during rapid solidification, to allow for the estimation of the solidification front velocity (SFV) realized during processing. This SFV was then compared with that required for non-equilibrium solute partitioning as predicted by the Continuous Growth Model (CGM) of Aziz. The solute distributions where then …  Read more

Cette thèse décrit le travail entrepris pour caractériser la roche calcaire argileuse Lindsay-Cobourg (LCL), une strate géologique candidate pour la construction du Deep Ground Repository (DGR), un site pour disposer de déchets radioactifs de niveau d'intensité basse ou moyenne. La recherche inclut des expériences pour déterminer la résistance à la compression et la traction, les propriétés physiques, la perméabilité et la composition du matériau. La recherche porte principalement sur des expériences sur la résistance à la traction, ce qui inclut une méthode alternative pour tester la résistance d'un matériau cassant, le test d'expansion de la cavité centrale, ainsi que la …  Read more

This thesis studies and develops quality-of-service (QoS)-aware power allocation and frequency provisioning schemes for multicarrier wireless systems in a frequency-selective fading environment. We first develop an optimal subcarrier power allocation algorithm to maximize the energy efficiency (EE) of a single-user multicarrier link under delay-outage probability constraints, where EE is defined as the ratio of the achieved effective capacity (EC) to the total expenditure power. Specifically, we formulate the QoS-driven EE maximization problem and show that its objective function is quasi-concave in the transmission power, and as a result, derive the global optimum solution using fractional programming. The developed optimal power …  Read more

Boyd, Andrew (Supervisor)  Read more

Cette these compare des GAM et GLMM dans le cadre de la modélisation des courbes non-linéaires. L'étude comprend une simulation complète et quelques analyses réelles. La simulation utilise des milliers de 'datasets' générés pour comparer forme entres les deux modèles (et les modèles linéaires comme point de repère), l'étendue de la non-linéarité, et la forme de la courbe obtenue. Les analyses d'étendre les résultats de la simulation à courbes de la fonction pulmonaire avec de GLMM / GAM avec mesures du tabagisme (la variable indépendante). Un autre analyse réelle avec les résultats dichotomiques complète l'étude et que les résultats soient …  Read more

Cystic fibrosis (CF) is a fatal genetic disorder characterized by chronic inflammation in the airways, involving an accumulation of neutrophils induced by increased production of interleukin (IL)-8 by pulmonary macrophages and airway epithelial cells. Increased airway inflammation leads to progressive lung damage and early death in patients with CF. There is a need for more specific therapies targeting sources of airway inflammation in CF. Vitamin D deficiency is frequent in the CF population, affecting up to 95% of patients. Serum vitamin D levels have been shown to positively correlate with lung function, and negatively correlate with inflammation and infection. Restoring …  Read more

This paper analyzes the effect that ethnic diversity has on out-group approval and how inter-group contact mediates this relationship. Out-group approval is defined as the extent to which native Germans readily accept the existence of out-groups in German society. The indicators of this include diversity beliefs, support for building mosques, out-group trust, generalized trust, and ethno-centrism. I test this relationship using the DivCon survey, carried out by the MaxPlanck Institute in Germany. Using multi-level regression models, I find that neighbourhood diversity is not negatively related to out-group approval, but both weak-ties and strong-ties inter-group approval do mediate this relationship. I …  Read more

Cette thèse a pour objet l'étude d'une population de distantes et poussiéreuses galaxies à sursauts d'étoiles (DSFGs) ayant subit l'effet de lentille gravitationnelle et ayant été découvertes lors de grands sondages des ondes millimétriques. Le présent travail est constitué d'une collection d'études à la fois théoriques et observationnelles qui ont fait la lumière sur différents aspects de cette population de galaxies, et qui ont pavé la voie pour l'utilisation future de ces sources pour l'étude de la formation des galaxies à décalage vers le rouge élevé, de la matière noire et de l'énergie sombre. Deux chapitres du présent travail présentent …  Read more

Teichmann, Marek (Supervisor2)  Read more

Recklies, Anneliese D (Supervisor2)  Read more

L'eucalyptus, originaire d'Australie, est une espèce d'arbre largement cultivée à travers le monde pour la construction, l'industrie du papier et comme combustible pour usage domestique. Sa croissance rapide en a fait une espèce très populaire parmi les pays en voie de développement, mais ses impacts négatifs sur l'environnement, notamment sa forte consommation d'eau et son allélopathie, l'ont mis au centre d'une controverse (Calder et al., 1997; del Moral & Muller, 1970; Kholi & Singh, 1991; Scott & Prinsloo, 2008). Récemment, certaines études portant sur l'ajout d'acacias à des monocultures d'eucalyptus ont montré que cette combinaison permettait une utilisation plus efficiente …  Read more

Both tectonics and climate profoundly influence orogenisis, but specifics regarding the forcings, interactions and feedbacks are still largely unclear. This study addresses the evolution of the Cordillera Blanca Mountain Range of northern Peru: an elevated, high-relief, 200 km long string of glaciated peaks comprising the spine of the Andes. Extension along the Cordillera Blanca Detachment Fault (CBDF) actively produces relief along the western flank of the range, exceeding several kilometers in many areas. Abundant records of past glaciations span from >440 ka to the present in the form of moraine and bog deposits. Thus, tectonics (active faulting) and climate (glacial …  Read more

Les aminoglycosides sont des antibiotiques à large-spectre utilisés pour les infections sérieuses. Avec l'émergence et la propagation de la résistance antibiotique, leur usage thérapeutique devient de plus en plus précaire. Le mécanisme de résistance le plus commun est l'expression d'enzymes qui modifient les aminoglycosides (AME). Les AMEs fonctionalizent les aminoglycosides de façon régiosélective, ce qui réduit leur affinité pour le ribosome bactérien. Aminoglycoside 6'-N-acetyltransférase-Ii (AAC(6')-Ii), qui est encodé sur le chromosome d'Enterococcus faecium, transfert un groupement acétyl de AcCoA à l'amine 6' des aminoglycosides. Plusieurs inhibiteurs de cet enzyme ont été découverts par le groupe Auclair. Initialement, des inhibiteurs bisubstrats …  Read more

Cette étude fait partie d'un projet de recherche participative communautaire qui vise à 1) développer et mettre en œuvre la section activité physique d'une politique de bien-être à l'école, 2) évaluer les facilitateurs et les obstacles à la mise en œuvre et l'application des résultats parmi un grand nombre de parties prenantes, et 3) diffuser les résultats à d'autres parties prenantes à l'intérieur et à l'extérieur de la communauté. Le projet est effectué en collaboration avec les intervenants communautaires et les chercheurs universitaires affiliés avec Kahnawake Schools Diabetes Prevention Project, une organisation de promotion de la santé qui est bien …  Read more

Afin de voir l'important potentiel thérapeutique que représente l'ingénierie tissulaire se réaliser, il faut d'abord voir la réalisation de matrices inductrices tridimensionnelles pouvant régir le comportement des cellules de même que l'architecture des tissus. Bien que différentes stratégies permettant la libération de molécules bioactives en matrice soient à l'étude, les conditions de traitement les plus souvent utilisées restreignent l'architecture du système et les propriétés mécaniques qui pourraient être produites.Le principal objectif de cette thèse était de développer un système inducteur d'ingénierie tissulaire pour la libération tridimensionnelle in situ de gènes à l'aide d'une technique de dépôt couche par couche et …  Read more

This research examines how self-regulated learning facilitates critical analysis development among undergraduate medical students in a journal club, and how computer-supported collaborative learning influences their self-regulated learning. Fourteen of the 29 second-year medical students who initially consented to participate in the study actually completed the training. A mixed method design was employed as both quantitative and qualitative data were collected. Quantitative data included pre- and post-tests on self-regulated learning and critical analysis, and qualitative data consisted of audio and video tapings of pair discussions and participants' reading processes. Quantitative analysis indicated that none of the results was significant, due primarily …  Read more

Les kinases Src sont des tyrosine-kinases cytosoliques qui sont impliquées dans multiples processus dans les cellules épithéliales et autres. Originalement identifiée comme un oncogène viral, la kinase Src est maintenant caractérisée comme une régulatrice de la prolifération, la différenciation et la motilité cellulaire. Nous avons précédemment montré que les kinases Src sont capables de modifier l'expression génique dans les tubules des reins durant le domage rénal par ischémie et réperfusion. Cependant, les mécanismes de signalisation qui contrôle la réponse transcriptionelle des kinases Src ne sont pas bien compris. La présente thèse décrit deux nouveaux inhibiteurs endogènes de la famille de …  Read more

The heightened stress experienced by parents of children with autism spectrum disorder (ASD) and Down's syndrome (DS) is well documented. Parent stress affects child behaviour, skills, and wellbeing and vice versa. These interrelationships affect the wellness of the whole family unit. Parent stress levels, child expressive and receptive language ability, and the impact of language competency in children with ASD and DS on the type and extent of parent stress were investigated in a sample of mother-child dyads (N = 84). Participants volunteered from early intervention programs. Stress was measured in mothers, and children were assessed for expressive and receptive …  Read more

Le rôle des protéines impliquées dans le guidage des axones durant le développement du système nerveux est bien établi. Toutefois, même après le développement, dans le système nerveux central mature, plusieurs de ces molécules sont exprimées, incluant le signal moléculaire nétrine-1, et son récepteur Deleted in Colorectal Cancer (DCC), ainsi que le signal moléculaire Receptor Protein Tyrosine Phosphatase σ (RPTPσ), ce qui suggère que ces protéines ont des rôles qui dépassent le développement.Dans cette thèse, on explore la fonction du récepteur DCC dans la modulation synaptique. On aborde le rôle de DCC dans la ramification des extensions des neurones, ce …  Read more

Background: T2DM (Type 2 Diabetes) has relatively recently emerged as new epidemic now affecting children. T2DM also disproportionately affects Canadian First Nations and Inuit. Physical activity during childhood has been shown to reduce the likelihood of the progression to overweight and obesity in adulthood. Overweight and obesity are predictors of the onset of T2DM. Objective: To describe and assess activity levels of schoolchildren in an indigenous elementary school with and without the presence of a playground animator in order to further enhance knowledge and prevent T2DM in this population. The proportions of students in sedentary, active, and walking (moderate) physical …  Read more

Van de Ven, Theodorus G. (Supervisor2)  Read more

Buckeridge, David (Internal/Cosupervisor2)  Read more

Parental care during the postnatal period has a major role in emotional development of the offspring. In the biparental species, the California mouse (Peromyscus californicus), both the father and the mother have a highly participative role in the postnatal care of pups. Previous studies have shown that if the father is removed, the mother does not compensate for his absence, thus the pups are deficient in care. Here we present results obtained after evaluating the emotional behavior and serotonin (5-HT) neurotransmission of adult California mice after father separation. Pairs of California mice were used for breeding and on postnatal day …  Read more

Bédard, Jean (Internal/Cosupervisor2)  Read more

Oscillateur à verrouillage de phase (PLL) et commandé en tension (VCO) sont largement utilisés des composants électroniques utilisés dans diverses applications telles que la synthèse de fréquence, les données de récupérer et de compensation de biais. PLL est également utilisé dans l'amplificateur à verrouillage (CER) de demande. La LIA est largement utilisé dans les paramètres optiques et physiques pour extraire un signal faible incorporé dans la puissance du bruit ambiant élevé. Le CER repose sur des techniques telles que le filtrage de bruit et à verrouillage de phase pour extraire l'amplitude et la phase du signal d'entrée. PLL est utilisée …  Read more

Dans ce travail de thèse, deux nouvelles méthodes de segmentation automatique d'Image par Résonance Magnétique (IRM) sont proposées. Ces deux méthodes sont appliquées et validées dans le cadre de la segmentation des structures du lobe medio temporal du cerveau humain. La première méthode de segmentation proposée repose sur un modèle d'apparence de forme adaptatif utilisant simultanément plusieurs séquences d'IRM. Cette méthode combine des ensembles de niveaux et une modélisation d'apparence de formes actives tout en incorporant l'information issue de différents contrastes en IRM. L'importance de chaque séquence IRM est estimée automatiquement au sein d'un schéma adaptatif en utilisant la corrélation …  Read more

Prasher, Shiv (Supervisor2)  Read more

La banane (Musa acuminés) est un fruit sain qui joue un rôle important dans les régimes alimentaires équilibrées et dans le commerce international. Cependant, beaucoup de pertes sont encourues dans la manutention et la transformation des bananes ce qui génère des problèmes environnementaux et réduit sa disponibilité sur les marchés. Cette étude porte sur la valorisation des bananes déclassées et sur les effets du procédé de séchage sur ses caractéristiques physico-chimiques. Dans la première partie de l'étude, les propriétés physico-chimiques de la banane ont été mesurées à différents niveaux de maturité afin d'établir des modèles prédictifs. Pour y parvenir, la …  Read more

Cette thèse soutient que le roman de trauma britannique a émergé au tournant du XIXe siècle en réponse à la montée des conceptions individualistes de l'intégrité personnelle et à la valeur croissante accordée à la vie humaine ordinaire. Les moments de souffrance intense ont commencé à être compris comme étant des violations choquantes et traumatisantes des frontières de l'identité, et les romans de trauma du début jusqu'au milieu du XIXe siècle contribuent à cette opposition culturelle entre la souffrance et l'individuation. Dans ces romans, les limites individuelles sont souvent imaginées en termes d'architecture et le traumatisme est présenté comme une …  Read more

Le rythme thêta de l'hippocampe est une activité neuronale oscillatoire dans la gamme de 3 - 12 hertz, pouvant être primordialement observée durant les enregistrements extracellulaires de champ hippocampal in vivo. Le rythme thêta hippocampal a été étroitement associé à la mémoire épisodique et à l'exploration spatiale chez les humains et les animaux. Dans cette thèse, je décris deux projets de recherche mis à exécution au cours de mon Ph.D. et explorant différents types de neurones qui pourraient potentiellement servir de générateurs pour les rythmes thêta de l'hippocampe. Le septum médian et la bande diagonale de Broca (MS-DBB) ont été …  Read more

Le facteur de transcription CUX1, et plus particulièrement ses isoformes courtes, sont impliquées dans différents processus associés au développement cancéreux dans des expériences de culture de tissus et dans des modèles de souris transgéniques. De plus, CUX1 est sur-exprimé dans de nombreux cancers humains. Les fonctions attribuées jusqu'à présent à CUX1 sont associées à son activité transcriptionelle. Cependant, il est possible que CUX1 joue un rôle non-transcriptionel dans la cellule. La purification par affinité en tandem, couplée à la spectrométrie de masse, a permis d'identifier plusieurs partenaires d'interaction de CUX1. Le but de mes études a été de valider et …  Read more

Le cancer de la peau est le plus fréquent dans le monde avec presque trois millions de cas par an. Les mélanomes cutanés sont les cancers de la peau les plus mortels, puisqu'ils sont responsables de 75 pour cent des morts liées aux cancers cutanés. Au cours des cinquante dernières années, le taux d'incidence des mélanomes dans les pays développés a augmenté plus vite que pour les autres cancers. Bien que la plupart des patients présentent une tumeur localisée au moment du diagnostic et sont soignés par excision de la tumeur primaire, les mélanomes cutanés peuvent former des métastases dans …  Read more

The ability to soft-launch projectiles to velocities exceeding 10 km/s is of interest for a number of scientific fields, including orbital debris impact testing. Current soft-launch technologies have reached a performance plateau below this operating range. In the implosion-driven launcher (IDL) concept, explosives are used to linearly implode a pressurized steel tube, thereby dynamically compressing a light driver gas to significantly higher pressures and temperatures than typical light-gas launchers. As a result, the IDL has the potential to significantly outperform current state of the art hypervelocity launchers. This work will focus on establishing an understanding of the critical design parameters …  Read more

Microresonators are crucial components of microelectromechanical systems (MEMS) used for communicating and sensing. One of the main objectives while designing microresonators is to minimize all sources of energy dissipation leading to damping. This thesis focuses primarily on dissipation at the points of attachment of the microresonator to the larger supporting frame, package, and test setup. The sources of such attachment losses include stress-wave radiation at the supports and stick-slip friction at the clamps. In the absence of accurate models for all such sources, it becomes necessary to analyze attachment losses by using the limits of thermoelastic damping for calibration. The …  Read more

L'étude présentée ici discute la marchandisation et la décadence de l'Hellénisme et de la paideia durant la Seconde Sophistique. L'essence de l'Hellénisme a dû changer d'une ethnique ésotérique à une éthique universelle et inclusive. La compétition pour une audience obligea les sophistes à adopter un style de cours davantage théâtral, dans lequel les apparences et le divertissement étaient plus importants que l'enseignement. Le contexte socio-politique romain encouragea également la dissimulation en marchandant activement le rôle du sophiste et du philosophe. À la fin, les plaisirs superflus du spectacle permirent à un nouveau code moral d'adopter et d'adapter une éducation philosophique …  Read more

According to the Canadian Cancer Statistics 2012 annual report, cancer remains a major cause of death, with an estimated 186 400 new cases, and 75 700 deaths. eIF4E is dysregulated in many cancers, including breast cancer. Our lab has considerable preliminary data to suggest that eIF4E, and specifically phosphorylated eIF4E, is involved in the Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT) and metastasis. Moreover, Borden, K.L.B., et al., and our lab have recently published that the drug Ribavirin targets eIF4E and inhibits breast cancer cell growth. The main objective of this thesis project is to determine the impact of Ribavirin on EMT. Our data …  Read more

Le but de cette étude était de faire une analyse concernant les techniques d'enseignements favorites des étudiants fréquentant le deuxième cycle du secondaire dans le volet de compréhension de lecture de leur cours d'anglais langue seconde. Une autre cible de cette étude était de déterminer quelle était la compétence favorite des étudiants à développer durant les heures de cours. La meilleure méthode disponible afin de faire cette étude était la méthode de sondage quantitative. Le questionnaire s'orientait sur différentes techniques d'enseignements fréquemment utilisées dans les classes des cours d'anglais langue seconde. Les étudiants devaient prendre position en termes d'appréciation face …  Read more