McGill University Theses and dissertations published in 2024

Les cellules bêta dérivées de cellules souches pluripotentes ont émergé comme une source potentiellement illimitée de cellules thérapeutiques pouvant être utilisées pour traiter le diabète de type 1 (DT1). Plusieurs dispositifs de transplantation ont été envisagés pour transplanter ces cellules de façon sécuritaire tout en assurant une bonne fonction de la greffe. Même si plusieurs dispositifs ont réussi à traiter le DT1 chez les rongeurs et les petits animaux, cette approche n’a pas encore été couronnée de succès chez l’humain. La mise à l'échelle des dispositifs de transplantation de cellules bêta pose des problèmes de transport de masse, en particulier …  Read more

Free choice items are quantificational determiner phrases (DPs) with seemingly variable quantificational force: in downward entailing contexts, free choice items contribute existential quantification, but in modal contexts they yield truth conditions stronger than those expected from existential DPs.An influential line of research (Chierchia, 2013) takes free choice items to be existential quantifiers that introduce into the semantic derivation a set of alternative meanings, which are used by an exhaustivity operator to strengthen truth conditions.This thesis probes into the nature of the exhaustification process associated with free choice items through the analysis of a number of DPs in Farsi (Indo-Iranian) that …  Read more

Sabok, Marcin (Supervisor2)  Read more

Au cours des dernières années, l’impérieuse nécessité de remédier à l’impact négatif du changement climatique sur l’environnement et la société humaine a conduit à la mise en œuvre de nombreuses mesures visant à réduire les émissions de gaz à effet de serre (GES) dans le secteur des transports. Parmi les politiques et stratégies mondiales visant à freiner les émissions de GES liées aux transports, l’adoption de véhicules électriques (VE) est devenue la politique publique de choix pour réduire ces émissions. La transition vers les VE se justifie plus particulièrement dans les régions dotées d’un secteur de l’électricité décarbonée et de …  Read more

Cullen, Kathleen E. (Supervisor2)  Read more

CONTEXTE: Les altérations de la fonction neuronale causées par les protéinopathies de la maladie d'Alzheimer (MA), l'amyloïde et le tau, sont irréversibles, la recherche s'est orientée vers les phases précliniques de la MA, avant l'apparition des troubles cognitifs et comportementaux. Comprendre l'interaction entre la pathologie de la MA et les mesures de la qualité du sommeil, un facteur de risque suggéré pour la MA, pourrait nous aider à adapter les interventions visant à réduire ou à arrêter l'accumulation de la pathologie de la MA pendant les premiers stades de la MA. La baisse de la qualité du sommeil est fréquente …  Read more

Omelon, Sidney (Supervisor2)  Read more

De Pokomandy, Alexandra (Supervisor1)  Read more

Technologies in dairy farms enable precise data collection, facilitating the detection of subtle changes in cow behaviour and health. They can help improve cows' welfare by identifying early signs of health issues and minimizing their dire effects. Although increasing movement opportunities through regular outdoor access can benefit cows in restricted movement environments, its daily implementation can be challenging. Moreover, there have been few studies on the effect of outdoor access on non-lame cows. The objectives of this study were 1) to evaluate the effect of low frequencies of outdoor access on the gait and hoof health of non-clinically lame cows …  Read more

Les illusions visuelles ont longtemps été étudiées comme moyen de donner un aperçu de la perception. Une illusion bien connue, la rivalité binoculaire, est ressentie lorsque deux images incompatibles et non fusibles sont présentées indépendamment à chaque œil. La perception alterne entre des périodes de domination presque complète d'une image, l'image alternative étant supprimée de la perception. Remarquablement, l’expérience de rivalité persiste même lorsque les images sont subdivisées et présentées en zones bistables complémentaires sur les yeux, un phénomène appelé regroupement interoculaire. Le premier chapitre propose une revue complète de la littérature sur ces illusions perceptuelles, mettant en évidence les …  Read more

The advent of high-throughput DNA sequencing has led to the emergence of long non-coding RNAs (lncRNAs) as a large class of regulators and effectors of cellular processes with roles in numerous diseases. One such example is HOX antisense intergenic RNA myeloid 1 (HOTAIRM1), which exhibits intriguing duality in cancer as it can act either as a tumor suppressor or an oncogene. Our objective was to investigate its post-transcriptional regulation, in order to set the groundwork for further studies looking into this cancer context-dependent duality. We began by establishing which alternatively spliced HOTAIRM1 isoforms are predominant in our models. We then …  Read more

Les thérapies à base d’acides nucléiques présentent un potentiel considérable pour lutter contre les maladies génétiques traditionnellement considérées comme «non-traitables». À ce jour, plus de vingt médicaments à base d’oligonucléotides (ON) ont reçu l’approbation clinique de la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis. Ces médicaments ON opèrent avec un large éventail de mécanismes, des vaccins à ARN messager (ARNm) aux antiviraux, reflétant des progrès significatifs au niveau des modifications chimiques permettant l’augmentation de la stabilité, de l’absorption cellulaire et la réduction des effets hors cibles.La dystrophie musculaire de Duchenne (DMD) est une maladie neuromusculaire causée par des mutations du …  Read more

Les planètes terrestres en orbite autour d'étoiles naines-M sont plus abondantes que celles en orbite autour d'étoiles semblables au Soleil, mais elles sont susceptibles de perdre une quantité importante d'eau dans l'espace en raison de l'irradiation plus élevée de leur hôte. L'irradiation dans les rayons X et l'extrême ultraviolet ("XUV") photodissocie les molécules d'eau et entraîne leur perte dans l'espace, en particulier lorsqu'une planète est chaude et que la vapeur d'eau est disponible dans sa haute atmosphère. Dans cette thèse, nous visons à prédire l'inventaire d'eau de surface --- étant un indice de premier ordre de l'habitabilité d'une planète terrestre …  Read more

Morrissey, Christy A. (Supervisor2)  Read more

Background: Alternative splicing (AS) is a key step in the expression of nearly all human genes. Perturbations of this tightly regulated process have the potential to result in abnormal phenotypes, such as cancer. Widespread splicing alterations have been detected across all known cancer types. Studies on large patient cohorts have found mutations in core splicing factors and RNA binding proteins (RBPs), as well as dysregulated expression of pro-oncogenic transcript isoforms. Despite the numerous AS alterations described so far, previous studies are impacted by unwanted sources of variation, such as tumour purity and patient demographics. Most available methods cannot incorporate additional …  Read more

The surge in the worldwide prevalence of major depressive disorder (MDD), exacerbated by the recent pandemic, among adolescents underscores their heightened vulnerability during this period of life - a phase marked by ongoing neuronal organization. This doctoral thesis addresses the pressing need to identify adolescents at risk for MDD by exploring molecular profiling of peripheral biosamples and early developmental trajectory differences driven by gene networks within the prefrontal cortex (PFC). Spanning five chapters, this research integrates multidisciplinary approaches to reveal markers implicated in psychopathology and identify measurable predictors of depression risk.Chapter 1 serves as the introduction, delving into the burden …  Read more

La transmission du SRAS-CoV-2 par les particules d'aérosols a été établie pendant la pandémie, mais demeure un important sujet de controverse. L'analyse du contenu biologique des bioaérosols dépend des dispositifs de capture des aérosols, mais les dispositifs existants sont généralement grands et encombrants, et n'étaient pas largement disponibles ou largement utilisés pour l'analyse des aérosols de SRAS-CoV-2. De meilleurs dispositifs de capture pourraient aider à identifier la prévalence des aérosols de SRAS-CoV-2 et pourraient également servir de base à un diagnostic non invasif de l'infection par COVID-19 et de l'infectiosité. Des efforts considérables ont été consacrés au développement de dispositifs …  Read more

Iyer, Srividya (Supervisor2)  Read more

Reza Sharif Naeini (Supervisor1)  Read more

Anxiety disorders, including generalized anxiety disorder (GAD), have been linked to an increased risk of developing cardiovascular diseases (CVD). Studies have shown that anxiety disorders can have a negative impact on the cardiovascular system, leading to changes in blood pressure, heart rate, and inflammation that can contribute to the development of CVD. Dysfunction or imbalances in the heart-brain axis have been associated with various diseases and conditions, including CVD, depression, and anxiety. Understanding and promoting the health of the heart-brain axis is important for maintaining overall health and well-being. Altered autonomic control, endothelial dysfunction and respiratory dysregulation seen in anxiety …  Read more

La régulation épigénétique est un mécanisme fondamental par lequel l'expression des gènes est régie dans tous les organismes eucaryotes. Un type de modification épigénétique est l’acétylation de la lysine, qui se produit au niveau des queues N-terminales des histones centrales, des levures aux humains. Les complexes multisous-unités de lysine acétyltransférase 6A (KAT6A) et KAT6B de mammifères sont des régulateurs transcriptionnels enzymatiques qui acétylent l'histone H3 au niveau de la lysine 23 in vivo. Dans les complexes, le facteur 1 contenant le bromodomaine et le doigt PHD (BRPF1) agit comme un échafaudage et sert d'activateur pour stimuler les activités acétyltransférase de …  Read more

Tabrizian, Maryam (Supervisor2)  Read more

Cette thèse présente un modèle de surmixage stéréo à multicanal en aveugle conçu pour préserver (ou éventuellement modifier) l'image stéréo du mélange stéréo original. Ce modèle est basé sur une formulation de la Synthèse de Champ Sonore (SCS). La SCS est une technique de reproduction sonore spatiale qui utilise un grand nombre de haut-parleurs pour créer un champ sonore physiquement précis dans une grande zone d'écoute ; par conséquent, elle a été privilégiée par rapport à d'autres techniques de reproduction sonore spatiale en raison de sa capacité à fournir une grande zone d'écoute avec une image spatiale précise.Le surmixage en …  Read more

Pineau, Joelle (Supervisor2)  Read more

IntroductionLung cancer remains the leading cause of cancer death worldwide and in Canada despite the advances in screening, diagnosis, and therapeutic options including minimally invasive surgery. The advanced median age at diagnosis and the common risk factors of smoking contribute to the high comorbidity burden among lung cancer patients, especially those with Chronic Obstructive Pulmonary Disease. Several risk stratification methods that make use of statistical models and clinical tests and measures have been developed but provide limited usefulness in selecting high-risk patients that would benefit from interventions perioperatively. Blood eosinophil counts have been used as a surrogate marker of airway …  Read more

Un propulseur ionique ou ventilateur EHD (électrohydrodynamique) est un transducteur électromécanique qui convertit l’énergie électrique en débit d’air ou en poussée. Les propulseurs ioniques traditionnels nécessitent des dizaines de milliers de tensions à fonctionner, ce qui entrave le déploiement commerciale de la technologie. La recherche porte sur la miniaturisation des propulseurs ioniques, ce qui réduit considérablement la tension de fonctionnement. Récemment, des propulseurs ioniques miniaturisés ont été envisagés pour construire de petits robots volants, souvent appelés "ionocrafts", sans pièce mobile et fonctionnant presque silencieusement. De plus, le petit facteur de forme et la faible consommation constituent un argument unique en …  Read more

Wise, Daniel (Supervisor2)  Read more

Vandna Sinha (Supervisor2)  Read more

Rahme, Elham (Supervisor2)  Read more

Smith, Donald L. (Supervisor1)  Read more

Beghin, Tom (Supervisor2)  Read more

Cyberbullying is a pervasive issue among adolescents that is frequently exacerbated by an inadequate support system. Teachers can play a crucial role in supporting cyber-victimized students; however, many teachers feel unprepared to effectively address cyberbullying, which can result in ineffective teacher responses towards cyber-victims. Consequently, many adolescents perceive their teachers as unhelpful which further discourages them from seeking help in school settings and leads to non-disclosure from students. Therefore, this research program aims to address this issue of non-disclosure by examining how adolescents perceive teacher support strategies and the conditions that maximize their receptiveness to such support. Two studies were …  Read more

La calorim ́etrie a` haute r ́esolution et haute granularit ́e joue un rˆole crucial dans l’avancement des d ́etecteurs de particules modernes. Ces d ́etecteurs sont essentiels pour des mesures pr ́ecises dans un large ́eventail de ph ́enom`enes physiques, y compris la d ́etection potentielle de la mati`ere noire et des particules de supersym ́etrie. La collaboration internationale CALICE a d ́evelopp ́e des prototypes de calorim`etres ́evolutifs pour r ́epondre aux exigences rigoureuses de ces d ́etecteurs. L’un de ces prototypes est le Calorim`etre Hadronique Num ́erique (DHCAL), optimis ́e pour la reconstruction d’ ́ev ́enements en …  Read more

Les hélicases à ARN à boîte DEAD (DDX) constituent la plus grande famille d’hélicases à ARN constituant 37 membres. Ils sont impliqués dans toutes les facettes de l’expression des gènes impliquant l’ARN. L'hélicase DDX comprend un noyau d'hélicase hautement conservé avec des domaines N-terminaux et C-terminaux étendus, qui déterminent leur activité dans le contrôle de l'expression des gènes. La dérégulation des hélicases DDX est impliquée dans divers cancers. Le ciblage de la synthèse des protéines (traduction de l'ARNm) est considéré comme une stratégie anticancéreuse viable, notamment pour resensibiliser les tumeurs résistantes aux agents de soins standards. L'étape limitante de la …  Read more

BackgroundWhile radiotherapy is considered a primary treatment for most head and neck cancers, it can cause debilitating side effects such as hyposalivation, mucositis, and limitation in the mouth opening. These side effects of radiation depend on several risk factors including the radiation dosage and field, tumor size and location, and the existence of temporomandibular disorders (TMD) in patients prior to their cancer diagnosis. Unfortunately, the quality of life of head and neck cancer patients drops dramatically due to TMD disorder symptoms, such as pain and limitation in mouth opening. The development of TMD disorders and hypofunction in oncology patients is …  Read more

Breast cancer is a leading cause of cancer in women, and comprises a range of histopathological and molecular subtypes differing in metastatic capacity, response to therapies, and clinical outcomes. In an effort to unravel the heterogeneity of the disease, the disease has been characterized by overexpression of hormone receptors (Luminal B) and human epidermal growth factor receptor 2 (HER2). Given the complexity of breast cancer, utilizing genetically engineered mouse (GEMMs) and patient-derived xenografts (PDX) models to recapitulate human disease has been instrumental in our understanding of the genetic and molecular bases underlying tumor initiation and progression. In this thesis, I …  Read more

Software products have become increasingly reliant on smaller software components produced by third-party organizations to accomplish specialized tasks. In this context, documentation is a crucial component of software development to mediate the knowledge exchange between developers who create reusable software components and those who rely on the components for their projects. Creating and maintaining good documentation, however, is an effort-intensive activity that is often overlooked in favor of working on the source code. Prior work has addressed this issue by proposing various methods to generate or to retrieve relevant information from a documentation set based on a query. These techniques …  Read more

Automated traffic and surrogate safety monitoring at urban intersections commonly use visual-spectrum video-based systems, which offer flexibility and low cost. However, video-based systems face challenges in low-light conditions and accurate distance measurement, requiring manual calibration for precise trajectories mapping in x-y coordinates. Recently, 3D LiDAR-based methods have emerged as an alternative, overcoming these limitations. LiDAR operates effectively in low light and provides direct and calibration-free measurements in x-y-z coordinates. LiDAR sensors yield more accurate spatial data with higher resolution and range than video-based systems. Additionally, LiDAR’s point cloud data can accurately represent road users’ shapes in three dimensions, enhancing the …  Read more

Tak Pan Wong (Supervisor2)  Read more

Le canola (Brassica. napus), l'une des principales cultures oléagineuses, est largement cultivé dans le monde entier. Cependant, la productivité des cultures de canola a diminué dans des conditions stressantes dues au changement climatique. Il est donc essentiel de développer des stratégies durables pour aider les plantes à faire face aux facteurs de stress environnementaux. Les micro-organismes favorisant la croissance des plantes (PGPMs) et les composés spécifiques qu'ils produisent pourraient avoir la capacité d'atténuer les effets néfastes des conditions de stress sur les plantes. Un exemple dans ce contexte est la Thuricine 17 (Th17), une bactériocine produite par Bacillus thuringiensis NEB17 …  Read more

Objectif L'objectif de cette étude est d'observer de nouvelles innovations de régions intrinsèquement désordonnées (RDI), de domaines de type prions (PLD) et de domaines de composition biaisée (CBD) chez les animaux, et d'analyser des études de cas spécifiques: protéines circadiennes et protéines liées à la maladie. MéthodesUne analyse systématique a été menée en utilisant 58 protéomes dispersés dans différents clades du règne animal pour observer les IDR, les PLD et les annotations CBD dans les protéines de leur groupe orthologue à chaque niveau de clade, connu sous le nom d'orthogroup, remontant l'arbre kingdom’s. L'altération significative de ces domaines dans le …  Read more

Le traumatisme craniocérébral céréléger (TCCL) perturbe la structure et la fonction de plusieurs des barrières cellulaires du système nerveux central tel que la barrière cérébro-vasculaire. Cependant, l’impact du TCCL sur la barrière cérébro-ventriculaire, une barrière a perméabilité partielle entre le cerveau et le liquide céphalo-rachidien et composée de cellules épendymaires, n’est pas bien étudié. Récemment, nous avons démontré qu’à la suite d’un trauma cérébral, les cellules épendymaires expriment le γH2AX, un rapporteur de cassure double brin de l’ADN. Cependant, l’effet de ce changement cellulaire sur la fonction et structure des cellules épendymaires reste à explorer. Dans cette étude, nous avons …  Read more

La séparation de sources audio vise à récupérer les signaux produits par des sources sonores individuelles à partir d'un enregistrement des sons mixés ensemble. Cette technologie inspirée de la perception est largement applicable à la musique, à la parole et aux sons naturels car ils sont souvent un mélange linéaire de sons plus simples et parce que les sons individuels sont plus faciles à interpréter que leur mélange. Une représentation structurée des mélanges sonores a de nombreuses applications musicales car elle permet un traitement avancé des sources sonores individuelles et l'analyse des enregistrements polyphoniques. La recherche sur la séparation de …  Read more

La lombalgie est un trouble musculo-squelettique courant dont le pathomécanisme reste inconnu. Actuellement, il existe peu de biomarqueurs permettant de diagnostiquer et de suivre l'évolution de la lombalgie. Des recherches antérieures portant sur les tissus mous de l'appareil locomoteur affectés par la lombalgie ont mis en évidence de nombreuses modifications des propriétés mécaniques des tissus mous. De tels changements au sein du système musculo-squelettique peuvent indiquer un biais de répartition des contraintes et, par conséquent, une protection physiologique contre les contraintes. La présente recherche étudie les changements dans les propriétés mécaniques des tissus mous affectés par la lombalgie afin d'explorer …  Read more

Background: Studies have suggested that human papillomavirus (HPV) vaccine-induced humoral immune responses protect against subsequent HPV infections and consequently reduce the risk of HPV-related abnormalities. However, the dynamics of naturally acquired HPV seroreactivity and its impact on HPV acquisition among unvaccinated couples remain poorly understood. Objectives: Manuscript 1 introduces sample-specific modeling approaches to explore the heterogeneity of HPV seroreactivity in unvaccinated sexually active females. Manuscript 2 examines the association between naturally acquired HPV seroreactivity and HPV transmission among heterosexual couples. Methods: The HPV Infection and Transmission among Couples through Heterosexual activity (HITCH) cohort study collected serum L1 antibody titer, genital …  Read more

Le Concerto pour Hautbois et Ensemble à Vent est orchestré pour hautbois solo et un ensemble à vent de trente-huit musiciens. Inspirée par la nouvelle d'Edgar Allan Poe intitulée "Le Cœur révélateur", la forme narrative globale de l'œuvre est linéaire. Elle commence en établissant une atmosphère glauque par le biais d'une texture légère, puis évolue continuellement vers des textures plus complexes et épaisses, culminant en un climax final et furieux. Celui-ci se libère en se dissipant jusqu'à la fin. Pour la décrire plus formellement, la pièce montre un côté plus historique dans le traitement de la relation entre le soliste …  Read more

Récemment, l'apprentissage par renforcement (RL) est devenu le cadre de choix pour l'apprentissage par essais et erreurs dans des environnements dynamiques très complexes tels que le jeu, la conduite autonome et la biologie moléculaire \cite{surveyapplied}. L'apprentissage par renforcement hiérarchique (HRL) décompose un problème d'apprentissage par renforcement en sous-tâches en utilisant des abstractions temporelles ou d'état, dans lequel le contrôle de niveau supérieur appelle des sous-tâches de niveau inférieur comme s'il s'agissait d'actions primitives \cite{sammut2011encyclopedia}. La HRL bénéficie en particulier dans les situations où les sous-problèmes sont petits et très répétitifs, car une solution à un sous-problème peut être recyclée à …  Read more

BACKGROUND: In Canada, 60% of people aged 16 years and older are characterized as having low health literacy (HL) which impacts health outcomes and overall health status. Children of parents with low HL experience more emergency visits, brush their teeth less frequently, and are more likely to eat less nutritious food. In an attempt to overcome literacy issues and combat the barriers to information access affecting individuals with low HL, it has been advised that healthcare providers tailor the literacy requirements of their recommendations to the literacy levels of their patients through the dissemination of health videos. This can mitigate …  Read more

There is often a dichotomy between fairness and efficacy: fair algorithms may proffer low social welfare solutions whereas welfare optimizing algorithms may be very unfair. This issue is ex- emplified in the machine scheduling problem where, for n jobs, the social welfare (namely, the total sum of completion times) of any fair solution may be a factor Ω(n) worse than the opti- mal welfare. In this paper, we prove that this dichotomy between fairness and efficacy can be overcome if we allow for a negligible amount of bias (unfairness): there exist algorithms that are both “almost perfectly fair” and have …  Read more

Cette thèse explore les défis de la conception d’instruments de musique numériques (DMI) fiables et robustes pour une utilisation à long terme. Les techniques et les cadres d'autres domaines de l'ingénierie, tels que l'ingénierie des systèmes et de la fiabilité, sont examinés pour déterminer leur adéquation dans un contexte de technologie musicale. Le concept de taux d'interruption de la pratique est discuté comme moyen d'analyser la fiabilité et la disponibilité du DMI. Un cadre d'ingénierie système a été utilisé pour concevoir le T-Stick 5GW, la cinquième génération du T-Stick, un contrôleur gestuel conçu au milieu des années 2000 au laboratoire …  Read more