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2025 — Characterizing retrotransposon activities in IDH Wild-Type Glioblastoma by single-cell RNA-seqRésumé
Le glioblastome (GBM) est l’une des tumeurs les plus avancées et les plus agressives à se développer dans les tissus gliaux du cerveau adulte. Après le diagnostic, les patients atteints de GBM survivent environ un an. De plus, les efforts visant à améliorer les options thérapeutiques et la survie des patients ont été peu nombreux. L’une des premières hypothèses proposées était que la présence de cellules souches cancéreuses favorisait la croissance, le maintien et l’invasion des cellules tumorales dans les tissus sains. Selon les chercheurs, ces cellules hétérogènes échappent à la chimiothérapie et à la radiothérapie pour donner naissance à … Lire la suite
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2025 — Différences individuelles lors de la marche avec un stimulus auditif rythmiqueRésumé
Adapter le rythme de ses pas au rythme d'un stimulus auditif parait facile pour la plupart des êtres humains. Cependant, de récentes études révèlent des différences individuelles significatives dans la tendance spontanée à se synchroniser à un rythme. Certains individus ont tendance à adapter leur cadence de marche à un rythme externe, tandis que d'autres ne montrent que très peu ou pas d'ajustement. Par ailleurs, nous ne savons que très peu de choses à propos des différences individuelles de synchronisation spontanée, notamment quant à son lien avec les différences individuelles de synchronisation volontaire. Malheureusement, nous faisons également face à un … Lire la suite
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2025 — Cracks in the platform : detecting inconsistencies and workarounds in low-code applicationsRésumé
Les plateformes de développement de type “low-code” accélèrent la livraison d’applications en générant des systèmes à partir de spécifications de haut niveau et en permettant de les configurer à l’exécution. Cette flexibilité engendre toutefois deux risques persistants lors de l’exploitation. D’une part, les modèles, métadonnées et données co-évoluent sans relations explicites au méta-niveau, si bien qu’une application peut rester techniquement valide tout en devenant sémantiquement incohérente avec les règles métiers. D’autre part, les utilisateurs contournent les limites des formulaires et des flux de travail au moyen de solutions de contournement (workarounds) qui leur permettent d’atteindre leurs objectifs mais qui peuvent … Lire la suite
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2025 — Caractérisation de l'activité antibactérienne et de l'implication de certains métabolites de l'oxytétracycline dans le développement de la résistance aux antimicrobiens chez Escherichia coli pathogènes aviaires (APEC)Résumé
Le phénomène de la résistance aux antimicrobiens est étroitement associé à l’usage inapproprié des antimicrobiens. Diverses approches alternatives aux antimicrobiens ont été appliquées en production animale, particulièrement dans les filières avicoles, dans le but de préserver l’efficacité de l’arsenal thérapeutique actuel. Cependant, l’activité antibactérienne des produits de dégradation d’antimicrobiens couramment utilisés en aviculture, comme les tétracyclines, reste peu étudiée comme source prometteuse de nouvelles molécules antibactériennes. Ainsi, cette étude avait pour objectifs d’évaluer, in vitro, l’activité antibactérienne de trois produits de dégradation de l’oxytétracycline (OTC) (4-α-épi-OTC (4-EOTC), α-apo-OTC et β-apo-OTC), de déterminer si des souches d’E. coli d’origine aviaire adoptent … Lire la suite
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2025 — Oriented cell division maintains C. elegans germline tissue organizationRésumé
L’orientation de la division cellulaire, déterminant la position des cellules, joue un rôle clé dans l’architecture des tissus. Le fuseau mitotique détermine l’orientation de la division cellulaire. Bien que nous comprenions les principes fondamentaux de l’orientation du fuseau dans les cellules en culture, la manière dont les cellules s’orientent dans les tissus, où plusieurs signaux peuvent interagir pour influencer les cellules, reste mal comprise. Ma thèse décrit l’utilisation de la lignée germinale du nématode Caenorhabditis elegans comme modèle pour étudier comment les cellules intègrent les signaux de leur environnement pour orienter leur fuseau. Les cellules germinales de C. elegans forment … Lire la suite
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2025 — Learning generative models from a control perspectiveRésumé
The main topic of this thesis is to bridge two important domains in machine learning: probabilistic generative models and control methods. Generative models are used for modeling distributions of various kinds of data and are of great importance in creative generation applications. Generative models can also be used for versatile probabilistic inference tasks, such as posterior solving or normalizing factor estimation, which are important in many scientific applications. The focus of this thesis is to study how control insights can guide us to design better generative modeling algorithms, for example, achieving a better trade-off between exploration and exploitation. We present … Lire la suite
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2025 — L'organisation sociomatérielle d'un projet événementiel : une étude de cas au QuébecRésumé
Depuis les années 1980, les villes post-industrielles accordent une importance croissante aux retombées économiques positives des activités culturelles sur leur territoire. Comment un projet culturel temporaire peut-il être réellement organisé et mis en œuvre malgré son caractère en apparence éphémère? Cette recherche se concentre sur un projet de spectacle de musique traditionnelle organisé par une structure culturelle permanente. Elle vise à comprendre comment ces projets prennent forme à travers des pratiques organisationnelles mobilisant à la fois des acteurs humains et non humains (outils, technologies, textes et espaces). La méthodologie combine des entretiens semi-dirigés, des observations participantes et l’analyse de documents … Lire la suite
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2025 — La réalisation de la particule négative NE en français montréalais : analyses comparatives des corpus oraux de 1971 à 2012Résumé
Ce mémoire porte sur l’une des variables linguistiques les plus fréquemment étudiées en français : la présence ou l’omission de la particule négative NE (±NE). Diverses contraintes, tant linguistiques que sociales, peuvent orienter le choix entre ces variantes. Pourtant, bien que de nombreuses recherches aient déjà exploré cette variable, la plupart se concentrent sur le français européen, tandis que les études quantitatives intégrant simultanément des facteurs linguistiques et sociaux dans le français montréalais demeurent rares. Afin de combler cette lacune, la présente étude s’appuie sur quatre corpus oraux de français montréalais recueillis successivement : celui de 1971 (corpus Sankoff-Cedergren; Sankoff … Lire la suite
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2025 — Toward neural networks that generalize systematicallyRésumé
Une caractéristique déterminante de l'intelligence humaine est notre capacité à généraliser de manière systématique --- c'est-à-dire généraliser à des exemples de test qui sont structurellement différents de ceux observés pendant l'entraînement. Cela nécessite souvent la capacité de combiner des composants connus de nouvelles façons pour des tâches compositionnelles, ou d'apprendre la bonne stratégie ou le bon algorithme de résolution de problèmes pour des tâches de raisonnement. Cependant, la généralisation systématique demeure un défi pour les systèmes d'apprentissage profond, qui sont puissants pour capturer les régularités statistiques dans les données, mais échouent lorsque ces modèles ne saisissent pas les véritables structures … Lire la suite
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2025 — Leveraging machine reading comprehension to mitigate hallucinations in answer generation by large language modelsRésumé
Les grands modèles de langage (LLMs), tels que GPT-4, ont démontré des capacités impressionnantes en compréhension et génération du langage naturel. Cependant, ils restent sujets à l’hallucination — produisant des réponses plausibles en apparence, mais non factuelles. Dans les tâches de questions-réponses fondées sur un document, les réponses peuvent ne pas être ancrées dans le texte fourni. En revanche, les systèmes traditionnels de compréhension de lecture automatique (MRC), comme Retro-Reader [78], excellent dans la sélection d’extraits de réponses, mais échouent souvent à détecter les questions non répondables ou à gérer des formulations paraphrasées. Ce mémoire examine si les forces complémentaires … Lire la suite
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2025 — Chromatin landscape and enhancer-gene interaction differences between three cardiac cell typesRésumé
Les études d'association à l'échelle du génome (GWAS) sont un outil efficace permettant aux chercheurs d'identifier les gènes pertinents pour la maladie. En effet, au cours des dernières décennies, elles ont permis d'identifier de nombreux polymorphismes d'un seul nucléotide (SNP) associés à des traits et à des maladies spécifiques. Néanmoins, il reste difficile de découvrir le véritable variant pertinent pour la maladie. L'une des principales difficultés rencontrées dans la hiérarchisation des SNPs pertinents pour une maladie à partir des études d'association pangénomique est que la majorité des variants sont situés dans des régions non codantes du génome, ce qui rend … Lire la suite
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2025 — L’impact du cannabis sur la symptomatologie psychiatrique des individus avec troubles mentaux gravesRésumé
D’après l’Organisation mondiale de la Santé, le cannabis est la drogue la plus consommée avec une prévalence d’usage qui s’élève à 219 millions de personnes à travers le globe, soit 4% de la population mondiale. Au Canada, la prévalence de l’usage du cannabis chez les personnes souffrant d’un trouble mental grave, c’est-à-dire un trouble psychotique, un trouble dépressif ou un trouble bipolaire, est nettement supérieure à celle dans la population générale. Or, la littérature scientifique actuelle associe la consommation du cannabis dans ce groupe de population spécifique à la détérioration de plusieurs symptômes psychiatriques et, conséquemment, à une aggravation du … Lire la suite