McGill University Theses and dissertations published in 2024

Polyadenylation is a mRNA maturation process that involves the addition of a poly(A) tail after a polyadenylation signal (PAS) located in the 3’-untranslated region (3’-UTR) of pre-mRNAs. Alternative polyadenylation (APA) is the production of varying 3'-UTR isoforms of an mRNA using distinct PAS in pre-mRNAs. Studies show that cancer cells use shorter 3’-UTR APA isoforms. Several authors predict that this global shortening of 3’-UTRs contributes to cancer development, a theory that is challenged by the fact that 3’-UTR shortening also occurs in healthy proliferative cells through APA. This raises the question of whether 3’UTR shortening is a cause or an …  Read more

Long, Thavy (Supervisor2)  Read more

L'embolisation endovasculaire est une procédure médicale peu invasive utilisée pour occlure un vaisseau sanguin malade. Cependant, les agents emboliques actuels sont limités dans leur utilisation et ont été associés à une mauvaise biocompatibilité et à de faibles propriétés mécaniques. Inspirés par les caillots sanguins autologues—utilisés par les premiers pionniers de l'embolisation—nous présentons les Caillots Sanguins Ingénierée (Engineered Blood Clots, EBC), comme un nouveau matériau embolique temporaire conçu pour tirer parti des avantages inhérents aux caillots autologues, tout en offrant la robustesse et la précision d'une solution ingénierée. Les EBC sont formés à l'aide de la chimie bioorthogonale, qui permet la …  Read more

This thesis describes efforts toward iminium ion catalysis of the Claisen rearrangement with a diazepane carboxylate catalyst developed within the Gleason group and illustrates a modular synthetic approach towards chiral hydrazide catalysts.Previously in our group, we have applied a diazepane carboxylate catalyst in iminium ion catalysis of various reactions such as the Cope rearrangement, the Diels-Alder reaction and polyene cyclizations. Inspired by our success in organocatalysis of these reactions, and others, we sought to apply the diazepane carboxylate catalyst to the Claisen rearrangement. The Claisen rearrangement is a [3,3] sigmatropic rearrangement in which a single bond is broken and a …  Read more

This thesis aims to explore evidence of Odawa lifeways, or elements of daily life and sustenance practices, in the Waganakising Village during the 1740s from phrases related to agriculture, hunting, and mobility in Father Pierre-Luc Du Jaunay’s (c. 1705-1780) Odawa-French dictionary titled Dictionarium Gallico-ȣtaȣaku[m] (1740). Father Du Jaunay missionized among Odawa in Michilimackinac from around 1735 until 1765, following the community to what the French called the L’Arbre Croche region situated along the Northwest coast of Lake Michigan around 1741. Du Jaunay’s influence remained in the generational memory of the same community from the 1740s until the 1830s. This lasting …  Read more

Frigon, Dominic (Supervisor1)  Read more

Sabor, Peter (Supervisor1)  Read more

Cette thèse explore un seul artefact pour contribuer à l'histoire architecturale des institutions d’aide aux femmes pauvres à Montréal: le registre des maisons d'hébergement de Montréal. Que révèle l'étude ciblée d'un registre sur les femmes et l'architecture à Montréal au 19e siècle ? Que suggère le registre sur la façon dont les différentes classes sociales percevaient l’architecture, la côtoyer dans la vie de tous les jours ? Contrairement aux histoires traditionnelles de l'architecture qui focalise sur les projets d'architectes éminents ou sur les typologies, cette étude soutient que la narration, fondée sur les données du registre et animée par des …  Read more

Existing academic literature describes that domestic social program spending is comparable with foreign development aid contributions but no conceptual connection between the two kinds of spending is made explicit by the Government of Canada. This paper analyzes literature on social policy and two international development studies (IDS) concepts - development economics and dependency theory - for conceptual similarities in the Canadian context. The paper then examines the case of Employment Insurance (EI) and Atlantic Canada’s experience with EI. Atlantic Canada was selected as a case because it has comparatively high levels of unemployment and high rates of EI use. This …  Read more

Type 1 diabetes is an autoimmune disease characterized by the destruction of pancreatic beta cells. The only current treatment is lifelong intensive insulin replacement therapy. Technological advances in the last few decades have allowed for increases in treatment satisfaction and efficacy both in the sphere of multiple daily injection therapy and continuous subcutaneous insulin infusion therapy. However, all current methods require carbohydrate counting, a widespread prandial bolus management technique, that is both tedious and error-prone and contributes to disease burden. Despite the advancements, most pediatric, and adult populations living with type 1 diabetes fail to reach glycemic targets, particularly of …  Read more

L'étude actuelle traite de la pénurie des enseignants au Japon dûe à un taux croissant d’attrition. Une revue approfondie de la littérature indique que les enseignants quittent leur profession en raison de plusieurs facteurs. La première raison est une charge de travail intense qui les épuise physiquement et mentalement. Des niveaux élevés de stress liés au travail vécus par les enseignants sont régulièrement associés à des résultats négatifs, notamment une diminution de la qualité de l'enseignement, une altération du bien-être et de la santé des enseignants, et finalement, l'épuisement professionnel. Par conséquent, cette étude explore l'épuisement professionnel des enseignants comme …  Read more

Bertone, Armando (Supervisor2)  Read more

Le béton poreux biocompatible est un type spécialisé de béton poreux qui possède des propriétés mécaniques et hydrologiques adaptées à la croissance des plantes et à l'établissement de la végétation. Le béton poreux est de plus en plus répandu en milieu urbain pour contrôler les écoulements d'eaux pluviales, en raison de sa capacité à faciliter l'infiltration de l'eau à travers sa structure poreuse. Les recherches actuelles sur le béton poreux portent également sur sa capacité à favoriser la germination et la croissance des plantes, principalement des graminées. Les applications du béton poreux capable de supporter la vie végétale ont été …  Read more

L'évaluation de la similarité substantielle entre les éléments protégeables de deux œuvres dans les affaires de violation du droit d’auteur est intrinsèquement imprécise, entraînant souvent des jugements subjectifs et des résultats incohérents. Cependant, l’application de l’intelligence artificielle (IA) offre des solutions innovantes aux défis posés par l’analyse experte dans les affaires de violation du droit d'auteur, en particulier celles impliquant des œuvres musicales. L’IA promet de favoriser la cohérence, l’objectivité et la précision dans les affaires de droit d’auteur musical, en répondant aux préoccupations de longue date liées aux témoignages d’experts et à l’interprétation judiciaire. Ce mémoire explore la relation …  Read more

Plasmodium falciparum is an obligate parasite that causes the most severe form of malaria in humans and several aspects of the immunopathology of this deadly disease remain unknown. As such, malaria prevention, control and elimination strategies are impeded. A new aspect of the parasites biology has come to light in recent research which involves the release of extracellular vesicles (EVs) from P. falciparum-infected red blood cells (RBCs). EVs are small membrane bound particles that contain functional biomolecular cargo and serve as a means of communication between and within cell populations. This biomolecular cargo is heterogenous, and largely depends on the …  Read more

Goad, Heather (Supervisor2)  Read more

Population-level analyses are inherently complex due to a myriad of latent confounding effects that underlie the interdisciplinary topics of research interest. Despite the mounting demand for generative population models, the limited generalizability to underrepresented groups hinders their widespread adoption in downstream applications. Interpretability and reliability are essential for clinicians and policymakers, while accuracy and precision are prioritized from an engineering standpoint. Thus, in domains such as population neuroscience, the challenge lies in determining a suitable approach to model population data effectively. Notably, the traditional strata-agnostic nature of existing methods in this field reveals a pertinent gap in quantitative techniques that …  Read more

Razek, Tarek (Supervisor2)  Read more

ContexteLa nourriture est essentielle pour tous, servant de source de subsistance, d’indulgence occasionnelle et de moyen de définir son identité culturelle. Une alimentation appropriée est un droit fondamental pour chaque enfant. Les expériences alimentaires des enfants influencent leur compréhension d’eux-mêmes et de leur environnement, impactant leurs besoins nutritionnels. Comprendre les expériences alimentaires des enfants ayant des difficultés à avaler et les facteurs qui les influencent est crucial. Le modèle transactionnel de développement de Sameroff, qui met l'accent sur les interactions entre les enfants et leur environnement, souligne l'importance de l’environnement relationnel des enfants, notamment les interactions avec les familles et …  Read more

Prostate cancer is a significant public health concern in the United States and globally, causinga substantial number of male deaths each year, ranking second in terms of cancer−relatedmortality. Focal therapy, an emerging approach in prostate cancer treatment, aims to ablatemalignant tissues while preserving the neighboring healthy tissues precisely. Photothermaltherapy holds promise as a focal treatment option for prostate cancer, overcoming thelimitations of conventional therapies through nanoparticle−based approaches. Despite recentadvancements in the development of diverse photothermal agents, further progress is urgentlyrequired in photothermal therapy. These photothermal transducers should possess the abilityto absorb near−infrared (NIR) light and convert it into heat, enabling …  Read more

In its broad definition, active sensing consists of the integration of all sensorimotor inputs that lead to a specific behavior. Classic examples of it are echolocation used by bats and dolphins to optimally navigate their environment and eye movements in that pair with visual perception in mammals. In the central nervous system, one of the main neurotransmitters, acetylcholine (Ach), acts through nicotinic and muscarinic receptors (mAchRs) to regulate cortical signaling. This Ach-mediated signaling contributes to many cognitive processes and is critical to sensorimotor control. In the nematode Caenorhabditis elegans, we identified a small circuit that integrates both sensory and motor …  Read more

Beluga is a functional programming language and proof assistant for specifying formal systems in contextual LF, an extension of the Edinburgh Logical Framework, and mechanically proving theorems about them using recursive programs.To facilitate the incremental development of proofs with commands and automation tactics, the Harpoon interactive proof environment is subsequently implemented as a read-eval-print loop with structural editing features over Beluga programs.Due to architectural limitations in the implementation of Beluga and Harpoon, top-down and out-of-order proof development sessions can lead to invalid proof states and unsound translated programs.This thesis reports on technical challenges and solutions to soundly implementing the structural …  Read more

This thesis comprises three interconnected projects addressing challenges in multi-label classification and temporal graph learning. In the first project, we tackle the challenge of modelling label dependencies in multi-label classification. We introduce a graph-based dependency module that is capable of modeling multiple types of relations. The module can be incorporated in embedding-based multi-label classification methods, leading to Relation Guided Message Passing (RGMP), a novel multi-label classification approach. We demonstrate via experiments that the proposed method achieves superior or comparable performance to state-of-the-art methods across all studied datasets, without imposing substantial additional model complexity or computational overhead. This emphasizes the importance …  Read more

IMPORTANCE: Our understanding of the composites of technical expertise during spinal procedures including the insertion of pedicle screws is incomplete. Datasets generated from surgical simulation allows the quantitation of psychomotor skills, which can be analyzed using machine learning algorithms which allows a more complete understanding of surgical performance.OBJECTIVE: The primary aim of this study was to identify important features distinguishing skilled and less skilled levels of expertise during simulated pedicle screw insertion. The secondary aim was to benchmark the classification accuracy of surgical performance through the implementation of machine learning algorithms.DESIGN: Participants from four universities were recruited between July 15, …  Read more

Neslehova, Johanna (Supervisor1)  Read more

In this thesis, we explore the development of methods for efficient continual learning, to enable the sequential acquisition of knowledge by artificial intelligence (AI) systems as they adapt to new information over time. In the first chapters, we investigate approaches to address challenges posed by rehearsal-based methods in overcoming catastrophic forgetting, a major obstacle faced by deep neural networks when learning sequentially. We propose a Maximally Interfered Retrieval (MIR) method to optimize the efficiency of the replay step, which retrieves samples from the replay buffer whose prediction will be the most impacted by the foreseen parameter update on the newly …  Read more

Background: Patients undergoing major cardiac surgery face a significant risk of rehospitalization, often due to complications related to dysregulated immune responses and ineffective cardiac repair. Despite direct implications in cardiovascular health and immunity, the role of the gut microbiome in cardiac surgery recovery remains largely unexplored. In a surgical setting, gut microbiota are vulnerable to extrinsic stressors that may promote microbial disorder. This study explores the post-surgical gut microbiome and its potential to exacerbate systemic inflammation and promote adverse cardiac remodeling, with a focus on sex-specific responses. Further, it examines the therapeutic potential of perioperative high resistant starch (RS) supplementation …  Read more

Dumont, Marie-Josée (Supervisor2)  Read more

Liquid chromatography coupled with high-resolution mass spectrometry (LC-MS) has become a workhorse in global metabolomics studies with growing applications across biomedical and environmental sciences. However, outstanding bioinformatics challenges for global metabolomics data processing remain critical barriers to the wider adoption of this technology. These challenges include optimal raw spectral MS processing, tandem MS (MS/MS) spectral deconvolution, and accurate function analysis of global metabolomics. This thesis aims to address these challenges by developing multiple bioinformatic tools and platforms, and bridging auto-optimized raw spectra data processing to yield accurate functional insights.Firstly, an auto-optimized raw LC-MS spectra processing workflow was developed in an …  Read more

Les récents progrès en matière d’intelligence artificielle ont mis en évidence les atouts des grands modèles pré-entraînés dans diverses applications. Cependant, ces modèles ont souvent du mal à gérer les transformations des données d'entrée, ce qui est crucial pour les tâches exigeant l'invariance ou l'équivariance. Repenser chaque composant des architectures existantes pour atteindre l'équivariance est difficile et coûteux en termes de calcul. Nous étudions le cadre de canonisation pour la conception d'une architecture équivariante et proposons une nouvelle régularisation préalable pour aligner les entrées canoniques avec les orientations présentes dans les ensembles de données de pré-entraînement. Les résultats expérimentaux indiquent …  Read more

Lee, Fu-Hua Lawrence (Supervisor1)  Read more

Le bon fonctionnement du placenta - un organe qui fait le lien entre la mère et le fœtus - est crucial pour le bon déroulement de la grossesse. Le transport à travers cette barrière placentaire est contrôlé par le syncytiotrophoblaste qui est une cellule unique multinucléée formée à la suite de la syncytialisation ou de la fusion de cellules cytotrophoblastes individuelles. Par conséquent, une fusion incorrecte peut entraîner plusieurs complications associées à la grossesse, notamment la prééclampsie. Bien que la fusion in vivo se déroule avec succès tout au long de la grossesse, l'utilisation de cellules fusionnées pour l'expérimentation in …  Read more

Whiplash injuries are the most common form of injury following a motor vehicle collision. The risk of developing chronic pain following whiplash injury remains high, with as many as 50% of individuals continuing to report symptoms one year following injury. Over the past two decades, research has accumulated showing that psychosocial factors play a significant role in the experience of pain and disability associated with whiplash injury. In particular, pain catastrophizing has emerged as one of the most robust psychological predictors of problematic recovery following whiplash injury. However, research has yet to elucidate the pathways through which pain catastrophizing impacts …  Read more

Le cortex moteur primaire est organisé de façon somatotopique avec les muscles des membres supérieurs représentés latéralement sur le dessus du cortex, alors que les muscles des membres inférieurs sont représentés sur l’aspect médial du cortex, dans la fissure longitudinale, près de leurs représentations controlatérales. Cette disposition entrave l’application de la stimulation magnétique transcrânienne (SMT) aux représentations motrices des membres inférieurs, tels que le tibial antérieur (TA), un muscle important la dorsiflexion de la cheville qui contribue grandement à la marche et à l’équilibre. La proximité entre la représentation motrice du TA droit et du TA gauche représente une opportunité …  Read more

La biologie cellulaire est une interaction complexe de protéines, d'ADN, d'ARN et d'autres matériaux cellulaires distincts qui contribuent tous à l'objectif principal de la survie et de la reproduction. Plusieurs processus cellulaires se produisent en parallèle pour atteindre cet objectif principal. Ces processus peuvent aller de la réplication efficace de l'ADN au métabolisme, en passant par le transport, le mouvement et la détection de l'environnement. Il ne s'agit en aucun cas d'une liste complète, mais elle décrit néanmoins la diversité des activités qui se produisent dans les cellules à un moment donné. Une question simple se pose : comment la …  Read more

Contexte: Le cancer du sein est l'un des cancers les plus courants chez les femmes au Canada, car on estime que 1 femme sur 8 développera cette maladie. Alors que la mortalité globale par cancer du sein a diminué au cours des dernières décennies, des différences dans l'efficacité du traitement ont été observées chez les patientes atteintes de certains problèmes de santé préexistants, comme le diabète de type 2 (DT2). Cependant, l'association entre le DT2 et la mortalité par cancer du sein, par rapport aux non-diabétiques, n’est pas concluant. De plus, les patients atteints de DT2 s’agissent d'un groupe hétérogène …  Read more

In the past few decades, the textile industry has become very prominent, but it poses certain environmental challenges, including higher greenhouse gas emissions and leaching of toxic chemicals from waste accumulation and incineration processes. Cotton is a common material used in the textile industry, and recycling waste cotton fabrics is possible due to the cellulose-rich composition of cotton fibers. Cellulose is the most abundant natural polymer and an ideal candidate for the fabrication of hydrogels with robust mechanical strength, water retention capacity, and thermal stability. This study highlights the potential of employing cellulose-based hydrogels produced from waste cotton fabrics as …  Read more

Dans plusieurs juridictions, des réformes judiciaires visent à encourager le règlement à l’amiable à l’extérieur des tribunaux. Cette étude porte sur l’impact de telles réformes au Québec, en particulier l’adoption de nouveaux codes : de procédure civile, en 2016, et de déontologie en 2015. Ces réformes changent-elles la culture juridique professionnelle des avocats ? Cette étude pose un regard à la fois externe et interne sur la profession d’avocat, en intégrant deux cadres conceptuels issus des Cultural legal studies et de la sociologie du droit. Elle examine les influences culturelles et médiatiques sur l’image de l’avocat et les dynamiques internes …  Read more

New methods for making sense of movement data continue to emerge in response to unprecedented volume of geographic information on moving objects. Geo-computational techniques, including spatial agent-based models, are presented with new opportunities for innovation as people, animals, vehicles, and countless other objects are tracked across space and time at an ever-expanding scale and resolution. This thesis explores algorithmic approaches to agent-based modelling animal movement. Algorithmic approaches to informing, calibrating, and/or validating agent-based models of spatial systems are an open area of research in geographic information science. Following an introduction to animal movement and the objectives of this thesis (chapter …  Read more

Un convertisseur tension-courant (VI) a été conçu pour permettre l'intégration d'un capteur de température dans un dispositif portable avec une interface analogique préexistante. Un capteur PPG déjà implémenté dans le dispositif portable produit un courant qui est ensuite traité par l'interface analogique. Le capteur de température intégré produit des données en tension, donc plutôt que de créer une nouvelle interface analogique capable de traiter les données de voltage du capteur de température, ce qui nécessiterait plus d'espace silicium et consommerait plus d'énergie, il est plus judicieux de concevoir un convertisseur VI qui générera un courant proportionnel lisible par l'interface analogique …  Read more

Komarova, Svetlana (Supervisor2)  Read more

The 2022 defamation trial between actor Johnny Depp and his former wife, Amber Heard, caused a deluge of social media content, the majority of which was strongly in support of Depp. This project explores the reactions to the Depp-Heard trial on the social media platform TikTok, where fans of Depp and fans of Heard argued their points of view via the short-video construct of the site. Through a qualitative analysis using TikTok videos as ‘texts,’ this project identifies the different narrative categories and technical affordances people use to support their chosen celebrity on the platform. Drawing on research from fandom …  Read more

Hebert, Terence (Supervisor2)  Read more

Bien qu’elle soit cruciale pour atteindre les objectifs mondiaux en matière de développement durable, la durabilité sociale est considérablement sous-étudiée dans le génie des bioressources. L'évaluation du cycle de vie environnementale (E-LCA) est souvent utilisée dans ce domaine pour évaluer les impacts environnementaux des produits et des procédés de transformation et de production des produits. Les méthodes et les données pour cet outil d'évaluation sont bien développées. Par contre, l’analyse du cycle de vie social (S-LCA) est un protocole plus récent avec des méthodes et des sources de données moins développées. Cette thèse présente plusieurs discussions connexes sur l'application de …  Read more

Inspired by Thailand’s long-standing struggle for democracy and the middle class’ recent astonishing support for military coups and the pro-regime Palang Pracharath party, this study examines how authoritarian regimes pursue consent from citizens. It argues that although coercion and electoral manipulation are important tactics frequently employed by authoritarian regimes, authoritarian incumbents solidify power and institutionalize themselves during a transition by acquiring consent from citizens. Voter consent bestows legitimacy to authoritarian incumbents, which in turn buttresses regime stability. Focusing on Palang Pracharath’s surprise “victory” in Thailand’s 2019 general elections, this study finds that voter consent stems from three primary sources—the MP …  Read more

L'autophagie est une voie de dégradation cellulaire induite en situation de stress métabolique, un processus essentiel pour la régulation de l'homéostasie et de l'invasion cellulaire. Dans le cancer, l'autophagie peut favoriser la progression de la tumeur ou la supprimer, principalement en fonction du grade de la tumeur. Dans l'autophagie sélective, des cargaisons spécifiques sont ciblées pour être dégradées par autophagie, à l'aide des protéines de la famille ATG8 qui s'engagent avec les protéines à dégrader, souvent avec des protéines réceptrices de cargaison. Notre laboratoire a précédemment établi qu'un orthologue peu étudié de la famille ATG8, LC3C, cible sélectivement le récepteur …  Read more

Avec l'augmentation de la population bilingue et multilingue au Canada, les chercheurs et les éducateurs ont, ces dernières années, accordé beaucoup d'attention aux approches plurilingues qui encouragent les apprenants à utiliser l'ensemble de leurs répertoires linguistiques et culturels (May, 2014 ; Lau & Van Viegen, 2020). Cependant, la mise en œuvre de ces approches est considérablement influencée par la compréhension et les perceptions que les enseignants en ont. Des études antérieures ont démontré que les enseignants avaient des attitudes positives à l'égard du plurilinguisme, mais qu'ils étaient encore réticents à l'appliquer dans la pratique (Galante et al., 2020 ; Maatouk …  Read more

Cette thèse propose une étude de l’opérette française de 1854 à 1919. Elle cherche à mettre en lumière la dynamique qui a guidé la définition de l’opérette française – une entreprise manifestement difficile. Adoptant la méthode marxiste du matérialisme historique, elle soutient que l’opérette française est un genre né à un moment particulier de l’histoire de l’opéra français et qui en est venu à incarner certaines contradictions fondamentales de ce moment. Apparue à une époque où l'ancien système de genres et de théâtres étroitement contrôlés commençait à s'effondrer, l'opérette est apparue comme un nouveau type de genre, fortement marqué, d'une …  Read more

Quatre décennies après son adoption, la Charte canadienne des droits et libertés (la « Charte canadienne ») continue de se révéler insuffisante pour améliorer les conditions de vie des communautés marginalisées et vulnérables. Cette thèse examine comment le contrôle constitutionnel législatif – c'est-à-dire, l’examen effectué par le législateur lors de l'élaboration des projets de lois pour évaluer leur compatibilité avec la Charte canadienne – pourrait limiter l'adoption de lois portant atteinte aux droits des groupes marginalisés. Cette thèse s’éloigne de l'approche légaliste qui prévaut en matière de protection des droits et qui attribue aux tribunaux la principale responsabilité de donner …  Read more

Introduction: La maladie pulmonaire obstructive chronique (MPCO), la maladie respiratoire chronique la plus répandue, a un impact significatif sur la santé des patients et réduit leur niveau d'activité physique. La réadaptation pulmonaire est l'une des clés de voûte de la prise en charge de la MPCO, mais son efficacité est limitée en ce qui concerne l'augmentation des niveaux d'activité physique (AP). Les obstacles individuels limitent considérablement la participation aux programmes d'activité physique, et les méthodes traditionnelles d'évaluation de ces obstacles ne tiennent pas compte des expériences spécifiques des patients. La prise de décision partagée (PDP) pour lever les obstacles à …  Read more