McGill University Theses and dissertations published in 2018

In this paper, we consider random plane forests uniformly drawn from all possible plane forests with a given degree sequence. Under suitable conditions on the degree sequences, we consider the possible scaling limits, with respect to the Gromov-Hausdorff-Prokhorov topology, of a sequence of such forests as the number of vertices tends to infinity. This work falls into the general framework of showing convergence of random combinatorial structures to certain Gromov-Hausdorff scaling limits, described in terms of the Brownian Continuum Random Tree (BCRT), pioneered by the work of Aldous. We study the scaling limit in two regimes: critical and supercritical. In …  Read more

Le virus de l’Herpès Simplex de type 1 (VHS-1) et le Cytomégalovirus (CMV) sont des pathogènes très prévalents. Les symptômes cliniques sont variés, allant d’une infection asymptomatique à de sévères infections pouvant causer la mort ou des effets morbides a long-terme. Les populations immunosupprimées ou au système immunitaire immature sont particulièrement à risque. Afin de comprendre les mécanismes fondamentaux de la pathogenèse, l’utilisation de souche de souris consanguines fut particulièrement utile. Ces différentes souris répliquent les hauts points de l’infection et possède une variation génétique naturelle dans la résistance au virus. De plus, l’introduction aléatoire de mutation chez la souris …  Read more

Reading engagement has previously been studied in quantitative longitudinal studies with standardised testing procedures (cf. Guthrie & Cox, 2001; Guthrie & Wigfield, 2000). In addition to these studies, recent research (Ivey & Johnston, 2016) showed how students develop their reading engagement aptitudes as they make meaning through transformative practices and by situating themselves in comparison to the “Other”, that is, characters in the narrative. Research in this area has proven useful to foster adolescents’ literacy practices and agency (Muth, 2016) regarding their reading engagement. With my doctoral study, I provide insight into high school males’ traces of reading engagement, given …  Read more

Carret, Anne-Sophie (Internal/Cosupervisor2)  Read more

Les dommages provoqués par le gel-dégel sont un mécanisme de détérioration causé lorsque le béton saturé est exposé à des variations de température qui se produisent au-dessus et au-dessous de son point de congélation. L'expansion de l'eau dans l'espace des pores du béton en raison de la congélation peut entraîner une fissuration interne, accélérant ainsi le processus de détérioration par des cycles répétés de congélation-décongélation. La détérioration par congélation-décongélation réduit la capacité du béton à résister à la charge de fatigue. À son tour, le béton qui a subi des dommages importants causés par le gel et le dégel survivra …  Read more

La majorité des patients avec le cancer perde leur combat contre leur diagnosticcomme conséquence de la métastase tumorale. Les procédures chirurgicales sontcommunes pour les patients atteints du cancer dans l'espoir de garder leur diagnosticlocalisé. Malheureusement, des infections post-opératoires suivent ces procédureschirurgicales plus fréquemment qu'espéré. En relation, il existe de fortes preuvescliniques où le système immunitaire inné est capable d'induire des changements quipotentialisent la métastase de cellules cancéreuses lorsqu'il est stimulé par infection.De même, comme réponse à une infection bactérienne, un récepteur cytoplasmique dusystème immunitaire inné, le récepteur du domaine d'oligomérisation des nucléotides 1(NOD1), cause une augmentation de métastase du cancer …  Read more

Van-Gogh-like 2 (Vangl2) joue un rôle critique dans l'établissement de la polarité cellulaire planaire (PCP) et dans le développement du tube neural chez les vertébrés. Vangl2 contribue également à l'organogenèse et au développement de nombreux tissus chez les vertébrés. Cette thèse élargit le domaine des connaissances sur le développement médié par Vangl2 en présentant une nouvelle fonction de Vangl2 dans la régulation du développement rétinien et dans le guidage axonal rétinien.Nous avons premièrement établi l'expression spacio-temporelle de Vangl2. Nous avons trouvé une expression dynamique et robuste dans la couche de cellules ganglionnaires de la rétine et dans le nerf optique …  Read more

Bourque, Charles W. (Internal/Supervisor)  Read more

Les individus qui présentent un trouble du spectre autistique (TSA) démontrent un profil atypique de capacités visuospatiales perceptives et attentionnelles. Alors que certaines études leur attribuent une capacité perceptive accrue, d'autres leur attribuent une capacité attentionnelle diminuée. La rétroaction des tâches affecte différemment les personnes qui présentent un TSA en fonction de facteurs tels que le type de rétroaction, le moment auquel elle est présentée et la difficulté de la tâche (ex : van Noordt et al., 2017). Un nombre croissant d'études relie ces différences aux caractéristiques primaires de l'autisme (ex : van Noordt et al., 2017). Les paradigmes de …  Read more

Malgré les efforts et initiatives éducationnels divers des collèges et universités nord-américaines, le taux d'agression sexuelle n'a pas diminué dans les cinquante dernières années. Étant donné que près de 25% des étudiantes inscrites au baccalauréat aux États-Unis et au Canada sont victimes de viol ou d'agression sexuelle, la violence sexuelle sur les campus demeure un problème urgent. Ma recherche dévoile certaines façons dont la sécurité des femmes est touchée par les politiques institutionnelles de l'enseignement supérieur. Utilisant plusieurs méthodes de recherches qualitatives, j'ai mené une ethnographie institutionnelle sur la réponse d'une université (par exemple, politiques, e-mail, etc.) à la violence …  Read more

Hoover, Michael L (Internal/Supervisor)  Read more

The Cascadia subduction zone is short of modern seismological records of megathrust earthquakes, which makes it difficult to investigate the potential of fault ruptures directly. At the very beginning of the 21st century, a type of quasi-static fault deformation was observed around the downdip end of seismogenic zones. These aseismic transient events are called slow slip events (SSEs). SSEs accommodate a fraction of the plate convergence and may affect the stress loading at the megathrust depths. The discovery of SSEs sheds light on our knowledge of megathrust faults. This thesis aims to investigate physical constraints for subducting faults at depths …  Read more

Nicolau, Belinda Farias (Internal/Supervisor)  Read more

"Les lysine acétyltransférases et désacétylases ne sont pas seulement importantes pour la régulation des programmes cellulaires (tels que la prolifération cellulaire, la différenciation et la transcription génique), mais aussi impliqués dans le contrôle du développement et de différentes maladies. En tant qu'organe le plus complexe chez les mammifères, le cerveau est contrôlé par des voies de signalisation intracellulaires et extracellulaires pour maintenir l’homéostasie durant le développement. Dans ces voies, l'acétylation de la lysine joue un rôle essentiel. Pour comprendre les fonctions de cette modification au cours du développement cérébral, j'ai étudié les rôles de l'alpha-tubuline acétyltransférase 1 (ATAT1) et de …  Read more

Au cours des années, les modulateurs haut vitesse à bas coût ont suscité un immense intérêt en recherche, afin de répondre au trafic toujours croissant dans les centres de données. La photonique sur silicium est une plateforme mature compatible avec les procédés de fabrication CMOS, ayant de plus un bas coût pour une intégration à grand volume. Les systèmes à modulation d'intensité et détection directe n'ont pas besoin d'un oscillateur local ou d'un traitement de signal numérique (DSP) compliqué, ils sont donc préférés aux systèmes cohérents pour les applications intra centre de données. Actuellement, la modulation de l'amplitude d'impulsion à …  Read more

L’atrophie musculaire se produit lorsque les muscles sont inutilisés, lors d’un jeûne, avec le vieillissement, dans le cadre de maladies telles que le cancer, la MPOC ou encore lors de traitements tel que l’administration de glucocorticoïdes. L’activation du système ubiquitine-protéasome (UPS) et plus particulièrement l’induction de plusieurs ubiquitine ligases semble constituer un des mécanismes prépondérant pour augmenter la dégradation des protéines et l’atrophie musculaires. Toutefois, le rôle d'enzymes possédant une activité de dé-ubiquitination dans le contexte de l’atrophie musculaire demeure peu connu. Fait intéressant, nous avons identifié une protéase (USP19) possédant une activité de dé-ubiquitination qui est régulée positivement en …  Read more

Ngadi, Michael O. (Supervisor1)  Read more

Weighted finite automata (WFA) can expressively model functions defined over strings. However, a WFA is inherently a linear model, with the transition matrices being a linear function. Neural network, on the other hand, is a powerful nonlinear function approximator. In this paper, we propose a neural network based nonlinearWFA model along with a learning algorithm. Our learning algorithm is inspired by the classic spectral learning method for WFA. It turns out that learning the WFA canbe described as a two-stage process. The first one is to find a rank factorization for the so-called Hankel matrix and the step two is …  Read more

Parallel-kinematics machines (PKMs) have been studied extensively due to their significantly higher accuracy, rigidity and load-carrying capacity over serial robots. However, they suffer of limited workspace, multiple singularities and coupled motion, making their design and analysis quite challenging. In this dissertation, two classes of six-degree-of-freedom (dof) PKMs are proposed, i.e., the 3-CPS and 3-CCC topologies. Their kinematics, singularity, workspace analyses and optimum design were conducted. Both have three limbs yielding less interference and larger workspace when compared with the six-limb Stewart-Gough PKM. Moreover, all motors are mounted on the base, greatly reducing the inertia load of the system while providing …  Read more

Follicle-stimulating hormone (FSH), a product of pituitary gonadotrope cells, is an essential regulator of ovarian follicle development and fertility in females and of quantitatively normal spermatogenesis in males. According to the current dogma, FSH synthesis is stimulated by intra-pituitary activins and is suppressed by gonadal inhibins. Activins, members of the transforming growth factor family, regulate FSH production by inducing FSHβ subunit (Fshb) transcription. Based on in vitro evidence, activins signal through type I and II serine/threonine kinase receptor complexes. Once bound by activins, the type II receptors phosphorylate cytoplasmic effector protein SMAD3, which then complex with SMAD4, and accumulate in …  Read more

Cette thèse se concentre sur des problèmes d'analyses en composantes principales (ACP) incomplètes et de régression non linéaire. Nous étudions plusieurs modèles dans ces deux catégories. De plus, nous explorons les avantages d'appliquer ces deux techniques séquentiellement et de les entraîner comme une unité intégrale. Premièrement, nous avons choisi trois modèles d'ACP incomplètes, ceux sont les algorithmes d'ACP incomplètes optimales (ACPIO), les algorithmes de puissance générale (PG) et les algorithmes d'ACP doublement incomplètes (ACPDI). Les algorithmes dans notre étude sont comparés en utilisant la perte d'information et la variance expliquée. Ces algorithmes sont testés avec des données synthétiques et réelles. …  Read more

Les véhicules électriques (VÉ) sont de plus en plus répandus. Une avenue prometteuse pour améliorer les performances et l'efficacité des VÉ est l'utilisation des transmissions multi vitesses (TMV). Des rapports de vitesse multiples permettent de maintenir le moteur de traction dans sa zone de fonctionnement le plus efficace, en particulier pour les véhicules électriques de moyenne et de grande puissance. Pour arriver à une conception et une commande optimales des TMV destinées à des VÉ, une analyse dynamique approfondie est nécessaire. Cependant, un modèle mathématique complet des TMV pour VÉ n'a pas à ce jour encore été élaboré. Ce modèle …  Read more

In this thesis, I propose that suggestion may play an underappreciated role as a mechanism of action in meditative practice. Suggestion is the process by which communicable ideas about what one is likely to experience actually shape what one experiences. Suggestions can profoundly modulate a range of physiological and cognitive functions, including processes of autonomic arousal and attention regulation that have featured prominently in mechanistic models of meditation. The scientific literature on suggestion (including research on hypnosis and placebos) offers a wealth of useful theories and experimental paradigms for tracing how socially transmitted beliefs and expectations directly impact the body …  Read more

Le mercure (Hg) est un métal trace qui est omniprésent dans la nourriture. Il peut induire des effets néfastes sur la santé sur le système nerveux, les reins, les systèmes immunitaires et cardiovasculaires, ainsi que sur les fonctions reproductives. La principale cause d’exposition de l’être humain au mercure se fait au travers de l’alimentation. Des études ont confirmé que la consommation de poisson et fruits de mer est la principale source de mercure (principalement sous forme méthylmercure). Toutefois, la littérature récente a identifié le riz comme une source potentiellement significative de mercure, spécialement pour les populations pour lesquelles le riz …  Read more

Introduction- Une salivation normale est nécessaire à la santé d'un patient. La salive est impliquée dans la digestion, la lubrification, la protection antibactérienne et la réminéralisation dentaire. Les symptômes d'hyposalivation comprennent notamment la xérostomie, les infections buccales, la carie dentaire, la douleur, la dysgeusie et une diction perturbée. L'hyposalivation se présente chez les patients, souffrant d’un cancer de la tête et du cou, soumis à une radiothérapie et les patients atteints du syndrome de Sjögren, une maladie auto-immune. De nombreux médicaments et thérapies cellulaires ont été proposés pour rétablir la sécrétion. Parmi les études des glandes salivaires se trouve la …  Read more

Rogers, Robin (Internal/Cosupervisor2)  Read more

Douglas, Peter (Internal/Supervisor)  Read more

Beech, Robin N. (Internal/Cosupervisor2)  Read more

Galbraith, John W. (Supervisor1)  Read more

Robbins, Shawn (Internal/Cosupervisor2)  Read more

Le thème général de cette thèse est le développement de réactions catalysées par l’irradiation de lumière, sans métal. Le chapitre 1 introduit brièvement les précédents travaux réalisés dans le domaine des réactions catalysées sans métal, le domaine de la photochimie ainsi que la chimie dans l’eau. Le chapitre 2 décrit le développement du couplage sans métal entre des alcynes aromatiques et des iodures d'alkyles dans l’eau promu après exposition à la lumière, puis du couplage entre des dérivés styréniques et des iodures d'alkyles. De plus, le couplage d’alcynes aromatiques avec des -bromures de carbonyles dans l’eau est aussi présenté. Finalement, …  Read more

Bone homeostasis requires a strict balance between bone formation and bone resorption, mediated by osteoblasts and osteoclasts, respectively. Perturbation of these activities can give rise to bone disorders such as osteoporosis and osteopetrosis. Osteopetrosis is an inheritable bone disorder characterized by dense, brittle bones prone to fracture as a result of defects in the osteoclast. Our laboratory characterized the Ostm1 gene, which is responsible for the most severe form of osteopetrosis in both mice and humans. Through expression profiles of these Ostm1-deficient osteopetrotic mice, we isolated and characterized the lipid phosphatase, Inpp4b, as a negative regulator of osteoclastogenesis. Expressed in …  Read more

Developing new drug is a long and costly process: it takes on average more than ten years and costs over $2 billion to bring a drug to market. Drug development is a multi-disciplinary initiative involving not only chemistry and biology, but also pharmacology, toxicology, biophysics, computer and data science, to name a few. The development of artificial intelligence has nowadays lead to a revolution in many areas, and pharmaceutical industry is not an exception. The use of computational techniques to aid drug discovery started decades ago and participated in many aspects of drug discovery, such as proposing novel drugs by …  Read more

L'accélération du matériel à très grande vitesse (jusqu'à plusieurs km/s) est l'une des principales utilisations des explosifs à haute teneur. Ainsi, l'ampleur et les mécanismes du transfert d'énergie de la détonation des explosifs élevés (HE) à des matériaux mis en contact avec la charge sont essentiels dans les applications d'ingénierie. Lorsqu'un explosif hétérogène et non conventionnel est utilisé pour conduire du matériel, ou lorsqu’un matériel hétérogène est entraîné par des explosifs, les interactions multiphasiques à mésoéchelle et les mécanismes dissipatifs sont difficilement modélisés par des codes d'éléments finis et des outils analytiques.Les explosifs qui ont été fortement dilués avec du …  Read more

Les transformateurs modernes sont des dispositifs hautement efficaces. Cependant, un système de refroidissement efficace est essentiel dans les transformateurs de ce genre, car la dissipation ohmique même d'une petite fraction de la puissance électrique dans leurs enroulements et leur noyau peut entraîner des charges de chaleur importantes. Les objectifs de ce travail étaient les suivants: 1) proposer un modèle physique réduit et simplifié des systèmes de refroidissement des transformateurs à immersion à l’huile; 2) formuler des modèles mathématiques et des méthodes de solution numérique pour des prédictions rentables de l'écoulement de fluide et du transfert de chaleur stationnaire et transitoire …  Read more

Rodriguez, Rosario (Internal/Cosupervisor2)  Read more

Bartlett-Esquilant, Gillian (Supervisor1)  Read more

L'hormone prolactine (PRL), à travers l'activation de la voie de signalisation Jak2/Stat5, est un facteur essentiel de différenciation des cellules épithéliales mammaires, du développement de la glande mammaire et de la lactation. Le cancer du sein triple-négatif (TNBC) constitue environ 15% de tous les cas de cancer du sein. Ces tumeurs sont pauvrement différenciées et sont associées à des caractéristiques pathologiques agressives menant à des métastases, des récurrences ainsi qu'à des résultats décevants pour les patients. Dans la présente étude, nous avons examiné le rôle de la prolactine dans la voie de différenciation des tumeurs TNBC et ses applications potentielles …  Read more

The active form of Vitamin D (1α,25(OH)2D3; VD3) and the Vitamin D Receptor (VDR) are well known to regulate growth, development and survival in various cell types. However, to our knowledge, the role of VD3 and its receptor, VDR, has not been characterized during oocyte maturation and early embryo development. Therefore, this study aimed at evaluating the effect of VD3 supplementation and VDR attenuation during in vitro development of porcine embryos. Immunostained VDR protein wasobserved around the nuclear envelope of immature oocytes and in their surrounding cumulus cells (CCs). VDR mRNA expression in cumulus-oocyte complexes (COCs) was evaluated by qRT-PCR, …  Read more

Introduction: La dermatite de contact est une réaction inflammatoire secondaire à un contact direct ou aéroporté avec une molécule irritante ou sensibilisante. Elle est subdivisée en dermatite de contact allergique ou irritative. La dermatite de contact allergique est une réaction retardée de type 4 qui dépend d’une sensibilisation épicutanée préalable. Une réaction croisée peut avoir lieu quand deux allergènes de structure voisine se retrouvent dans des substances différentes. La dermatite de contact irritative est une réaction aiguë, non-immunologique causée par une cytotoxicité directe et qui peut affecter tout individu à des degrés divers. C’est la dermatite professionnelle la plus commune …  Read more

Pierre-Emmanuel Moyse (Supervisor1)  Read more

Cette dissertation est une étude du « rhythm-and blues » tel qu'il était interprété et reçu au Royaume-Uni entre 1960 et 1964, ainsi que des conditions et des événements qui ont précipité son arrivée. Plus particulièrement, « British R&B » analyse de la façon dont la catégorie « rhythm-and-blues » a été définie, débattue, et redéfinie au Royaume-Uni au cours de cette période. À l’aide d’outils théoriques offerts par la musicologie, la sociologie, la théorie critique de la race, et les études culturelles, cette dissertation traite de la consommation et de l'émulation de la musique « rhythm-and-blues » grâce à …  Read more

Emotion regulation (ER) and self-regulated learning (SRL) are crucial to learners' academic achievements. To date, little research has considered the dynamic relations between ER and SRL in elementary-aged children. To address this gap, we examined relations between ER, the four macro phases of SRL (task definition, planning/goal setting, enactment of learning strategies, monitoring/evaluation), and mathematics problem solving achievement in a sample of 134 elementary students from grades 3 through 6. Path analysis revealed that ER positively predicted all four phases of SRL. Task definition predicted enactment and monitoring/evaluation, while planning/goal setting positively predicted monitoring/evaluation. Analysis further revealed that task definition …  Read more

L’objectif de cette étude était d’investiguer l’effet de système de traite (systèmes de traite automatisée versus salle de traite et/ou « Lactoduc ») sur la production et la qualité du lait dans les troupeaux laitiers du Québec. La quantité de lait produite (kg par lactation), le lait corrigé, la matière grasse (kg) et la protéine (kg) ont été analysés en tant qu’indicateurs de production, tandis que le score de cellules somatiques moyen pour la lactation a été analysé comme un indicateur de qualité. Pour ce faire, nous avons analysé les données de 67,440 lactations, pour 48,018 animaux, provenant de 1 …  Read more

Sabok, Marcin (Internal/Supervisor)  Read more

Les élèves sont incontestablement des acteurs très importants dans le processus de scolarisation, et ils ne sont pas non plus des ardoises blanches. Même avant de commencer l'école, ils ont déjà acquis une richesse de connaissances, d'expériences et de nombreuses autres acquisitions inestimables (Skutnabb-Kangas, 1990; Riches, 2000). L'une de ces ressources précieuses acquises de leurs gardiens primaires est la langue, spécifiquement appelée par les linguistes la langue maternelle. Le rôle essentiel joué par la langue maternelle dans le processus d'apprentissage ne peut pas être surestimé (Garcia, 2009, Riches, 2000, Winer, 1982), car plus de 60 années de recherche dans le …  Read more

La place femmes dans l'antiquité n'a que récemment fait l'objet de l'attention des historiens. Négligées par les auteurs anciens qui préféraient se pencher sur les exploits des grands politiques et stratèges plutôt que sur les femmes les entourant, elles ne reçurent guère plus de considération de la part des modernes. Ce n'est qu'avec la montée des deuxièmes et troisièmes vagues de féminisme des années 70 et 80 que le rôle et la place des femmes dans l'antiquité devinrent des sujets à teneur académique. En concordance avec ce courant, la présente thèse propose une nouvelle perspective sur le rôle des femmes …  Read more

Channel coding enables reliable communication over unreliable, noisy channels: by encoding messages with redundancy, it is possible to decode the messages in such a way that errors introduced by the channel are corrected. Modern channel codes achieve very low error rates at long block lengths, but long blocks are often not acceptable for low-latency applications.While there exist short block codes with excellent error-correction performance when decoded optimally, designing practical, low-complexity decoding algorithms that can achieve close-to-optimal results for short codes is still an open problem. In this thesis, we explore an approach to decoding short block codes in which the …  Read more

La sensibilisation croissante aux produits alimentaires fonctionnels a été un défi pour l'industrie alimentaire au cours des dernières décennies. L'un des exemples est l'application d'huiles essentielles, en raison de leurs activités antioxydantes, antifongiques et antibactériennes visibles. Comme la plupart des espèces d'huile essentielle sont susceptibles de se dégrader ou de s'évaporer facilement, le développement de certaines techniques pour surmonter cet inconvénient est l’objet principal de cette étude. Les objectifs de cette étude ont porté sur l'évaluation du processus de microencapsulation des huiles essentielles d'origan (Origanum vulgare L.), de romarin (Rosmarinus officinalis L.) et de sauge (Salvia officinalis L.) par lyophilisation …  Read more

Background: Negative symptoms that include blunted affect, low motivation, social withdrawal and poverty of speech have long been recognized as the hallmark of schizophrenia spectrum and psychotic disorders. Up to 27% of first episode psychosis (FEP) and a larger portion of chronic patients show negative symptoms that are not the result of depression, positive symptoms such as delusions or hallucinations, or medication side effects (Hovington et al. 2012; Malla et al. 2002). Negative symptoms are highly associated with poor functioning, including the ability to engage independently in daily life activities and to have meaningful social relationships. As such, negative symptoms …  Read more