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2022 — Effect of self-reported anxiety levels on indices of cardiovascular health in response to slow breathingAbstract
L'anxiété, une émotion impliquée dans le développement et la présentation des troubles anxieux, est associée à une tension artérielle (TA) élevée et à une raideur artérielle. Ces séquelles cardiovasculaires peuvent contribuer à l'incidence élevée des maladies cardiovasculaires observées chez les personnes diagnostiquées avec des troubles anxieux. La respiration lente (RL), définie comme le maintien d'une fréquence respiratoire entre 4 et 10 bpm, a été efficace pour réduire la TA et améliorer la rigidité artérielle dans plusieurs populations cliniques, mais n'a pas encore été évaluée chez les personnes anxieuses. Par conséquent, le but de cette étude pilote est d'évaluer l'effet d'un … Read more
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2022 — Cumbia: audiotopías, violencias y cuerpoAbstract
Cumbia : audiotopías, violencias y cuerpo analyse la cumbia comme point de départ d'une analyse littéraire et cinématographique. Partant de la question de son origine, cette manifestation est formulée comme un ensemble de dispositifs et de pratiques culturels: une écologie. Ainsi, le but de cette recherche est de soutenir que le processus d'appropriation culturelle inhérent à la cumbia fonctionne comme un unificateur et/ou un véhicule pour les récits littéraires et cinématographiques dans les Amériques.Pour atteindre cet objectif, cette étude vise à déterminer comment la littérature et le cinéma actuels ont raconté la cumbia et ce que ce récit a à … Read more
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2022 — New understanding of low parameters microtubule model with numerical parameter space compressionAbstract
Les microtubules sont des structures tubulaires qu’on retrouve dans les cellules eucaryotes qui peuvent être jusqu’à 50 microns en longueur. Les microtubules s’allongent et raccourcissent naturellement par un phénomène qu’on appelle l’instabilité dynamique. Depuis la découverte de ce phénomène il y a 32 ans, il y a eu plusieurs tentatives dans la littérature de le reproduire par des modèles mathématiques. Cependant, il n’y a toujours aucun modèle qui explique le phénomène dans son entièreté, malgréune augmentation en complexité.Pour donc mieux comprendre les aspect fondementaux du phénomène, j’ai étudié différents modèles dans la littérature et construit un modèle simplifié avec un … Read more
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2022 — Nucleome dynamics in normal and stalled developmentAbstract
Comptant parmi les machineries les plus complexes connues de l'homme, les cellules qui composent tous les organismes vivants sont à la base de la vie elle-même. Au-delà des moyens traditionnels d'évaluation grossière de la morphologie et de la composition cellulaires, les récentes avancées dans les analyses basées sur le séquençage ont alimenté des progrès considérables dans la compréhension des processus biologiques à différentes échelles. En particulier, l'importance des mécanismes de régulation qui n'impliquent pas de variation dans les séquences génétiques proprement dites – "épigénétique" – est devenue de plus en plus évidente, étant donné leur fonction critique dans le réglage … Read more
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2022 — Modeling the gene regulatory dynamics in neural differentiation with single cell data using a machine learning approachAbstract
La maturation cellulaire est un processus au cours duquel les cellules progénitrices se développent progressivement en cellules matures de fonctions spécialisées. Une meilleure compréhension des caractéristiques moléculaires et des mécanismes réglementaires du destin cellulaire est un objectif central dans la recherche biologique. Des progrès dans la technologie de séquençage des cellules simples permettent l'analyse de la différenciation cellulaire à une résolution sans précédent. Dans cette thèse, je modélise la maturation cellulaire à l'aide d'approches d'apprentissage machine. Je commence par présenter une approche utilisant des forêts d'arbres décisionnels pour identifier les gènes les plus discriminants pour différentes populations cellulaires dans le … Read more
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2022 — Exploring novel strategies to sensitize melanoma to immunotherapy and targeted therapiesAbstract
Le mélanome est la forme de cancer de la peau la plus mortelle. Les traitements actuels pour les patients atteints de mélanome métastatique incluent les immunothérapies visant le blocage des points de contrôle immunitaire et les thérapies ciblées sur la voie des MAPK. Cependant, les résistances naturelles et acquises sont courantes et représentent un défi clinique majeur. Les mélanomes présentent une hétérogénéité intratumorale élevée et une plasticité des cellules cancéreuses. Cette capacité de basculer entre différents états cellulaires, un processus connu sous le nom de commutation phénotypique, confère un avantage aux cellules du mélanome à devenir métastatique et acquérir une … Read more
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2022 — A phased-bottom-up approach to the Eumelanin challengeAbstract
L’eumélanines est un biopolymères multifonctionnels qui colore la peau, les cheveux et les yeux humains. Sa biosynthèse commence par l'oxydation catalysée par la tyrosinase de la L-tyrosine (Tyr) en acide 5,6-dihydroxyindole-2-carboxylique (DHICA) ou en 5,6-dihydroxyindole (DHI). Le DHICA et le DHI sont les derniers intermédiaires connus de la voie de biosynthèse, car leur oxydation spontanée conduit à des matériaux complexes, insolubles et hétérogènes. Des décennies d'efforts expérimentaux et théoriques n'ont pas permis de définir la structure de l'eumélanine et, par conséquent, les origines moléculaires de ses propriétés physiques uniques, notamment une large bande d’absorption UV, la chélation de métaux, une … Read more
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2022 — A class of nonlinear partial differential equations and their applications in differential geometryAbstract
La thèse porte sur une classe d’équations aux dérivées partielles non linéaires et leurs applications en géométrie différentielle. Les fils principaux se composent de trois par- ties. Le première partie concerne le flux de Ricci à partir d’une surface convexe fermée plongée dans R3. Ceci considère le flux de Ricci avec pour valeur initiale une surface convexe fermée plongée dans R3 sans hypothèse de régularité. Nous prouvons la con- vergence en métrique et l ’unicité du flux. Nous espérons que cela pourra être utilisé comme première étape pour fournir une preuve du théorème de rigidité de Pogorelov sur les surfaces … Read more
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2022 — Comparison of sea surface temperature modelling between statistical and neural network methodsAbstract
Les modèles spatio-temporels sont des séries chronologiquesspatialement orientées qui surviennent dans de nombreux contextesnaturels tels que la science atmosphérique. Il existe divers modèlesde prévision de modèles spatiaux et temporels issus à la fois des statistiques et de l'apprentissage automatique. Notre travail visait à comparer des méthodes statistiques avec une approched'apprentissage automatique reclassant des tâches de prévision de modèle spatial temporel sans covariable, en utilisant les données de température de surface de la mer dans le but de comparer leursperformances de prévision en termes de prévisions ponctuelles et d'intervalles de prévision. Bien qu'il soit communément admis que les modèles d'apprentissage en … Read more
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2022 — Racial and age-related disparities in infant and maternal mortality in the United States from 2000-2019Abstract
Objectifs: Les taux de mortalité infantile et maternelle servent de marqueurs importants de la santé d'un pays. Bien que les taux de mortalité infantile aient diminué, encore plus de 21 000 nourrissons sont morts en 2018 aux États-Unis et le syndrome de mort subite du nourrisson (SMSN) reste la principale cause de décès des nourrissons. Les États-Unis sont également la seule nation développée, où les taux de mortalité maternelle sont en hausse. La plupart des études ont exclu les causes de décès non obstétricales en raison de la définition de la mort maternelle de l'Organisation mondiale de la santé (OMS), … Read more
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2022 — Finite element modeling of gas-surface interactions in hypersonic flightAbstract
Les simulations numériques modélisant les effets des interactions gaz-surface sur la composition du gaz en proche paroi et le transfert de chaleur à la surface sont d'une importance capitale lors de la conception des systèmes de protection thermique de véhicules hypersoniques. Le présent travail étend les capacités du code tridimensionnel de dynamique des fluides computationnelle (CFD) HALO3D – dont les équations de conservation de masse, quantité de mouvement, et d’énergie, sont discrétisées avec une méthode d'éléments finis (FEM) basée sur les arêtes – en introduisant les modèles de chimie de surface à catalycité partielle et à taux fini.Le modèle de … Read more
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2022 — Modern reflections: An assessment of diversity in U.S. cancer clinical trialsAbstract
La diversité démographique dans les essais cliniques peut être définie comme l'inclusion explicite et la caractérisation réfléchie des différences de résultats entre les sous-populations d'un échantillon de participants à la recherche donné. Cette thèse donnera un aperçu de l'état actuel de la diversité en explorant l'histoire de la diversité dans les essais cliniques aux États-Unis, en proposant des raisons éthiques et épistémiques pour la diversité et en examinant comment la diversité est liée à des idéaux sociaux plus importants d'équité, de représentation et d'inclusion dans la société occidentale. Une étude transversale utilisant les données des essais américains de phase III … Read more
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2022 — The Elites in Revolt? Understanding Brexit Dynamics through Electoral System Incentives and Anti-Establishment CooptationAbstract
Cette thèse vise à comprendre pourquoi les forces anti-establishment se manifestent différemment entre les pays en raison de contraintes organisationnelles et partisanes, à l’aide d’une étude de cas exploratoire. Plus précisément, il vise à comprendre le rôle des systèmes électoraux et comment les positionnements spatiaux des différents acteurs politiques déterminent les canaux par lesquels émerge la politique anti-establishment, à savoir si elle émerge à travers les partis anti-système, jusqu’alors majoritaires, ou les deux, et comment un tel discours et un tel positionnement stratégique peuvent persister. Cette thèse explore la façon dont la politique et les institutions partisanes se recoupent, entraînant … Read more
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2022 — Defining the role of Afadin in Breast Cancer metastasisAbstract
Le cancer du sein est le plus fréquemment diagnostiqué chez les femmes. La perte d'adhérence cellulaire entre cellules épithéliales adjacentes a été associée à la formation de métastases cancéreuses. Ce sont ces dernières qui représentent l’aspect le plus mortel du cancer. Claudin-2 et afadin sont deux protéines impliquées dans l'adhésion cellule-cellule qui interagissent ensemble et pour lesquelles une implication dans la régulation de la progression cancéreuse a été démontrée. Claudin-2 est un constituant des jonctions serrées qui s'est avéré avoir des fonctions pro-tumorigènes dans l’établissement de métastases pulmonaires et hépatiques du cancer du sein. Pour sa part, afadin est une … Read more
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2022 — Fabrication of protein-polymer composites for bioelectronicsAbstract
Les matériaux bioélectroniques doivent être compatibles entre les systèmes électroniques et biologiques et, comme tous les domaines de la technologie en pleine croissance, ces matériaux gagnent à être durables et renouvelables pour soutenir un monde en rapide évolution. Le polymère conducteur, poly(3,4-éthylènedioxythiophène) polystyrène sulfonate (PEDOT:PSS) est largement étudié pour les applications bioélectroniques en raison de sa conductivité élevée et de sa facilité de traitement. Lorsque PEDOT:PSS a été combiné avec des biopolymères tels que la cellulose ou des protéines telles que les protéines des dents des anneaux de calamars, les composites obtenus ont montré des propriétés synergiquement améliorées par rapport … Read more
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2022 — Investigating the mechanism of action of USP19, a deubiquitinating enzyme, in glucocorticoid-induced muscle wastingAbstract
La fonte musculaire est une complication grave de plusieurs conditions telles que le vieillissement, l’inactivité prolongée ou l’hypercortisolémie causée par la maladie ou les traitements aux glucocorticoïdes. Nous avons précédemment identifié USP19, une enzyme de déubiquitination, induite dans les muscles en réponse à plusieurs stimuli cataboliques incluant les traitements aux glucocorticoïdes93. L’inactivation de USP19 dans les souris mène à une protection musculaire, confirmant ainsi son importance dans le processus d’atrophie musculaire117. Nos récents travaux ont aussi révélé que l’inactivation de USP19 augmente la signalisation de l’insuline et diminue la signalisation des glucocorticoïdes. Ce dernier semble être causé par la diminution … Read more
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2022 — Essays on the impacts of IT on the nature of workAbstract
Étant donné que divers outils et systèmes de technologie de l'information (TI) sont largement utilisés sur les lieux de travail, les TI ont entraîné des changements fondamentaux dans divers aspects du travail. Même s'il existe une importante littérature sur le sujet, notre compréhension de la façon dont les TI influencent la nature du travail reste incomplète. Dans cette thèse, j'écris deux essais qui examinent l'impact de l'informatique sur deux aspects spécifiques du travail liés à la coordination : la spécialisation (le degré d'étroitesse de la portée de la tâche d'un travailleur individuel) et l'agglomération urbaine (le degré de concentration de … Read more
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2022 — Micromechanical modeling of soil-water interaction with applications to buried structuresAbstract
Cette thèse débute par une revue complète des approches numériques et des définitions propres à la modélisation microscopique des systèmes eau-sol. En plus de fournir une revue de la littérature pertinente au sujet de cette thèse, le chapitre en question est motivé par le désir de résumer de façon claire et concise les innovations dans le domaine de la modélisation entreprises dans d’autres disciplines telles que le génie chimique qui sont directement utilisables en génie géotechnique. Dans le troisième chapitre, le modèle à deux fluides est étudié dans le contexte de l’érosion interne causée par des fuites dans des tuyaux … Read more
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2022 — Multi-axis laser-assisted milling of difficult-to-machine alloysAbstract
La demande sans cesse croissante de développement de matériaux avancés difficiles à couper pour les applications aérospatiales, automobiles et médicales est entravée par la faible usinabilité des matériaux, lorsque des procédés d'enlèvement de matière conventionnels sont utilisés. L'usinage de ces matériaux se caractérise par des forces de coupe élevées, de faibles taux d'enlèvement de matière, une usure excessive des outils, une mauvaise qualité de surface due aux microfissures et à l'écaillage, l'utilisation d'outils de coupe coûteux et l'utilisation d'une grande quantité de liquide de refroidissement. Par conséquent, pour exploiter tout le potentiel d'application de cette classe de matériaux, le développement … Read more
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2022 — Noise and vibrations analysis of electrical machinesAbstract
Les machines ´electriques d’aujourd’hui se trouvent dans de nouveaux environnements o`u lesdemandes exigent un niveau sonore abaiss´e, particuli`erement dans les v´ehicules ´electriques.Il est donc imp´eratif que les demandes sonores soient satisfaites pendant la conception.Autrefois, les machines exp´erimentales ´etaient construites tˆot dans le processus ded´eveloppement pour ´evaluer leurs caract´eristiques acoustiques. Ce processus pouvait ˆetred´esagr´eable pour les concepteurs, car les modifications requises demandaient souvent deschangements substantiels aux prototypes. Ces prototypes sont souvent dispendieux, et leschangements faits sur une machine existante sont difficiles. Pour ces raisons, l’utilisationde logiciels d’analyses acoustique et des vibrations a attir´e beaucoup d’attention au coursdes derni`eres ann´ees.Cette th`ese utilise … Read more
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2022 — Ippolito Baccusi and the musical culture of north-eastern ItalyAbstract
Ippolito Baccusi, musicien de l’école vénitienne actif durant la seconde moitié du XVIe siècle, est l’un des nombreux compositeurs négligés de la Renaissance. Baccusi a laissé un important corpus de compositions, à la fois profanes et sacrées, mais seules quelques-unes de ses œuvres ont été éditées et étudiées. À son époque, cependant, il était un compositeur de renom. Ami de Giaches de Wert, il enseigna le contrapunto alla mente à Lodovico Zacconi qui, dans sa Prattica di musica, nomma son maître parmi les meilleurs contrepointistes de l’époque, avec Wert lui-même et Costanzo Porta. Les compétences techniques de Baccusi, combinées à … Read more
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2022 — Abnormal placental DNA methylation and gene expression associated with assisted reproduction: early detection and effect of folic acid supplementationAbstract
Au Canada, une proportion croissante de couples recours aux techniques de reproduction assistée (TRA) pour concevoir. Cependant, on signale une incidence plus élevée de conséquences périnatales incluant des malformations congénitales et des troubles de croissance et de l'empreinte génomique, souvent associés à des perturbations de la méthylation de l'ADN. En effet, les périodes de développement des cellules germinales et de l'embryon coïncident avec des vagues dynamiques de méthylation de l'ADN et sont particulièrement sensibles aux TRA. Pour établir et maintenir des profils de méthylation de l'ADN appropriés, les donneurs de groupes méthyle tels que l’acide folique sont essentiels. En utilisant … Read more
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2022 — A quantitative small-scale characterization suite to assess hybrid-manufactured tool performance for composite processesAbstract
La fabrication hybride à grande échelle (HLSM) d'outils pour le traitement des composites offre la possibilité de résoudre les problèmes courants de coût et de performance de l'outillage traditionnel, mais les méthodes actuelles de recherche sur leur conception et leur fabrication demandent beaucoup de temps, de matériel et de main-d'œuvre, ce qui entraîne des coûts inutiles. Cette étude propose une suite d'essais quantitatifs à petite échelle pour évaluer et prédire les paramètres de traitement clés et les propriétés et performances résultantes de l'outillage HLSM dans le traitement des composites, ce qui minimise les essais à grande échelle et par conséquent … Read more
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2022 — An empire within an empire: the upper Canadian Indian department, 1796-1845Abstract
Bien plus qu’une simple division du gouvernement colonial, le Département des Indiens du Haut-Canada était son propre Imperium in Imperio. Au cours du demi-siècle qui s’est écoulé entre 1796 et 1845, les priorités, les intérêts et les attitudes de ses employés ont significativement contribué au maintien des relations entre les Autochtones et l’Empire dans la région des Grands Lacs. Fermement enracinés dans les traditions d’alliance militaire et de ligature impériale qui remontent à la création du Département dans les années 1750, ses membres ont constamment prôné la continuation des pratiques diplomatiques qui avaient alors été établies. Le Département des Indiens … Read more
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2022 — Frailty in HIV: Challenges with measurement, identification, and contributorsAbstract
Grâce à des traitements efficaces, l'espérance de vie des personnes vivant avec le VIH est allongée et un groupe plus important de personnes vieillit avec le VIH et fait face à des conditions liées à l'âge telles que la fragilité. Actuellement, il existe un large éventail d'indices de fragilité, mais il n'y a pas de mesure de référence pour la fragilité, car il y a un manque de cadres théoriques et opérationnels dans le domaine de la fragilité. Cette thèse a développé un cadre pour la fragilité liée au VIH et a étudié les effets des facteurs personnels, liés au … Read more
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2022 — Investigating biopsychosocial, methodological, and task-based determinants of inter-joint coordination in adults with chronic low back pain.Abstract
La douleur peut servir de mécanisme de protection, incitant à protéger une région qui est perçue comme étant blessée ou menacée. Chez les personnes souffrant de lombalgie, une diminution du mouvement de la colonne vertébrale, la coordination hanche-colonne vertébrale plus raide, et la variabilité réduite, reflètent des comportements moteurs de protection. Bien que ces comportements puissent causer une charge tissulaire anormale et compliquer la convalescence, ils sont observés de façon incohérente dans la littérature. Ces incohérences pourraient concerner (i) les considérations liées aux tâches, (ii) les procédures méthodologiques biomécaniques et (iii) l’influence des variables biopsychosociales. Une meilleure compréhension de ces … Read more
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2022 — Characterization of germination associated thaumatin-like proteins in barleyAbstract
Les protéines semblables à thaumatine (Thaumatin-like protein, TLP) appartiennent à la famille de gènes PR-5 des protéines liées à la pathogenèse (pathogenesis-related, PR). Leur rôle dans la tolérance au stress biotique et abiotique est bien documenté dans la littérature. Des études récentes indiquent que l'un des gènes du TLP, HvTLP8, interagit avec le β-glucane pendant la germination des graines et pourrait influencer les caractéristiques de qualité de malt. Le β-glucane est la principale fibre alimentaire présente dans le grain d'orge, dont une faible quantité est une caractéristique souhaitable pour l'industrie brassicole et de sélection de l'orge brassicole. Une expression plus … Read more
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2022 — A Three-Factor Model of Common Early Onset Psychiatric Disorders: Temperament, Adversity, and DopamineAbstract
Les troubles psychiatriques d'apparition précoce, couramment comorbides, pourraient refléter l'expression variable de facteurs de risque qui se chevauchent. Les processus médiateurs restent mal compris, mais trois facteurs semblent prometteurs: les traits d'extériorisation des adolescents, l'adversité au début de la vie et les auto-récepteurs de la dopamine D2 du mésencéphale. Pour déterminer si ces caractéristiques acquièrent un plus grand pouvoir prédictif lorsqu'elles sont combinées, une étude longitudinale a été menée auprès de jeunes suivis depuis la naissance. Les membres de la cohorte ont été invités à participer en fonction des scores d'externalisation entre 10 et 16 ans. À 18 ans (18,5 … Read more
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2022 — Design and validation of a non-invasive intra-abdominal pressure measurement deviceAbstract
Compte tenu des exigences physiologiques et physiques de l’abdomen humain, les problèmes abdominales peuvent être fréquentes et sévères. Deux propriétés physiologiques associées aux problèmes abdominales sont la pression intra-abdominale (IAP) et l’élasticité (E) de la paroi abdominale. Malgré la prévalence des complications abdominales et les rôles connus de l’IAP et de l’E de la paroi abdominale, les méthodes de mesure acceptées pour les deux propriétés restent invasives ou peu fiables. Par conséquent, l’objectif global de cette recherche est de concevoir, optimiser et valider un nouveau appareil de mesure IAP directe et non invasive destiné à être utilisé dans l’analyse des … Read more
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2022 — Poorly understood aspects of ribosome biology: An untapped resource for novel antibioticsAbstract
La découverte des antibiotiques à la fin des années 1920 a constitué une avancée médicale majeure. Cependant, l'augmentation mondiale de la résistance aux antibiotiques et le manque de nouveaux antibiotiques menacent des procédures médicales vitales et notre capacité à traiter les maladies infectieuses. Par conséquent, nous avons besoin d'antibiotiques plus puissants et dotés de nouveaux mécanismes d'action. De nombreux antibiotiques utilisés en clinique ciblent le ribosome bactérien, car la synthèse des protéines est au cœur de tous les processus biologiques, et ce mécanisme est bien compris. Cependant, d'autres aspects de la biologie du ribosome restent mal compris et constituent des … Read more
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2022 — Crop response to water and fertilizers used in soil modified with hydrogelsAbstract
L'augmentation de l'efficacité de l'utilisation de l'eau et de l'azote est essentielle pour augmenter la production agricole et réduire la dégradation de l'environnement. Les hydrogels cellulosiques dérivés de déchets de papier, ont la capacité de retenir et de libérer progressivement l'eau et l'azote pour une croissance optimale des plantes. Cette étude a évalué la réponse des cultures à l'eau et au NO3-−N avec des hydrogels amendés dans le sol. La tomate a été utilisée comme culture pour cette étude car c'est la culture légumière la plus largement cultivée avec une réponse sensible à l'eau et à l'azote. Une expérience a … Read more
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2022 — LAGr: Label Aligned Graphs for Better Compositional Generalization in Semantic ParsingAbstract
Le but de l'analyse sémantique est d’associer des énoncés ou des questions dans un langage naturel à une représentation de sens structurée, telle qu’un programme exécutable ou une proposition logique. Les stratégies les plus communément déployées pour réaliser cette tâche sont les méthodes dites “séquence-à-séquence” (seq2seq) qui produisent des représentations structurées de manière séquentielle, générant un mot à la fois. Bien que ces méthodes aient mené à de grandes avancées dans l'analyse sémantique, des recherches récentes en généralisation compositionnelle ont souligné le fait que ces méthodes ont de la difficulté à généraliser systématiquement: elles ne sont pas capables de recombiner … Read more
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2022 — Privacy-Fairness: It's complicated -- An unavoidable unfairness of differentially privacy on machine learning systemsAbstract
Tout logiciel d'apprentissage automatique piloté par des données impliquant des informations sensibles doit être conçu avec soin afin que les principales préoccupations liées aux valeurs et aux droits de l'homme soient suffisamment protégées. Le respect de la vie privée et l'équité sont deux des préoccupations les plus importantes de l'apprentissage automatique qui attirent les universitaires et les industriels. Cependant, elles sont souvent abordées indépendamment, bien qu'elles dépendent toutes deux fortement de la distribution des données autour d'attributs per- sonnels sensibles. Une telle approche séparée ne peut pas répondre adéquatement à la réalité dans la mesure où les évaluations faites en … Read more
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2022 — Machine learning as a tool to analyse data from plasmonic sensors for medical diagnosticsAbstract
L’apprentissage automatique a un grand potentiel pour surmonter la complexité et l'hétérogénéité des données biologiques. Le développement de capteurs multiplexés à haut débit permet aujourd'hui l'acquisition de données biologiques variées en quantité toujours croissante. En conséquence, un diagnostic et un suivi plus précis de la maladie peuvent être réalisés. Cependant, les données doivent être traitées et passées au crible afin de trouver les caractéristiques les plus pertinentes et de déterminer les relations au sein des données, ce qui représente un énorme défi pour les humains, en raison à la fois de la quantité de données disponibles et de leur nature … Read more
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2022 — Modelling haploinsufficiency of histone modifier genes using human cell modelsAbstract
Les troubles neurodéveloppementaux (TND) touchent environ 1 % de la population totale et représentent un lourd fardeau pour les familles. De nombreux TND sont causés par des mutations dans des gènes spécifiques, et une catégorie de ces gènes code pour des modificateurs épigénétiques. Jusqu'à présent, la plupart des études de modélisation des TND se sont concentrées sur la perturbation moléculaire des cellules cérébrales différenciées en phase terminale, c'est-à-dire les cellules neuronales et gliales. Cependant, de récentes avancées technologiques ont permis de découvrir l'amorçage épigénétique dans les cellules souches, où l'épigénome des cellules souches est mis en place dans un état … Read more
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2022 — Identifying genetic factors underlying susceptibility to inflammatory and infectious diseasesAbstract
La génétique de l'hôte est en partie responsable de la variation existante entre les individus lors du développement de maladies. Dans cette thèse, nous identifions de nouveaux facteurs génétiques responsables de la susceptibilité aux maladies inflammatoires et infectieuses. Le premier facteur dont l’implication a été démontrée est le facteur de transcription Irf1 dans la progression du cancer colorectal associé à la colite (CA-CRC). La perte d'Irf1 chez les souris engendre une hypersensibilité au CA-CRC, caractérisée par une apparition précoce et une augmentation du nombre de tumeurs, entraînant une létalité plus importante. Nous démontrons que cette hypersensibilité est due à une … Read more
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2022 — Cosmic string loops as the seeds of supermassive and intermediate-mass black holesAbstract
L’observation de nombreux quasars à grand décalage vers le rouge ayant une masse supérieure à 10^9 M_⊙, ainsi que la fusion récente de deux trous noirs de masse intermédiaire, augmentent l’intérêt pour l’origine des trous noirs supermassifs (SMBH) et des trous noirs de masse intermédiaire (IMBH), qui représentent des énigmes dans le modèle ΛCDM. Les cordes cosmiques supraconductrices permettent de résoudre conjointement ces deux mystères. Les cordes en boucles créées tôt dans l’évolution de l’univers génèrent des surdensités non linéaires, qui pourraient constituer les germes de ces trous noirs. La mise à l’échelle des boucles donne lieu à une distribution … Read more
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2022 — Dust of FireAbstract
Dust of Fire est une pièce écrite pour grand orchestre : bois par 2, 4 cors, 2 trompettes, 2 trombones, tuba, timbales, 3 percussionnistes, harpe, piano, célesta, et cordes (16-14-12-10-8). Cette œuvre est la continuation de ma recherche sur la création de liens entre des images visuelles et des environnements sonores en usant de textures musicales spécifiques dans la partition. La pièce est entièrement construite autour de deux textures elles-mêmes issues de deux contours symbolisant la poussière et le feu. Le feu et la poussière symbolisent respectivement les structures de pouvoir et l’oppression. La forme de cette œuvre est A … Read more
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2022 — The Mini Colon Model (MiCoMo): a benchtop multi-bioreactor system to investigate the gut microbiomeAbstract
Le microbiote intestinal est de plus en plus reconnu pour son rôle dans la santé humaine et le développement de maladies. Les systèmes de fermentation in vitro permettent d'étudier les communautés microbiennes intestinales avec un contrôle précis de divers paramètres physiologiques tout en dissociant les facteurs associés à l'hôte humain. Les systèmes contemporains, tels que le SHIME et Robogut, sont de grandes tailles, manquent de multiplexage et ont un faible débit expérimental. Les alternatives qui comblent ces lacunes, telles que le Mini Bioreactor Array (MBRA), dépendent souvent d'équipements spécialisés coûteux, ce qui entrave la réplication à grande échelle entre les … Read more
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2022 — Global integration and local responsiveness in managing international branch campuses: An empirical investigation of three Canadian casesAbstract
Cette thèse visait à étudier les stratégies des campus délocalisés internationaux pour adresser le défi managérial consistant à répondre aux demandes éducatives du pays d'accueil (réactivité locale) tout en maintenant une qualité éducative comparable à celle de l'établissement d'origine (intégration mondiale) et les facteurs ayant un impact sur leurs stratégies. Pour atteindre cet objectif, j'ai utilisé l'étude de cas comme méthodologie de recherche et sélectionné le programme MBA de McGill au Japon, l'école de cinéma de Shanghai Vancouver et le Collège Algonquin-Koweït comme cas. Afin d’obtenir une compréhension holistique de chaque cas, J'ai mené des entretiens et examiné des documents … Read more
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2022 — Two essays in financial economicsAbstract
Cette thèse se concentre sur l'évaluation des actifs et le partage optimal du risque aux marchés financiers. Le premier article «Sharper Alpha» vise à fournir un meilleur outil économétrique pour mesurer et étudier les primes de risque. Les tests traditionnels basés sur l'alpha se confrontent au bruit d’estimation lorsqu’ils sont appliqués à des actions individuelles. L’approche conventionelle qui utilise des portefeuilles diversifiés réduit ce problème, mais elle induit également des erreurs et des pertes d’information. Je propose une statistique plus efficace qui réduit directement l’erreur d’estimation pour les actions individuelles, ce qui révèle des relations qui n’étaient pas visibles avant.Dans … Read more
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2022 — Stigma against vocal illness among professional singers and actorsAbstract
Contexte : Les personnes ayant une condition médicale stigmatisée peuvent devenir réticentes à chercher de l'aide. Parmi les artistes vocaux, les troubles de la voix peuvent être stigmatisés. Cependant, il-y a peu de données sur cette stigmatisation vocale dont aucune qui explore son impact envers la recherche de l’aide. Les objectifs de cette étude étaient d’évaluer quantitativement la stigmatisation vocale chez les artistes vocaux, de quantifier le lien entre la stigmatisation vocale et la recherche de l'aide, et d’explorer les facteurs qui peuvent influencer la stigmatisation vocale.Méthodes : Un questionnaire sur internet a été créé et déployé avec LimeSurvey. Il … Read more
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2022 — Sliding-Window-Based Tightly-Coupled LIDAR-Inertial-Visual Odometry and MappingAbstract
Cette thèse étudie la conception d'un algorithme de navigation autonome dans des environnements sans GPS. Les performances des solutions de navigation actuelles sont dictées par l'évolution de l'environnement d'exploitation. En conséquence, au cours des deux dernières décennies, diverses formulations de localisation et de cartographie simultanées (SLAM) ont été proposées pour s'adapter à diverses conditions d'exploitation et améliorer la robustesse. La fusion multicapteur est l'une de ces formulations. Chaque capteur a ses propres forces et faiblesses dans un environnement donné. En utilisant plusieurs capteurs, les faiblesses d'un capteur peuvent être contrebalancées par les forces des autres. À cette fin, l'approche proposée … Read more
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2022 — Privacy-preserving regression methods for distributed biomedical dataAbstract
Les études multicentriques avec des réseaux de données séparés sont omniprésentes dans la recherche médicale et sont de plus en plus utilisées pour mettre en place des systèmes de surveillance de la santé, mener des recherches d'efficacité comparative et concevoir des études d'intervention. Parmi les principaux exemples, on peut citer le Réseau canadien pour les études observationnelles sur les effets des médicaments (CNODES), le système de surveillance de la sécurité des produits médicaux de la FDA aux États-Unis (Sentinel) et ENCePP en Europe. Au sein des réseaux de données distribués (RDD), le maintien de la confidentialité et la limitation de … Read more
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2022 — Computational investigations of presupposition effects in languageAbstract
En linguistique et en philosophie du langage, la sémantique et la pragmatique sont présentées comme deux aspects complémentaires et imbriqués du sens du langage. Le premier s'intéresse au sens littéral des mots et des phrases, un sens qui ne dépend pas du contexte, tandis que le second se concentre sur le sens implicite et dépend du contexte. Alors que dans le passé la recherche en traitement automatique de la langue (TAL) s'est concentrée principalement sur la sémantique, l'objectif de cette thèse est de développer des modèles qui exploitent cette connaissance pragmatique du langage qui est cruciale pour effectuer correctement de … Read more
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2022 — Characterizing the transcriptional impact of histone H3 mutations on cell identity in cancer and developmentAbstract
Les histones jouent un rôle essentiel dans la régulation de l'expression des gènes au cours du développement alors que la dérégulation de ces processus entraîne des maladies telles que le cancer et des troubles neurologiques. Le gliome pédiatrique de haut grade (pHGG) est un cancer très agressif dont le taux de survie après deux ans est inférieur à 30 %. Grâce à la technologie du séquençage du génome entier (WGS), des mutations somatiques récurrentes dans les histones H3 en combinaison avec des mutations partenaires ont été identifiées comme étant à l'origine d'un sous-ensemble de cancers. Les mutations de la lysine … Read more
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2022 — A high time resolution search for gravitationally lensed fast radio bursts using the CHIME telescopeAbstract
Le champ gravitationnel d'objets comme trous noirs primordiaux devrait créer une paire d'images de la forme d'onde d'un sursaut radio rapide (Fast Radio Burst, FRB), où l'heure d'arrivée d'une image est différée et a une plus petite magnification de flux que l'autre image. Nous cherchons pour une copie des formes d'onde d'un FRB dans les observations de l'expérience canadienne de cartographie de l'intensité de l'hydrogène (Canadian Hydrogen Intensity Mapping Experiment, CHIME) en éffectuant un décalage temporel d'autocorrélation avec un filtre de Wiener. Un signal de lentille gravitationelle dans la domaine au décalage temporel apparaîtra comme une valeur aberrante statistiquement significative. … Read more
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2022 — Unravelling the molecular mechanism controlling barley seed germinationAbstract
La germination des graines est la phase cruciale du cycle de vie des plantes. Les réserves d'endosperme, en particulier les molécules d'amidon, sont hydrolysées lors de la germination et constituent une source d'énergie pour l'établissement des plantules. Plusieurs enzymes hydrolytiques ont été identifiées dans l'exécution de la fonction catalytique pour perturber la phase de repos de l'embryon. Ce processus implique des activités biochimiques et moléculaires complexes pour stimuler ou réprimer certaines enzymes hydrolytiques en temps opportun. Le paysage transcriptionnel de nombreuses enzymes hydrolytiques de l'amidon n'est pas entièrement compris. La fonction de l'une des enzymes cruciales, la pullulanase, est évidente … Read more
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2022 — Applicability of eDNA and eRNA in assessing species and community composition across an acid-base gradient in freshwater environmentsAbstract
L’utilisation et le développement d’outils de surveillance basés sur les acides nucléiques environnementaux (ANe; ADNe et ARNe) sont récemment devenus populaires pour caractériser la biodiversité des écosystèmes d’eau douce. L’application de tout outil de surveillance dépend toutefois de notre compréhension de ses limitations et biais inhérents, de même que de nos connaissances quant aux facteurs externes pouvant influencer la détectabilité des organismes ciblés. Bien qu’il y ait de plus en plus de recherche dédiée à l’évaluation des paramètres environnementaux pouvant affecter l’écologie de l’ADNe, nos connaissances concernant les facteurs affectant la détection de l’ARNe dans les systèmes aquatiques sont sévèrement … Read more
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2022 — Integrated analysis across cortical morphometric analyses in human brain development: a cross-sectional and longitudinal studyAbstract
Caractériser les modèles de développement à travers les mesures de la structure cérébrale est essentiel pour développer une caractérisation «normative» afin de mieux situer la variation neuroanatomique dans les contextes comportementaux et, potentiellement, cliniques. À l'aide des données de la cohorte longitudinale de développement longitudinale de l'Institut national de la santé mentale (NIH) (âgés de 5 à 25 ans), nous avons cherché à examiner les modèles à travers les caractéristiques morphométriques corticales; à savoir: l’épaisseur corticale (CT), la surface corticale (SA), l’indice de gyrification local (GI) et la courbure moyenne (MC). Nous avons intégré des mesures morphométriques transversales et longitudinales … Read more