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2020 — The role of estrogen-related receptor alpha (ERRα) in intestinal homeostasis and inflammatory bowel diseasesAbstract
Tremblay, Michel (Internal/Supervisor) Read more
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2020 — Low-dimensional semiconductor heterostructures and device applications in optoelectronics and renewable energyAbstract
Szkopek, Thomas (Supervisor1) Read more
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2020 — Assessing the effectiveness of proton pump inhibitors in idiopathic pulmonary fibrosisAbstract
La fibrose pulmonaire idiopathique (FPI) est une maladie évolutive rare associée à un pronostic sombre. Durant la dernière décennie, grâce à la recherche sur des traitements potentiels, deux médicaments, soit le nintedanib et la pirfénidone, sont maintenant approuvés pour traiter la FPI d’intensité faible à modérée. Malgré ces avancées, la recherche d’autres options de traitement de la FPI efficaces et abordables est donc loin d’être terminée. Les directives cliniques de traitement de la FPI recommandent maintenant conditionnellement un traitement antiacide, principalement par des inhibiteurs de la pompe à protons (IPP), qu’il y ait ou non reflux gastro-œsophagien. Cependant, les données … Read more
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2020 — Oculomotor and vestibulo-ocular function post-concussion in children and adolescentsAbstract
Objective: The objectives of this study were (1) to document oculomotor (OM) and vestibulo-ocular (VO) function in children who sustained a concussion and were symptomatic at the time of assessment, and to compare them to that of children with prior concussion who were clinically recovered (asymptomatic) and of uninjured children, and (2) to document the extent to which OM and VO function relate to post-concussion symptom severity in children with symptomatic and asymptomatic concussion. Study Design: A prospective cross-sectional study that included 108 symptomatic/clinically recovered pediatric patients with concussion and 79 healthy youth, between 9 and 18 years of age. … Read more
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2020 — Novel ozonation treatment to enhance anaerobic digestion of WAS: scale-up challenges and sanitary potentialAbstract
Lemay, Jean-François (Supervisor2) Read more
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2020 — An investigation into the quality of clinical practice guidelines, the developers who produced them, and an inside look into the guideline development process of regulatory bodiesAbstract
Des décisions cliniques sont prises dans divers milieux de soins de la santé tous les jours. Contrairement aux manuels de procédures qui offrent des instructions concises sur les dépistages diagnostiques, les interventions appropriées, la durée du traitement et les processus approuvés, les guides de pratique clinique (GPC) fournissent des recommandations qui servent à informer les décisions du clinicien. Bien qu'il s’agisse d’une ressource utile pour les professionnels de la santé mentale et des services sociaux, la valeur et l’utilité des GPCs sont dépendantes de leur qualité. En médecine, l’évaluation de la qualité des GPC est courante alors que ces efforts … Read more
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2020 — The association between prehabilitation and oncologic outcomes in patients undergoing curative-intent surgery for colorectal cancerAbstract
Schwartzman, Kevin (Supervisor1) Read more
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2020 — Benefits of physical exercise on cognitive, white matter, and endothelial dysfunctions in mouse models of vascular cognitive impairment and dementiaAbstract
The two most common forms of dementia, vascular cognitive impairment and dementia (VCID) and Alzheimer's disease (AD), display substantial similarities with regards to their cerebrovascular pathology and they share cardiovascular risk factors as predictors of future cognitive decline. These commonalities suggest that it may be possible to prevent, alleviate and potentially treat both forms of dementia by targeting the cerebrovasculature. Presented in this thesis are findings pertaining to how the pleiotropic effects of the anti-cholesterol drug simvastatin (SV) and, regular, moderate levels of aerobic physical exercise (EX) can prevent VCID. While investigating the commonalities between these two treatment approaches, we … Read more
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2020 — Role of Human Antigen R (HuR) in Lung Fibroblast Differentiation: Implications for Idiopathic Pulmonary FibrosisAbstract
Azuelos, Ilan (Internal/Cosupervisor2) Read more
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2020 — App attrition in computer-assisted language learning: focus on duolingofocus on duolingoAbstract
Sarkar, Mekhala (Internal/Supervisor) Read more
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2020 — Highly homogeneously structured lithium-ion storage electrodes via electrophoretic depositionAbstract
L’amélioration des performances electrochimiques des batteries Li-ion est déterminante pour l’atteinte des objectifs de développement durable établis par la communauté scientifique. Parmi les mesures prises en ce sens est la miniaturisation des matières électrochimiquement actives vers les dimensions nanométriques. Cependant, l’utilisation des nanotechnologies amène de nouveaux défis à l’étape de l’enduction lors de la fabrication des électrodes destinées aux batteries Li-ion; l’enduction n’est pas adaptée aux matériaux nanométriques et bidimensionnels puisque qu’elle introduit des problématiques liées à la rhéologie. Ainsi, ce projet a comme objectif d’évaluer et de concevoir une technique d’enduction alternative utilisant les principes de la déposition électrophorétique … Read more
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2020 — Design and optimization of a liquid biopsy collector for ovarian and endometrial cancer screeningAbstract
Mongrain, Rosaire (Supervisor1) Read more
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2020 — Theoretical astronomy in the early modern Ottoman empire: Ali al-Qushji's «Al-Risala al-Fathiyya»Abstract
This dissertation aims to demonstrate the importance of Al-Risāla al-Fatḥiyya (The Treatise of Conquest) in the history of theoretical astronomy (ʿilm al-hayʾa) in Islamic societies, especially in the Ottoman context. It was written by ʿAlī al-Qūshjī (d. 879/1474), one of the eminent scholars of his period, and dedicated to the Ottoman Sultan Meḥmed II to honor his victory over the Āq Qoyūnlū ruler Uzun Ḥasan in the Otlukbeli War in 878/1473. Originally from Samarqand, Qūshjī was trained by leading Timurid scholars, and became a prominent member of the Samarqand observatory and madrasa, two prestigious institutions built by Ulugh Beg, the … Read more
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2020 — Subtypes of functional connectivity in autismAbstract
Pierre Bellec (Supervisor2) Read more
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2020 — Identification of claudin-8 interaction partners during neural tube closureAbstract
Les claudines (Cldn) sont une famille de protéines transmembranaires impliquées dans les jonctions serrées. Certains membres de la famille des claudines jouent un rôle important dans la fermeture du tube neural. La suppression de la Cldn4 et de la Cldn8 de l'ectoderme neural d'embryons de poulet a provoqué des anomalies de fermeture du tube neural (AFTN) dues à une défaillance lors de l'extension convergente et de la constriction apicale. La localisation des protéines à la surface de la cellule apicale de l'ectoderme neural a été perturbée chez des embryons pour lesquels les Cldn4 et Cldn8 ont été déplétés. La suppression … Read more
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2020 — Chronic viral infection impacts cell fate decisions in the thymusAbstract
Le thymus est un organe lymphoïde primaire avec une organisation distincte pour fournir des signaux pour la génération d’un répertoire de cellules T fonctionnel et auto-tolérant. Les stress environnementaux, tels que les infections, peuvent entraîner une involution thymique, qui est marquée par une diminution de la masse tissulaire et des changements dans l’architecture thymique. Cependant, l’impact des infections virales chroniques sur le développement des thymocytes reste mal connu. Ici, nous montrons qu’en plus de l’involution thymique, une infection virale chronique (LCMV Clone (Cl) 13), mais pas une infection aiguë (LCMV Armstrong), cause un bloc développemental au stage double négatif (DN) … Read more
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2020 — Climatizing empire: race, landscape, and colonial nationalism in NewfoundlandAbstract
Mellin, Robert (Supervisor1) Read more
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2020 — A garden of unplanted species: Andrew Dadson's countervisuality of weedsAbstract
Weeds are ever-present within our natural and urban environments: growing through the cracks in the pavement, accompanying our gardens, and carpeting human-induced dereliction. Humans often, socially and linguistically, refer to them as a nuisance, but what if we instead viewed them as resilient, dynamic contributors to the sustainability of our planet, especially as we endure the increasingly severe environmental crisis? Negating these discriminating modes of visuality, this thesis argues that Vancouver artist Andrew Dadson’s 2019 series of photographs is a countervisuality through strategies of reportage, gentle earth interventions and high-resolution photography. With reference to the work of scholars working to … Read more
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2020 — Behavioral and Electrophysiological Correlates of Induced (Dys)fluency Conditions in Adults Who StutterAbstract
Baum, Shari (Supervisor2) Read more
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2020 — Assessing flexibility in shoaling and learning in the Trinidadian guppyAbstract
Reader, Simon (Supervisor1) Read more
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2020 — The unproductive image: film and the interruption of workAbstract
Cet essai examine les liens entre le travail, la productivité capitaliste et le cinéma. Alors que les études cinématographiques ont déjà souligné le rôle du cinéma comme outil de propagande des idéologies capitalistes de productivité, cette thèse utilise les écrits méconnus sur le cinéma de Jean-François Lyotard pour suggérer que le médium peut aussi s’opposer à l’éthique de travail capitaliste. En présentant les concepts d’« acinéma » et de « film souverain » de Lyotard, ce texte trace une constellation de scènes qui représentent une interruption du labeur et une contestation du discours disciplinaire qui force les travailleurs à travailler. … Read more
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2020 — Temporal credit assignment via traces in reinforcement learningAbstract
L’apprentissage par renforcement est un cadre pour la prise de décision séquentielle qui est largement utilisé dans de nombreux domaines tels que la robotique et la conduite autonome. En raison de la nature séquentielle de l’apprentissage par renforcement, attribuer le crédit aux actions prises dans le passé est un problème compliqué. Ce problème est connu sous le nom d’affectation temporelle de crédits et est au coeur de nombreuses méthodes telles que les options ou l’apprentissage en ligne. Une mauvaise attribution du credit temporelle peut avoir multiple conséquence dans l’apprentissage par renforcement comme de la variance élevée dans les estimations de … Read more
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2020 — A physically-informed prioritized beam tracerAbstract
Scavone, Gary (Supervisor1) Read more
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2020 — Automatic goal-conditioned reinforcement learning using learned distances and automatic curriculum generationAbstract
L'apprentissage de représentations pour l'apprentissage par renforcement est aujourd'hui une question ouverte. Certaines méthodes ont développé une variété d'objectifs pour l'apprentissage de représentations satisfaisant certaines propriétés désirées. Dans cette thèse, nous proposons une approche visant à apprendre des structures utilisables par l'apprentissage par renforcement conditionné par un but. Nous apprenons un espace de structures ayant la propriété que la distance entre les états de l'espace de structures est proportionnelle à la racine carrée du temps de trajet moyen entre ces états, en suivant une stratégie fixe.\cite{Fouss:2005:NWC:1092358.1092536} montre l'existence de cet espace de structures et sa connexion au Laplace non normalisé. … Read more
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2020 — A tensor framework for multi-domain communication systemsAbstract
The demand for mobile data is likely to grow at a pace more than envisaged in the coming years. Further, as applications such as the internet of things (IoT) come to fruition, there will be increased diversity in the types of devices demanding internet connectivity and their requirements. Significant increase in data rate requirements are also expected due to sensitive services such as Ultra High Definition (UHD) video streaming and cloud computing. To meet all these demands, physical layer waveform candidates for future generations of communications need to be robust and inherently capable of extending into multiple domains (space, time, … Read more
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2020 — Robust adversarial inverse reinforcement learning with temporally extended actionsAbstract
L'ingénierie explicite des fonctions de récompense pour des environnements donnés a été un obstacle majeur pour les méthodes d'apprentissage par renforcement. Bien que l'apprentissage par renforcement inverse représente une solution pour récupérer les fonctions de récompense uniquement à partir de démonstrations, ces récompenses apprises sont généralement fortement intriquées avec la dynamique de l'environnement et donc non portables ou robustes dans des environnements dont les dynamiques sont changées. Les méthodes adversariales modernes ont réussi à réduire l'intrication des récompenses, mais seulement pour une seule politique. Les options fournissent un cadre pour obtenir une meilleure généralisation des récompenses en décomposant les problèmes … Read more
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2020 — Fornix stimulation, effects on hippocampal oscillations and memory in an AD mice modelAbstract
Episodic memory depends on the integrity of the hippocampus and structures with which it connects. Episodic memory is known to decline with age, but even more so in progressive dementias such as Alzheimer’s disease (AD). Problems with episodic memory generally follow the course of damage to the memory circuit in AD, with early changes appearing in the hippocampus, a structure that is common across species. Despite all efforts, there are currently no treatments that stop or reverse disease progression in AD patients. Stimulation of the fornix, a major pathway connecting the hippocampus with other essential memory areas, such as the … Read more
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2020 — Airway obstruction in Robin sequence: Evaluating longitudinal evolutionAbstract
Cote, Aurore (Supervisor1) Read more
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2020 — The role of the GAP protein, TBC-7, in the AMPK-mediated regulation of germline integrity in the «C. elegans» dauer larvaAbstract
Le développement de C. elegans contient un état de repos alternative appelé stade dauer en réponse à des conditions sous-optimales. À ce stade, la larve subit plusieurs changements pour résister au stress environnemental. L'un de ces changements se produit dans la lignée germinale, où les cellules souches de la lignée germinale (GSC) arrêtent leur cycle cellulaire jusqu'à la sortie du stade dauer. Des études antérieures ont identifié un mutant nul de la sous-unité catalytique AMPK/aak(0) comme étant essentielle pour établir ce cycle de repos cellulaire et pour modérer l'expression des gènes à travers la petite voie d'ARN. La perte de … Read more
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2020 — The development of ignition resistant magnesium alloys via strontium and calcium alloyingAbstract
The search for obtaining a competitive edge in the aerospace industry is pushing the boundaries of the commonly used materials for aircraft construction. Mg has not been used due to the perceived fire risk that this metal possesses, however, its low density (1.7 g/cm3) represents an asset that should not be underestimated. As an example, if only the aluminum components in the passenger seats of an Airbus A380 were replaced by Mg (540 seats approximately), more than 5000 kilograms could be reduced from the plane weight. This potential has led the aircraft companies and Mg producers to work with the … Read more
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2020 — Insights into the function of ataxin-3 via CRISPR gene knockoutAbstract
L'ataxie spinocérébelleuse de type 3 est la forme la plus fréquente d’ataxie au monde. C’est une maladie neurodégénérative héréditaire rare, caractérisée par une expansion anormale du triplet de nucléotides CAG dans le gène ATXN3. Cette répétition se traduit par la présence d’une expansion polyglutaminique dans la protéine ataxine-3, entraînant la formation d’agrégats insolubles de la protéine anormale, qui s’accumulent dans les neurones. La nature neuroprotectrice ou toxique de ces agrégats reste à ce jour non déterminée. Dans sa forme normale, la protéine ataxine-3 interagit avec de nombreuses autres protéines, et est associée à différents mécanismes cellulaires telles que la voie … Read more
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2020 — Regulation of retinal polarity by the endocytic adaptor protein Numb through the Crb1 complexAbstract
La polarité neuronale est un attribut essentiel pour le fonctionnement et le maintien du système nerveux. Dans la rétine de mammifère, la perte de polarité mène à la perturbation de son architecture bien établi, pouvant être observé par l’apparition de rosettes dans la couche nucléaire externe. Cette perturbation devient la cause de la dégénérescence des photorécepteurs, et souvent, la perte de vision. Chez les humains, des mutations dans le gène de polarité CRUMBS homologue 1 est la cause de plusieurs maladies rétiniennes tel que la rétinite pigmentaire et l’Amaurose congénitale de Leber. Malheureusement, nous ne savons toujours pas comment ce … Read more
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2020 — A little hero: Queer writing of Valeriy PecheykinAbstract
Aujourd’hui la Russie est connue comme l’un des pouvoirs politiques les plusimportants du monde où, néanmoins, les droits humains sont violés et négligés dans lequotidien. C’est particulièrement pertinent quand aux droits des personnes LGBTQI+,surtout après que la loi infâme contre la « propagande de relations sexuelles nontraditionnelles» a été passée en 2013, et après l’alarmante découverte des purges anti-gaien Tchétchénie en 2017. Dans cette situation, il est donc urgent de prêter attention auxvoix de personnes queer de la Russie, qui s’élèvent malgré tout.Cette recherche se concentre sur les oeuvres du dramaturge russe contemporainValeriy Petcheykine (né en 1984). Ce dernier, qui … Read more
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2020 — Regulation of T cell activation by thousand-and-one amino acid kinase 3Abstract
Tremblay, Michel (Supervisor1) Read more
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2020 — The refugee and the crisis of lawAbstract
The hostility -comprised in a series of anti-immigration politics- that European governments display towards refugees, migrants, asylum seekers reaching the borders of Europe and the concomitant problems that these people are facing in claiming and exercising their rights poses an enigma before us. The frequency of the cases where people are ‘left to die’ in the Mediterranean and the number of derogations from non derogable rules such as the right to life, disallows us from consider those events as aberrant and thus exceptional. Despite the expansion of human rights norms in the WWII period, the equation of refugees with ‘rightless’ … Read more
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2020 — Atomistic modelling of gas hydrate mechanical and vibrational propertiesAbstract
Rey, Alejandro D. (Supervisor1) Read more
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2020 — Data-driven network models to characterize the distribution and spread of tau in the Alzheimer’s disease brainAbstract
Alzheimer's disease (AD) is a common and debilitating late-life illness comprising progressive brain damage and slow deterioration of cognitive and functional abilities. The primary neuropathological signature of AD involves accumulation of the beta-amyloid (A-beta) and tau proteins into cortical plaques and tangles. While A-beta plaques present diffusely throughout the brain before AD symptoms manifest, fibrillar tau pathology is initially distributed in a very specific part of the brain. As AD symptoms evolve, tau pathology advances through the cerebral cortex in a specific and highly reproducible pattern, perhaps driven by the brain's intrinsic architecture of neuronal connectivity. Most of what we … Read more
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2020 — Mechanisms of adhesion and invadopodia regulation during breast cancer metastasisAbstract
Brown, Claire (Supervisor2) Read more
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2020 — Foot-based haptic interfaces for numeric information delivery and dance learningAbstract
La capacité des humains à percevoir leur environnement par le toucher est exceptionnelle; ils perçoivent les variations de pression, de texture et de force grâce à une panoplie de récepteurs sensoriels. Les interfaces haptiques exploitent cette capacité et utilisent la peau comme canal de communication. Dans l’éventail d’emplacements possibles, les pieds offrent un site discret pour la communication par l’haptique. Grâce à la richesse de leurs récepteurs sensoriels et à leur rôle dans la locomotion, ils peuvent être utilisés comme lieu de présentation d’informations sémantiques, ou pour la transmission de signaux de guidage dans un contexte d’activité physique. Plusieurs interfaces … Read more
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2020 — The efficacy of angiotensin converting enzyme inhibitors and angiotensin receptor blockers in men and women with heart failure with reduced ejection fractionAbstract
Background. Angiotensin converting enzyme inhibitors (ACEi) and angiotensin receptor blockers (ARB) are essential to the treatment of heart failure with reduced ejection fraction (HFrEF). However, little data are available to determine whether their efficacy in reducing hospitalizations and mortality may differ between men and women with HFrEF.Purpose. To explore whether differences exist in the efficacy of ACEi/ARBs in HFrEF by sex.Methods. We conducted a pooled analysis of individual data from 4 randomized clinical trials: The Study of Left Ventricular Dysfunction (SOLVD) Treatment, SOLVD Prevention, Candesartan in Heart Failure: Assessment of Morbidity and Mortality (CHARM) Alternative and Added trials. The primary … Read more
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2020 — The history and geography of beeswax extraction in the northern Maya lowlands, 1540-1700Abstract
Beeswax harvesting emerged in the northern Maya lowlands (or Yucatán Peninsula) during the mid-sixteenth century, in the wake of Spanish conquest and colonization. Lowland Mayas had long-since been collecting honey from local species of stingless honeybee—especially the domestically-kept Melipona beecheii—but their wax had few uses in the region. For Spaniards in the newly founded province of Yucatán, however, the northern lowlands’ seemingly abundant sources of domestic and wild beeswax presented a significant commercial opportunity, and by mid-century it had become a core component of the region’s economy and the province’s second most important export (after cotton textiles). This dissertation explores … Read more
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2020 — Modified clays as effective soil amendment to reduce leaching of perfluoroalkyl and polyfluoroalkyl substances from contaminated soilsAbstract
Les rejets répétés de mousses filmogènes aqueuses (AFFF) dans des zones d'entraînement désignées pour la lutte contre les incendies au cours de plusieurs décennies sont étroitement liés à la grave contamination des sols et des eaux souterraines par des substances perfluorées et polyfluoroalkyles (PFAS). Des réglementations de plus en plus strictes exigent des mesures d'atténuation et des technologies de traitement permettant de contrôler efficacement la propagation des PFAS ou de nettoyer les sites touchés. Un large éventail de technologies de traitement a été mis au point pour traiter l’eau contaminée, alors que peu se sont concentrées sur les technologies de … Read more
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2020 — Determining a safe way to increase physical activity in childrenAbstract
Contexte: De nombreux enfants réalisent une activité physique régulière en participant à des cours de sport et d'éducation physique. Bien que l'activité physique soit cruciale pour un développement sain, elle augmente également le risque de blessure, ce qui peut entraîner une perte de temps d'activité et une morbidité accrue. Les recommandations d'activité actuelles sont basées sur des études suggérant que le risque de blessure augmente considérablement si l'activité hebdomadaire est augmentée de ≥ 30%. Cependant, ces études avaient des limites méthodologiques et se concentraient sur les adultes. Il n'existe aucune recommandation spécifique aux enfants.Objectifs: Quantifier la relation entre les changements … Read more
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2020 — Geometric deep learning: features, graphs, and affinity supervisionAbstract
Les progrès réalisés dans les techniques d’apprentissage profond ont révolutionné la recherche dans le domaine de la vision par ordinateur et se traduisent par des succès sans précédents dans les tâches de reconnaissance visuelle. Par conséquent, de nombreux chercheurs en vision artificielle développent actuellement des architectures neuronales et des fonctions de perte (loss functions) afin d’apporter une solution aux problèmes spécifiques rencontrés dans le domaine de la vision par ordinateur. Cependant, la plupart des architectures neuronales actuelles ne peuvent traiter facilement les données d’entrée en 3D, ce qui a suscité un nouvel intérêt pour l’apprentissage des représentations avec des architectures … Read more
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2020 — Consequences and predictors of heart failure hospitalization in adults with congenital heart disease: A population-based analysisAbstract
Marelli, Ariane (Supervisor2) Read more
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2020 — The transcriptional regulation by MYSM1 in hematopoietic stem and progenitor cellsAbstract
Nijnik, Anastasia (Internal/Supervisor) Read more
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2020 — Effects of novel food processing methods on allergenic and nutritional attributes of kiwifruit componentsAbstract
Kiwifruit is rich in bioactive components, including dietary fibers, carbohydrates, vitamins, minerals, omega-3 fatty acids, and antioxidants. These components are beneficial to boost the human immune system contributing to the prevention of cancers and heart diseases. However, kiwifruit is becoming one of the most common plant-based food allergens worldwide after soy and peanut. Kiwifruit allergy can trigger a series of symptoms ranging from oral allergy syndrome to life-threatening anaphylaxis. Many factors such as variety, maturity, and storage conditions of fruit affect the allergenicity of kiwifruit. In this thesis, we have reported that major kiwifruit allergen, Act d 2, is mainly … Read more
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2020 — The quantification of radiation induced pulmonary fibrosisAbstract
Radiation induced pulmonary fibrosis (RIPF) is a late and permanent complication of thoracic radiotherapy. It is characterized by the formation of permanent scar tissue in the lungs, often reducing the already depleted pulmonary reserves and decreased pulmonary function of lung cancer patients. Currently, the assessment of RIPF is dependent on the qualitative and subjective appraisals of physicians, evaluated only after patient self-reports, despite RIPF presenting asymptomatic in many cases. As a result, RIPF is poorly identified and assessed with high variability. Recent studies have suggested that quantifying traditionally qualitative diagnostic outcomes, such as visually appraised RIPF, can yield a more … Read more
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2020 — Impact of ballast fouling on the mechanical properties of railway ballast: insights from discrete element analysisAbstract
Meguid, Mohamed (Supervisor1) Read more