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2022 — Arginine methylation and RNA metabolism in cancer and muscle stem cellsAbstract
Les modifications post-traductionnelles jouent un rôle important dans la régulation de différentes fonctions cellulaires. La méthylation des résidus d'arginine est une étape cruciale pour la régulation de plusieurs de ces processus, et est fortement impliquée dans les pathologies. Les protéines arginine méthyltransférases (PRMTs) sont les enzymes responsables de la méthylation de l'arginine dans la cellule et sont souvent surexprimées dans les cancers, faisant de leurs inhibiteurs une entrée prometteuse en thérapie. Notamment, la thérapie anticancéreuse à traitement unique a des limites à cause de la toxicité élevée ou de l'efficacité transitoire. Par conséquent, des combinaisons synergiques de drogues, administrées à … Read more
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2017 — Protein interactions in hereditary spastic paraplegia's molecular mechanismAbstract
La paraplégie spastique familiale est un ensemble de maladies génétiques qui affecte le système nerveux central. Elle se caractérise par l'apparition progressive et généralement sévère de faiblesses et de spasticités dans les membres inférieurs chez les personnes atteintes. Ces symptômes sont habituellement causés par une dégénérescence distale des plus longs axones des motoneurones cortico-spinaux du faisceau pyramidal. Jusqu'à maintenant, 76 loci ont été associés à la maladie, parmi lesquelles 59 gènes ont été identifiés, ce qui complexifie l'étude de la pathogénèse de cet ensemble de paraplégie. Cependant, plusieurs interactions protéiques ont été identifiées entre des protéines associées à la paraplégie … Read more
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2013 — The role of viral reservoirs in HIV-1 infectionAbstract
Les cellules T CD4 activées sont la principale source de virus pendant l'infection par le virus de l'immunodéficience humaine (VIH-1) même si d'autres cellules contribuent à la production virale. Un réservoir viral est un type de cellule ou un compartiment anatomique dont les propriétés permettent la persistance du virus infectieux pour plus longtemps que la source majeure de la production virale et le VIH-1 occupe plusieurs réservoirs. Dans cette thèse, nous examinons trois différents aspects des réservoirs du VIH-1. Dans la première partie (Chapitre 2), nous avons étudié le rôle des cellules à grande longévité qui produisent du virus dans … Read more
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1962 — L’orient dans le théâtre de Voltaire.Abstract
En ces termes, un honnête érudit, au début de notre siècle, condamne à de vaines recherches le naïf audacieux qui espère tirer de l’exotisme dans le théâtre classique, le sujet d'un travail original. Apparemment, la mise en garde de Martino n’est pas tombée dans l'oreille d'un sourd: à notre connaissance, nul n’a eu l’outrecuidance de repasser au crible le minerai voltairien et d'établir avec précision dans quelle mesure l’avertissement de Martino s'applique à l’orientalisme des tragédies de l’homme qui a rempli son siècle de sa présence et l’a scandalisé par ses innovations. Qu’il n'existe point encore de thèse définitive sur … Read more
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2016 — Living with sacred lands: negotiating sustainable heritage management and livelihoods in the Marquesas islandsAbstract
Cette thèse examine comment les perceptions du passé influencent les interactions d'un groupe autochtone avec le pays et l'usage de ressources. Il étudie la rencontre de ce qu'on reconnaît comme "l'environnement" avec l'histoire et la façon dont laquelle ce lien guide la durabilité de la culture et l'environnement des îles Marquises. Malgré les pertes graves de la vie et des connaissances marquisiens à cause de la colonialisme, la guerre, le dépeuplement et la maladie, certaines vues et compétences locales ont survécu grâce à la transmission personnelle à travers les générations. Au fil du temps ces pratiques situées sur le terrain … Read more
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2021 — Topics, form, and expression in the music of György Ligeti and Thomas AdèsAbstract
Cette thèse combine des approches théoriques musicales traditionnelles avec des théories de la lecture en littérature afin de développer une méthode visant à comprendre la signification des « topiques » dans la musique de la fin du XXe siècle. L’un des aspects les plus utilisés de la sémiotique musicale, les topiques sont définis comme des objets musicaux conventionnels avec des caractéristiques musicales facilement reconnaissables, comme le choral, la complainte et la chasse. Jusqu’à présent, cette théorie a été principalement appliquée à la musique du XVIIIe siècle. Je développe ces observations pour analyser le rôle de ces objets musicaux standardisés dans … Read more
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2011 — Moveable text: Mutability, monumentality, and the representation of motion in British Renaissance literatureAbstract
La représentation du mouvement et du changement dans les œuvres littéraires anglaises de la Renaissance constitue une négociation entre les opinions divergentes sur la valeur et l'efficacité du mouvement. Les poètes de la Renaissance illustrent le mouvement par l'entremise d'autres arts, discours, pratiques et disciplines, où il était soit hautement pertinent soit matière à débat. Sa visibilité révèle la nature riche de sens du mouvement aux yeux des littéraires de la Renaissance: dans les épopées de Spenser et Milton, des objets censés être immobiles se meuvent, ou sont qualifiés de statiques alors qu'ils sont mobiles. De telles inversions sont tout … Read more
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2011 — Extending the phase vocoder with damped sinusoid atomic decomposition of transientsAbstract
Modifier indépendamment la hauteur et l'échelle temporelle d'enregistrements sonores est devenu un outil essentiel de la production audio numérique actuelle; si bien que la plupart des logiciels commerciaux dédiés à la production incluent une version de ces effets. Les algorithmes d'étirement du sons fondés sur le vocodeur de phase permettent d'obtenir des résultats de très bonne qualité, notamment à la suite de travaux récents visant à réduire l'"étalement" des transitoires, artefacts caractéristiques de ces méthodes. Cependant, même les algorithmes les plus récents étalent les transitoires très abruptes, et ce d'autant plus que les modifications de l'échelle temporelle sont extrêmes. Afin … Read more
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2020 — Perioperative infusion of amino acids: the effect of epidural blockade: An integrated analysis of glucose and protein metabolism with stable isotopes kineticsAbstract
Ce projet a étudié l’effet d’un bloc péridural avec agents anesthétiques locaux sur la réponse catabolique au stress durant et après une chirurgie abdominale chez des patients recevant une infusion d’acides aminés. La cinétique du métabolisme protéique et du glucose a été évaluée a l’aide des isotopes stables L-[1-13C]leucine et [6,6-2H2]glucose.L’infusion d’acides aminés pendant l’intervention a induit une balance protéique positive indépendamment de la technique anesthétique employée. La production endogène du glucose n’a pas été modifiée par l’infusion d’acides aminés, par contre, celle-ci a diminuée la prise périphérique du glucose indépendamment de la technique anesthétique employée.L’infusion d’acides aminés après l’intervention … Read more
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2012 — Analysis of genetic variability within the Beijing lineage of «Mycobacterium tuberculosis»Abstract
Des recherches antérieures ont démontré que le système de signalisation DosR/DosS est surexprimé dans les souches de Beijing moderne, une sous-catégorie du Mycobacterium tuberculosis (M tb). Une hypothèse explique que la surexpression du système règlementaire est la raison des propriétés plus pathogénique de la souche Beijing moderne. Dans cette thèse, nous avons fait une tentative pour trouver la cause de la surexpression. Pour débuter, les stimuli de signalisation DosR connu a été comparé entre différentes souches de M. tb, en regardant spécifiquement les données concernant l'oxydenitrique (NO) et l'équilibre d'oxydo-réduction (redox). Nous avons démontré que la production NO endogène est … Read more
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1994 — The design and implementation of a structured backend for the MCCAT C compilerAbstract
Le système McCAT comprend un compilateur C qui optimise et parallélise, il est conçu pour permettre l'utilisation de SIMPLE, une représentation intermédiaire structurée de haut niveau. Bien que le niveau élevé d'abstraction permette des analyses sophistiquées, telle que l'analyse des pointeurs, il restreint le dépistage efficace et l'exploitation des possibilités du parallélisme à travers des transformations de bas niveau, telle que l'allocation des registres et 1' ordonnancement des instructions. Cette thèse présente LAST, une représentation intermédiaire de bas niveau qui met en évidence les détails importants de l'architecture, tout en conservant l'abstraction nécessaire pour permettre l'utilisation du compilateur en vue … Read more
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2022 — Processing and regulation of polycistronic microRNAs in cancerAbstract
Les microARN (miARN) sont des ARN courts non codants qui régulent négativement l'expression génique après la transcription et jouent un rôle important dans les processus développementaux et pathologiques des métazoaires. Ils sont transcrits en séquences primaires (pri-miARN) dont des portions s’apparient en épingles à cheveux qui encodent les précurseurs à miARN (pre-miARN) qui sont maturés en petits ARN simple brin de 21 à 22 nt. Une fois chargés dans les protéines Argonautes, les miARN ciblent la région non codante en 3’ d’ARN messagers (ARNm) et s’y apparient pour en inhiber l’expression. Bien que leur voie de biogenèse fondamentale ait été … Read more
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2023 — "The Polish Catholic Church in Solidarity and Dissension: The Church's Role in Politics since 1947"Abstract
Parler de la politique polonaise contemporaine, c'est parler, directement ou indirectement, de l'Église catholique. Qu'il s'agisse de l'éducation dans les écoles, de l'accès à l'avortement et au contrôle des naissances, ou de l'égalité des droits au mariage, les politiques du gouvernement polonais sur ces sujets sont largement contrôlées par l'Église catholique. L'étendue de son implication dans la politique va du banal à l'extrême. Cependant, qu'il s'agisse d'un prêtre disant à sa communauté laïque pour qui voter lors d'une prochaine élection et quelles politiques soutenir, ou l'Église menaçant l'ex-communication de politiciens catholiques qui autrement voteraient contre les politiques souhaitées par l'Église, … Read more
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2023 — "Al-Haraka Baraka": Palestinian Sportswomen’s Boycott as Movement-Building for LiberationAbstract
Ce projet explore comment les athlètes palestiniennes utilisent le boycottage pour résister à l’occupation israélienne. Notamment, l’étude de cas sur la campagne en ligne “#BoycottPuma” met en lumière l’effort des athlètes palestiniennes de lancer un appel au boycottage des initiatives sportives, telles que les ententes commerciales ou les événements sportifs internationaux, cherchant à normaliser l’occupation israélienne. L’analyse de cette campagne montre comment le mouvement Boycott, désinvestissement et sanctions (BDS) lutte contre le colonialisme et souligne la cause palestinienne à l’échelle internationale à travers le boycott sportif. Ce projet de recherche fait usage de plusieurs sources primaires et secondaires, notamment les … Read more
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2016 — Greener cyber physical systems - data analysis and algorithm designAbstract
Les Systèmes Cyber-Physiques (SCP) tels que les systèmes de transport, les réseaux intelligents, et les infrastructures critiques, sont les principaux contributeurs à la consommation énergétique. Malheureusement, le dégât causé par les SCPs à l'environnement a été amplifié par deux faits: La grande majorité (81.59% aux états-unis) de l'énergie provient de combustibles fossiles; l'efficacité énergétique est trop faible (seulement 39.57%). Dans cette thèse, nous visons à rendre les SCPs plus écologiques par 1) remplacer l'utilisation des combustibles fossiles par des énergies renouvelables; 2) améliorer l'efficacité énergétique. Notre approche se concentre autour de la collecte et l'analyse des données, et la conception … Read more
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2025 — Carbon, nitrogen and phosphorus retention and dynamics in plant litter, surface and deep soil of intact, restored and drained inland freshwater marshesAbstract
En réponse à la dégradation généralisée des zones humides au cours du siècle dernier, de nombreux programmes de restauration ont été mis en œuvre à travers le Canada pour restaurer les fonctions écologiques essentielles de ces milieux. Malgré des décennies de pratiques de restauration ayant permis la réinondation et la revégétalisation, il reste incertain si leurs principales fonctions biogéochimiques (comme l'activité microbienne et la rétention du carbone et des nutriments dans les sédiments) ont été efficacement restaurées. Cette thèse examine les marais d'eau douce continentaux intacts et ceux restaurés à court et à long terme, ainsi que la rétention et … Read more
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2025 — Leishmania extracellular vesicles: important and nuanced vehicles of parasite virulenceAbstract
La leishmaniose est une maladie tropicale négligée et répandue qui touche entre 0,9 et 1,6 million de personnes chaque année, causant jusqu'à 40 000 décès. Cette maladie est provoquée par le parasite protozoaire Leishmania, transmis par les phlébotomes. Leishmania est un pathogène humain ancien qui a évolué parallèlement à l’humanité, capable d’échapper aux réponses immunitaires des mammifères grâce à des facteurs de virulence tels que la métalloprotéase GP63, lui permettant d'infecter les macrophages hôtes. Notre laboratoire a précédemment démontré que les vésicules extracellulaires jouent un rôle crucial dans l'infection par Leishmania. L’étude des vésicules extracellulaires s'est imposée comme un domaine … Read more
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2019 — An efficient and accurate simulation scheme to support the design of lattice structures fabricated by additive manufacturingAbstract
La structure en treillis est une architecture prometteuse dans les applications d’ingénierie, en raison de ses propriétés uniques. La technologie de fabrication additive a considérablement réduit les limites de fabrication des structures en treillis aux géométries complexes. Cependant, avec une complexité géométrique accrue, la simulation de ces structures en treillis devient très difficile. D’une part, la géométrie complexe entraîne un coût de modélisation élevée. D’autre part, l’effet du procédé de fabrication additif peut entraîner une imprécision dans le résultat de la simulation. Par conséquent, les modèles de simulation existants ne sont pas suffisamment efficaces ou précis pour prendre en charge … Read more
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2020 — Relational reasoning from text and graph dataAbstract
Les progrès des méthodes d'apprentissage profond ont fait progresser le développement du traitement automatique du langage naturel (TALN), les améliorations devenant plus importantes grâce à la récente méthodologie de pré-entraînement du modèle de langage à grande échelle (e.g. BERT). Cependant, les résultats récents ont montré que ces modèles d’état de l’art de TALN échouent sur des tâches de raisonnement faciles pour les humains, telles que le comptage et l'induction relationnelle, mais sont fondamentales pour les agents intelligents.Dans cette thèse, nous nous concentrons sur le raisonnement relationnel, la capacité d'apprentissage et le raisonnement des relations entre les objets, et prenons la … Read more
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2023 — Using mass spectrometry to Measure Protein Turnover in a Midbrain Organoid model of Parkinson’s DiseaseAbstract
La maladie de Parkinson (MP) est une maladie grave caractérisée au début de la maladie par la mort sélective des neurones dopaminergiques. Les lésions mitochondriales, et par conséquent le renouvellement des mitochondries, sont au cœur de la santé neuronale et de la pathogenèse de la maladie. PINK1 et Parkin sont deux protéines qui jouent un rôle essentiel dans le contrôle de la qualité mitochondriale et leurs mutations causent une forme précoce de la MP. Des études antérieures ont démontré que la voie PINK1/Parkin favorise la dégradation sélective des protéines de la chaîne respiratoire chez la drosophile. Cependant, on ignore comment … Read more
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2020 — Evaluating the use of generalized dynamic weighted ordinary least squares for individualized HIV treatment strategiesAbstract
Les régimes de traitement dynamiques (DTR) constituent un paradigme statistique en médecine personnalisée qui vise à optimiser le bien-être des patients en adaptant les traitements médicaux. Au plus simple, les DTR peuvent optimiser une décision composée d'un seul traitement; on connaît ceux-ci sous le nom de règles de traitement individualisées (ITR) et elles sont souvent utilisées lorsqu’on s'intéresse à des récompenses à court terme. Les moindres carrés ordinaires pondérés dynamiques généralisés (G-dWOLS), une méthode d'estimation des DTR qui offre des avantages théoriques tels que la double robustesse des estimateurs des paramètres dans les règles de décision, peuvent maintenant prendre en … Read more
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2020 — Sex differences in shoulder muscle activation and fatigue among elite water polo playersAbstract
Le but de ce projet de maîtrise était d’utiliser l’électromyographie (EMG) pour explorer l’activation musculaire et les réponses à la fatigue de l’épaule, ainsi que comment ces paramètres varient selon le sexe, parmi des athlètes élites en water-polo. Un objectif secondaire était d’identifier si les différences entre les sexes dans leur masse corporelle maigre pourraient expliquer les différences entre les groupes dans des mesures de performance liées à la force. Des joueurs et joueuses élites de water-polo ont exécuté des contractions volontaires maximales en rotation externe et interne de l’épaule suivies par des lancers maximaux d’un ballon de water-polo dans … Read more
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2018 — SAM-Bach: a deep generative model for Bach chorale generationAbstract
Les dernières décennies ont été marquées par l'invasion de modèles générateurs profonds dans les domaines du traitement de l'image et de la génération de texte. Ainsi, on a inventé en conséquence d'énormes applications pratiques et commerciales de grandes valeurs. Les techniques progressives des modèles génératifs ont apporté beaucoup de changements passionnants à notre vie. Récemment, la recherche d'information sur la musique a commencé à attirer l'attention à la fois de la part de la communauté de recherche en apprentissage profond et des milieux industriels. La génération de musique polyphonique bénéficie de larges applications dans la demande allant de la composition … Read more
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2025 — Graph-based deep learning approach for unraveling cell specific gene regulatory networks from single-cell multi-omics dataAbstract
L'avènement des technologies à cellule unique a révolutionné la génomique en permettant l'analyse du matériel génétique à la résolution de cellules individuelles, offrant une perspective granulaire essentielle pour comprendre la diversité et la fonction cellulaires, tant en bonne santé qu'en maladie. Le séquençage de l'ARN unicellulaire (scRNA-seq) et le séquençage ATAC unicellulaire (scATAC-seq) fournissent une vue précise et spécifique au type cellulaire des paysages génomiques et épigénomiques. Ces techniques sont particulièrement précieuses pour étudier les réseaux de régulation génique (GRNs), qui se composent de facteurs de transcription (TFs), d'éléments régulateurs (REs) et de gènes cibles qui contrôlent les processus biologiques … Read more