McGill University Theses and dissertations published in 2018

Prashant Keshavmurthy (Internal/Cosupervisor2)  Read more

This research project was designed to document, examine, and analyze the experiences of older adult musicians as they participated in a series of ensemble music improvisation sessions. One of the goals of the study was to synthesize and augment the following existing bodies of research: 1) current studies demonstrating improved quality of life for retired senior citizens who routinely participate in notation-based group music making; and 2) data supporting the theory that young people who engage in ensemble improvisation activities see significant improvements in their musical skills. To carry out this study, the researcher facilitated 12 weekly 90-minute music improvisation …  Read more

Hwang, Stephen W. (Supervisor2)  Read more

Habashi, Wagdi George (Internal/Supervisor)  Read more

Ultrafast coherent multi-dimensional spectroscopies are a powerful set of techniques used to unravel complex processes. These processes range from electronic coherences in molecular chromophores to many-body interactions in quantum-confined materials. Yet these spectroscopies remain challenging to implement at the high frequencies of vibrational and electronic transitions, thereby limiting their widespread use. The work herein demonstrates three significant methodological improvements of two-dimensional spectroscopy at optical frequencies, followed by applications of the method on two different systems. First, we introduce a hollow-fibre setup for the production of broadband visible pulses. This source is comparatively simple to operate, and yields stable, 45 μJ …  Read more

La maladie de Parkinson est la deuxième maladie neurodégénérative la plus fréquente après la maladie d'Alzheimer. Elle touche plus de 5 millions de personnes dans le monde, mais aucun traitement n'est encore disponible. Dans 5 à 10% des cas, la maladie de Parkinson est héritée de façon mendélienne. C'est grâce à l'étude de ses formes héréditaires que nous avions amélioré notre compréhension de la maladie.Les mutations dans les gènes PARK2 ou PINK1 sont les principales causes de la forme autosomique récessive du Parkinson. Les produits géniques, soit l'ubiquitine ligase E3 parkine et la kinase PINK1, sont des protéines neuroprotectrices qui …  Read more

Maloney, Alexander (Supervisor1)  Read more

L'objectif de développement durable 2 fait partie de l'engagement mondial d'éradiquer la faim. En vue de cet appel mondial, il y a un besoin pressant d'effectuer des mesures mondiales valides, utiles et compréhensibles. Il est nécessaire de prendre des mesures afin d'identifier les tendances mondiales, de mettre en place des mécanismes avertissant rapidement les privations, d'évaluer les interventions et de concevoir de nouvelles politiques. Dans le cadre du projet 'Voices of the Hungry' (VoH), FAO a développé une échelle dénommée 'L'échelle de mesure de l'insécurité alimentaire vécue' (FIES) permettant de mesurer la dimension d'accès de l'insécurité alimentaire. Il y a …  Read more

Targeting cancer cells at multiple signaling pathways has become the most common approach to sensitize them to chemotherapy. It is in this context that our laboratory developed the combi-targeting concept, that seeks to design molecules to modulate different targets. Here, to overcome resistance to both targeted and non-target therapies, we investigated two major strategies: a) enhancing the potency of a chemotherapeutic agent by combining a DNA damaging agent with a DNA repair inhibitor in a single agent, and b) targeting the DNA repair inhibitor to a receptor overexpressed in cancer cells. In the context of these strategies, we demonstrated the …  Read more

The phase field crystal (PFC) methodology models material solidification and other transformations through the evolution of an atomic density field driven by dissipative dynamics. PFC permits investigation of atomic scale processes on dissipative time scales. Building on past PFC methodology, we develop and characterize several new models of atomic scale material phase transformations that were not possible with previous PFC modelling approaches. This thesis makes several new contributions to PFC modelling. These are described below.First, we develop a model of magnetism in materials by extending previous models. This model couples the atomic scale PFC density field to a ferromagnetic order …  Read more

Flanagan, Tara (Internal/Supervisor)  Read more

Cette thèse examine la dynamique de la collaboration et de la réutilisation des connaissances dans les communautés d'innovation ouverte. Les communautés d'innovation facilitent l'échange des connaissances spécialisées et sont souvent citées comme le principal moteur de l'innovation collective. Or, la recherche actuelle sur les communautés ne met pas les pratiques de réutilisation des connaissances en avant, ni la façon par laquelle ces pratiques sont entre-nouées avec le mode de collaboration communautaire. En se basant sur la littérature de réseaux de connaissances d'une part et la littérature de communautés en ligne d'autre part, cette thèse étudie conjointement la création et la …  Read more

L’homéostasie et le maintien des tissus adultes dépend d’une régulation dynamique des cellules souches et des progéniteurs qui existent dans ces tissus. L'équilibre entre la prolifération et la différenciation, ainsi que les mécanismes par lesquels ces processus sont contrôlés dans les cellules souches sont encore mal compris. La prostate contient plusieurs populations de cellules souches et les progéniteurs ce qui lui donne un potentiel de régénération et de croissance important. Ces cellules sont également étroitement impliquées dans la formation de tumeurs et peuvent représenter autant les cellules d'origine du cancer et/ou la source de la résistance aux thérapies anti-cancéreuse. Afin …  Read more

Understanding the process by which a piece of data or information disseminates throughout a network is of great importance in many real world applications. Whether we are in charge of spreading the information or we are merely able to observe its traces, we need to model the process by which the diffusion occurs. In this thesis, we develop frameworks to model the information diffusion processes and propose multiple algorithms to both control and infer them.We first study how we can proactively control the process of diffusion of information among a set of mobile nodes in the absence of a physical …  Read more

Glioblastoma (GBM) is the most common malignant primary brain tumour with a dismal survival rate of approximately 15 months. Standard treatment includes immediate surgical resection with adjuvant chemo and radiation therapy. Patient death is attributed to the near inevitable recurrence of the tumour due to the ineffective targeting of cancer cells by all current therapies. This is thought to be due to a specific subset of tumour cells that remain after treatment called cancer stem-like cells or brain tumour initiating cells (BTICs). These cells share many properties with adult neural stem cells such as self-renewal potential and the capacity for …  Read more

Abū Ḥāmid al-Ghazzālī (1055-1111) and Rabai Mosheh ben Maimun (1138-1204), better known in English as Maimonides, share the same religiously motivated concern towards scriptural exegesis: How one ought to interpret the divine (or divinely inspired) texts when a literal reading of the passages is at odds with one's reasoning. Since they consider the intellect (al-ʿaql) to be divinely endowed as well, al-Ghazzālī and Maimonides take it upon themselves to reconcile the belief in the authority of the revealed text(s) with what each author understands by independent intellectual reasoning. Their goal is to balance the limits of faithful belief in the …  Read more

This research is an exploration of the experiences of six Arab-Canadians learning LA (Literary Arabic) as a heritage language in Montreal. Four of the six participants are Canadian born and two were born in France. All six participants are undergraduate university students, aged 21 to 24. Two semi-structured interviews were conducted with each of the participants. Results of the study indicate that the participants who were able to maintain their spoken vernacular of Arabic in addition to developing literacy in the language are those who had their parents' support as well as themselves making efforts to keep both forms of …  Read more

As the world population continues to rise there is an increased movement of people to urban areas and a greater disconnect from rural life. Children living in urban centers may lack the opportunities to learn about agriculture, which affects their daily lives. Studies on elementary aged children's knowledge and understanding of agriculture demonstrate that children have a low level of agriculture literacy. Interestingly though, many of these same studies show that a great deal of children's information on agriculture is acquired outside of school. Consequently, many education researchers have advocated for the incorporation of informal (out-of-school) learning opportunities in agriculture …  Read more

Les matériaux auxétiques ont tendance à augmenter de taille dans le plan normal à la déformation appliquée, affichant ainsi un coefficient de Poisson négatif. Si une déformation élastique est appliquée à un élastomère monolithique auxétique puis retirée, le matériau revient à sa forme et sa taille originales. Pour un Bistable Auxetic Metamaterial (BAM) constitué d'une architecture d’élastomère monolithique à charnières par points, il existe un deuxième état d'équilibre du matériau qui conserve sa position même lorsque la déformation élastique est enlevée. Cet état de bi-stabilité dans le BAM permet un changement répétable entre deux états stables. Cependant, si le BAM …  Read more

Les aérosols organiques sont des composantes importantes de l'atmosphère qui influencent le climat de manière directe et indirecte ainsi que la qualité de l'air et la santé humaine. Une compréhension de la formation et de l'évolution des aérosols est alors une tâche importante afin de mieux connaître ses impacts. Une portion majeure de la masse d'aérosols présente dans l'atmosphère est de nature secondaire, formant lorsque des composés organiques volatiles, en état gazeux, subissent de l'oxydation pour former des produits de volatilité inférieure qui condensent alors à la phase particulaire (c'est-à-dire liquide ou solide) de l'aérosol. Cette thèse de recherche se …  Read more

Souza, Raphael de (Internal/Cosupervisor2)  Read more

This dissertation takes the artwork of Ree Morton (1936 – 1977) as a case study to investigate the significance of women making installation art in the United States in the 1970s. Since the 1980s, academics and institutions have foregrounded and prioritized the legacies of male artists in narratives of installation art. In reproducing these gender-biased histories many women installation artists and the wider impact of gender and feminist politics in the emergence of installation art histories have been overlooked. This study examines Morton’s practice within the proposition of “feminist installation art” between 1968 and 1977 to argue that her and …  Read more

Heath, Nancy Lee (Supervisor1)  Read more

The human papillomavirus (HPV) is the cause of several oral and genital cancers with potentially high morbidity and mortality. Vaccines that target the oncogenic strains of HPV have been developed and licensed in Canada for girls (since 2007) and boys (since 2010). These vaccines have been proven to be safe and efficacious and have been identified as a new frontier in cancer prevention. Achieving vaccine coverage targets is important for protecting individuals as well as the health of the general population. To support HPV-related cancer prevention, all Canadian provinces and territories have now implemented universal vaccination programs. However, problematically, school-based …  Read more

Vaccines are estimated to prevent 2.5 million deaths each year. As with any public health intervention, vaccines progress through many stages of development and their evaluation must continue post-licensure. We have used case studies to highlight four key aspects of the lifecycle of vaccines: i) preclinical evaluation, ii) clinical development, iii) safety and iv) long-term effectiveness. Preclinical evaluation - We have demonstrated, for the first time, cellular immune responses to a candidate norovirus virus-like particle vaccine produced in Nicotiana benthamiana (Medicago Inc., Ste-Foy, QC). Both oral and intramuscular formulations of the vaccine elicited a proliferative response and IFNγ-producing cells in …  Read more

The development of an embryo requires the interplay of signaling molecules and transcriptional regulators during lineage specification. This is particularly true during the commitment and differentiation of the caudal mesoderm which gives rise to a complex set of tissues and organs including the tailbud, kidneys, muscles and somites.We first developed a novel primary co-culture system to study and follow differentiation of caudal mesoderm progenitors (Chapter 2). Using this powerful assay, we identified a unique population of mesodermal progenitors in the tailbud whose identity is maintained and regulated by Bmp4 signaling. Inhibiting Bmp4 in these progenitors resulted in abberant differentiation of …  Read more

Montreuil, Tina (Internal/Cosupervisor2)  Read more

An approximation of the Hessian matrix is developed and used to accelerate the convergence of an adjoint-based aerodynamic shape optimization framework. Exact analytical formulations of the direct-direct, adjoint-direct, adjoint-adjoint, and direct-adjoint Hessian approaches are presented and the equivalence between the adjoint-adjoint and direct-adjoint formulations is demonstrated. An approximation of the Hessian is obtained from the analytical formulation by partially solving first-order sensitivities to reduce computational time, while neglecting second-order sensitivities to ease implementation. Error bounds on the resulting approximation are presented for the first-order sensitivities through perturbation analysis and eigenvalue analysis. The proposed method is first assessed using an inverse …  Read more

L'engrais est un intrant agricole important nécessaire pour atteindre des rendements élevés. La détermination d'un taux optimal d'application d'engrais implique diverses conditions spatiales (conditions du sol et du paysage) et temporelles (conditions météorologiques et prix). Les contrôles spatiaux et temporels nécessitent la détermination de la gamme optimale d'engrais basée sur des facteurs tels que la gestion passée, les caractéristiques du sol, la rotation des cultures, les conditions météorologiques (historiques, actuelles et prévisionnelles), les prix des matières premières, le coût et l'accessibilité. Dans tous les contextes de production, la réponse des cultures à la fertilisation est incertaine en raison de nombreux …  Read more

Cryptococcus neoformans, la principale cause de la cryptococcose humaine, est une levure encapsulée répartie de façon omniprésente dans l'environnement. Chez les individus atteints d'une réponse immunitaire défectueuse, la réplication incontrôlée de C. neoformans dans le poumon peut entraîner la dissémination dans d'autres parties du corps avec un tropisme pour le cerveau. Des facteurs génétiques encore non-caractérisés pourraient jouer un rôle important dans la détermination de la susceptibilité à une infection progressive. Le but général de ce projet de doctorat était de disséquer les aspects génétiques et immunologiques de la susceptibilité de l'hôte à C. neoformans en appliquant des méthodes d’investigations …  Read more

Lariviere, Vincent (Supervisor2)  Read more

Dans ce travail, nous régularisons des champs libres Gaussiens basés sur l'expansion de Fourier-Besse pour étendre une partie des résultats sur la mesure de gravité quantique de Liouville et la relation KPZ en dimensions [1,2] et même en dimensions impaires. Nous adoptons la définition du champ libre Gaussien sur ℝⁿ considéré comme un espace de Wiener abstrait avec l'espace de Hilbert sous-jacent H^(n/2)(ℝⁿ). En particulier, nous pouvons montrer que la mesure de la gravité quantique de Liouville sur ℝ³ est la limite faible des mesures associées à une série pondérée de moyennes sphériques du champ libre gaussien. Nous montrons aussi …  Read more

La ségrégation ordonnée des chromosomes lors de la mitose nécessite la formation correcte d'un fuseau mitotique ainsi que son bon positionnement dans le plan de la division cellulaire. Le dérèglement de l'une de ces conditions engendre des conséquences sévères telles que la mort cellulaire, ou encore le cancer chez les eucaryotes supérieurs. L'organisation et le positionnement du fuseau mitotique sont principalement associés à la fonction des microtubules. Les microtubules émanent de centres organisateurs de microtubules (COMT). Ils sont initialement nucléés par un complexe protéique conservé au cours de l'évolution appelé l'anneau de gamma-tubuline. Connu pour sa fonction de nucléateur, ce …  Read more

Nicole Yee Key Li (Internal/Cosupervisor2)  Read more

Tufenkji, Nathalie (Internal/Cosupervisor2)  Read more

Ells, Carolyn (Internal/Cosupervisor2)  Read more

Les granites de type-A sont enrichis en éléments à champ électrostatique élevé (HFSE), tels que le Zr, le Nb et les terres rares (REE). Toutefois, les processus magmatiques qui contrôlent l’enrichissement inhabituel restent largement débattus. Le pluton de Strange Lake (1.24 Ga) dans la ‘Core Zone’ Paléoprotérozoïque de Québec-Labrador, fournit un exemple d'enrichissement extrême en HFSE dans un granite peralcalin de type-A. Dans cette étude, des échantillons non altérés provenant du centre du pluton ont été analysés pour leur composition en roche totale et minéralogique. Le granite hypersolvus contient un feldspath alcalin perthitique comme phase majeure précoce et une amphibole …  Read more

This project is about structural data analysis on musical scores. From a structural point of view, a score is a data object in which multi-dimensional internal relations participate in abstract musical design. The purpose of a structural analysis is to describe aspects of the shape of a score. Treating the score initially as a low-dimensional, discrete Cartesian system, we build higher-dimensional structure, increasing the quantity and dimensionality of available information about the internal relations within the score. Since there are many ways of finding structure, structural score analysis is framed as an open, descriptive exploration. Three particular constructions are described, …  Read more

Carmichael, Jason (Supervisor2)  Read more

Paternal epigenetic inheritance has been described in human cohorts and animal models ranging from worm to mouse. Chemical or nutritional challenge during key developmental time points have been correlated with physiological change in future offspring that oftentimes span multiple generations. Despite these observations, the underlying molecular mechanisms of non-genetic (epigenetic) inheritance remain unknown. Recent studies have shown that sperm histones are retained at genomic regions high in CpG. Specifically, activating histone marks, such as histone H3 lysine 4 di-methylation (H3K4me2) and H3 lysine 4 tri-methylation (H3K4me3), are retained at promoters of genes with functional roles in embryonic development. Therefore, we …  Read more

Matthew Adam Dobbs (Supervisor1)  Read more

Cette thèse se penche sur plusieurs aspects du produit scalaire de Petersson des fonctions thêta associées aux corps quadratiques imaginaires. Dans la première partie, on donner ades formules explicites pour le produit scalaire de Petersson des fonctions thêta associées à une famille de charactères de Hecke. Ces formules serviront ensuite à trouver des formules pour le produit scalaire des fonctions thêta associées à des idéaux fractionaires. On verra ensuite comment ces formules permettent de généraliser une remarque faite par Stark à propos d'une relation entre le produit scalaire de Petersson des fonctions thêta et la valeur en s = 1 …  Read more

Cette thèse examine la faillite et l'emprisonnement pour dette au Québec et au Canada lors du XIXe siècle. Elle déemontre que l'État, par le processus de faillite, essayait d'effectuer la réglementation économique. Elle explore la définition de l'État du XIXe siècle en démontrant que l'État, par le processus de faillite, tentait d'effectuer une règlementation économique. Cet effort de bâtir la capacité règlementaire de l'État s'est produite dans un contexte où s'entame également des changements à la définition de l'individu face à l'État et le pouvoir grandissant du libéralisme. Cette thèse situe l'emprisonnement pour dette dans la modernité. En utilisant des …  Read more

Dans le contexte de l’asthme allergique, il est bien connu que la signalisation par les récepteurs cysteinyl leucotriènes 1 et 2 (CysLTR1 et 2) induit la bronchoconstriction, la perméabilité vasculaire, l’œdème pulmonaire, la sécrétion et élimination de mucus ainsi que l’hyperplasie des muscles lisses des voies aériennes. Cependant, il existe peu d’informations concernant les rôles du recepteur CysLTR1 et 2 dans l’asthme irritant. Dans ce projet, nous avons approfondi des résultats antérieurs suggérant que CysLTR1 a un rôle protecteur dans une modèle murin de l’asthme irritant provoqué par l’exposition aiguë au chlore. Notre but premier était de confirmer les résultats …  Read more

Introduction: Diabetic nephropathy is the leading cause of chronic kidney disease and end stage renal disease in most industrialized countries and increasingly so in countries with transition economies. While major successes in the treatment of diabetic nephropathy have been obtained, a proportion of type 2 diabetic patients continues to progress along the path of renal disease despite receiving evidence-based recommended medications for the management of their diabetic nephropathy. This phenomenon is characteristic of renal non-response and is associated with unmet renal needs. We hypothesize that patients presenting evidence of renal non-response can be genetically distinguished from patients presenting evidence of …  Read more

La résistance aux médicaments et l'échec du traitement chez Plasmodium falciparum ont tourmenté la communauté mondiale pendant des décennies et tandis que certains progrès ont été réalisés pour élucider les fondements du phénotype résistant depuis la découverte de PfCRT, le principal déterminant de la résistance à chloroquine (CQ), notre laboratoire a ajouté un autre élément au mystère. Le CQ induit la formation de compartiments contenant de l'hémozoïne (Hz) dans le cytosol du parasite du stade trophozoïte d'une manière dépendante de la concentration chez les parasites sensibles au CQ (CQS) mais pas chez les parasites résistants au CQ (CQR) dans les …  Read more

Natalie Stoljar (Internal/Supervisor)  Read more

Multiple sequence alignment is a prerequisite for most evolutionary and phylogenetic analyses. Previous work has shown that existing alignment algorithms are not perfectly accurate, and therefore it is important to identify suspicious regions in whole-genome alignments. In this thesis, we develop a machine learning model that can detect errors in an alignment. The model is trained on data that is obtained by comparing a true alignment file (generated using an alignment simulation tool) with a predicted alignment file (generated using an alignment algorithm). Using the developed method, the sequences from each pair of species at each alignment column can be …  Read more

Gruenheid, Samantha (Internal/Supervisor)  Read more

A novel method for feedback control design without a system model is presented in thisthesis. The new method is used to construct a fully adaptive nonlinear controller fora synchronous generator system. The aim of the controller is to achieve tracking of agiven reference output trajectory. The system studied is a single-input single-output differentially flat system. The exact nonlinear tracking control law is constructed ex-ploiting flatness. The approach employs a local fourth order LTI model structure that adapts overtime to best fit the measured output trajectory of the nonlinear system. The locallyfitted LTI system is then combined with a moving window …  Read more