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2024 — Neural and oculomotor dynamics of perceptual filling-inRésumé
Les illusions sensorielles permettent d'étudier la manière dont nos systèmes perceptifs appréhendent le monde extérieur. Le remplissage perceptif est une illusion visuelle fascinante dans laquelle le contenu visuel, tel que la couleur ou la luminance, semble s'étendre dans l'espace visuel lorsque le regard est fixe. Ce phénomène procède en deux étapes dont les mécanismes neuronaux ne sont pas encore compris. Premièrement, la disparition lente des contours ; deuxièmement, la diffusion rapide du contenu d’une partie de l’image à travers le contour maintenant disparu. La première étape nécessite de longues périodes de fixation stricte du regard et dépend donc de l'adaptation … Lire la suite
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2024 — Understanding the influence of uL29 and ACP in TnsD stability and DNA bindingRésumé
Les éléments transposables sont des segments génétiques capables de se déplacer dans les génomes, constituant de grandes fractions du code génétique dans différents organismes. La famille bactérienne Tn7 des transposons détient un grand potentiel pour être utilisée comme outil génétique en raison de leurs mécanismes de ciblage très sophistiqués. L’élément canonique Tn7 codes cinq protéines pour faciliter la transposition : TnsA, TnsB, TnsC, TnsD et TnsE. TnsA et TnsB forment ensemble la transposase (TnsAB) et catalysent le mouvement du transposon à l’aide d’un mécanisme de couper-coller. Pour devenir active, la transposase doit être recrutée par TnsC, qui agit comme un … Lire la suite
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2024 — Compact, fabrication-resilient inverse-designed wavelength demultiplexers in silicon-on-insulator technologyRésumé
Silicon photonics enables the design and fabrication of photonic circuits using methods similar to those of complementary metal–oxide–semiconductor (CMOS) electronic circuits, allowing lower fabrication costs and smaller device footprints by reusing mature design methods that have been refined over decades in the electronic field. Silicon photonics can be combined with the modern method of inverse design, which leverages new software tools that allow for fast, accurate physical simulations to design unintuitively shaped devices that have high performance despite their lack of resemblance to most common photonic devices. The combination of these two technologies enables the fabrication of physical photonic devices … Lire la suite
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2024 — Comorbidity Clusters in Congenital Heart Disease Patients - Accelerated Disease Trajectories Across the LifespanRésumé
ContexteLa recherche a montré que les patients atteints de cardiopathie congénitale (CHD) sont à risque de développer des complications cardiaques et systémiques. Aucune méthode n’a été identifiée pour mesurer les trajectoires de la maladie pour les complications cardiovasculaires et systémiques tout au cours de la vie. Dans cette étude, nous abordons la séquence temporelle et les interrelations entre les clusters de comorbidités pour explorer les trajectoires de développement des comorbidités chez les patients atteints de CHD tout au long de leur vie. Les résultats fourniront des informations potentiellement utiles pour prédire les résultats de santé à long terme dans cette … Lire la suite
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2024 — Regex solving using GPGPU with CUDARésumé
La correspondance d'expressions régulières (RE) est une tâche informatique intensive qui peut bénéficier des capacités modernes de calcul haute performance et concurrentiel. Il y a déjà eu des efforts d'optimisation liés, comme HyperScan, qui est basé sur des instructions SIMD pour les CPU, et des algorithmes comme iNFAnt et ASyncAP qui ciblent les GPU, améliorant les performances en exploitant la correspondance entre les RE et leurs représentations en machine à états finis. Cependant, les méthodes d'accélération des RE basées sur les GPU peuvent souffrir de coûts d'exécution élevés lorsque l'expression régulière a de nombreuses transitions d'état potentielles initiales, et les … Lire la suite
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2024 — Boundary Treatment for Anisotropic All-Quad Mesh Adaptation through an Lp-CVT ApproachRésumé
En dynamique des fluides numérique (CFD), la réalisation de simulations très précises et efficaces nécessite souvent l'application de stratégies adaptatives de raffinement du maillage. En particulier, les maillages tout quad sont largement reconnus pour leur capacité à réduire la complexité des formulations de produits tensoriels par rapport aux triangles, ce qui en fait un choix privilégié pour la méthode Galerkin discontinue. Néanmoins, la génération et l'adaptation de tels maillages à proximité de frontières complexes continuent de présenter de formidables défis, en particulier lorsqu'elles sont confrontées à des caractéristiques d'écoulement anisotropes. L'anisotropie de l'écoulement se produit lorsque des directions d'écoulement spécifiques … Lire la suite
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2024 — Ab initio Density Functional Theory thermodynamics study of α-aluminum oxide grain boundaries doped with reactive elementsRésumé
Les revêtements à barrière thermique (TBCs) sont largement utilisés dans les moteurs à turbine à gaz pour les protéger des conditions d'exploitation difficiles et leur permettre de fonctionner à des températures élevées. L'oxyde obtenue par croissance thermique (TGO) dans les TBC peut être considérablement ralentie par l'ajout de moins de 1 % en poids d'éléments réactifs (REs) dans les alliages formateurs d’oxyde. Ce phénomène est important car il retarde la défaillance des TBC et prolonge la durée de vie des moteurs à turbine à gaz. Toutefois, les mécanismes qui expliquent comment les REs influencent la croissance de cet oxyde ne … Lire la suite
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2024 — Light-Absorbing Carbonaceous Particles in Urban Regions: Physicochemical Properties and the Application of Data-Driven ModelingRésumé
Les particules carbonées absorbant la lumière (LAC), composées de carbone noir (BC) et de carbone brun (BrC), sont un groupe d'aérosols radiativement actifs qui peuvent avoir un impact significatif sur l'environnement et le climat en absorbant le rayonnement solaire, en assombrissant les surfaces de neige/glace et en servant de noyaux de condensation des nuages ou de noyaux de glace. Cependant, les effets des LACs sur le climat et la santé restent incertains en raison de mesures insuffisantes de leurs propriétés physico-chimiques. Dans les zones urbaines, les émissions anthropiques sont les principales sources de LACs, mais des sources naturelles telles que … Lire la suite
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2024 — The Role of FMRP in Stalled RibosomesRésumé
La synthèse locale des protéines est un processus crucial pour le maintien des fonctions essentielles telles que la plasticité synaptique. Une étude a démontré qu'un sous-ensemble de la synthèse protéique locale, comme celles invoquées par mGluR-LTD, est régie par des ribosomes bloqués - ces mêmes ribosomes qui sont en pause lors de l'élongation. Cependant, la manière dont le blocage se produit dans les neurones n’est pas tout à fait évidente. En effet, Une étude antérieure faite par notre laboratoire démontre que la protéine de retard mental Fragile X (FMRP) est hautement enrichie en granules d'ARN contenant des ribosomes bloqués (El … Lire la suite
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2024 — FOXA1-dependent metabolic alterations in MYC-driven prostate cancerRésumé
L'oncoprotéine c-MYC (MYC) est un moteur cléde la tumorigenèse et de la progression du cancer de la prostate. Dans le modèle de souris transgénique Hi-MYC, des adaptations métaboliques et des programmes transcriptionnels pro-tumorigènes ont été identifiés. Un précédent écran CRISPR/Cas9 ciblésur l'épigénétique utilisant des cellules MyC-CaP – dérivées de l'épithélium prostatique Hi-MYC – a identifiéle facteur de transcription pionnier forkhead box A1 (Foxa1) comme un candidat principal associéàune fonction oncogénique et central pour la prolifération des cellules cancéreuses de la prostate induite par MYC. En effet, nos études in vitro ont montré que la suppression (KO) de FOXA1 dans les … Lire la suite
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2024 — Development and application of a portable Raman device for in situ non-destructive detection of pork spoilageRésumé
La détérioration de la viande de porc est une préoccupation mondiale car elle peut entraîner des pertes économiques ainsi que des risques pour la santé des consommateurs. Alors que les méthodes traditionnelles d'évaluation de la détérioration offrent une précision, elles présentent des inconvénients, notamment des temps de traitement longs, la destruction des échantillons et des protocoles laborieux. Pour développer une approche plus rapide, non-invasive et facile à utiliser pour l'identification de la détérioration du porc, nous avons intégré un spectromètre Raman portable avec des algorithmes d'apprentissage automatique pour la différenciation des échantillons de porc frais et avariés. Dans ce projet … Lire la suite
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2024 — Unraveling the Contribution and Molecular Phenotypes of Bone Marrow-Dependent and Bone Marrow-Independent Macrophages in Diaphragm Muscle Homeostasis and DiseaseRésumé
Macrophages (MPs) are crucial for tissue homeostasis, immune surveillance, inflammation, and tissue repair. MPs maintain tissue integrity through their diverse functions, including phagocytosis, antigen presentation, and immune regulation. In acute muscle injury, MPs orchestrate the intricate process of muscle regeneration by removing necrotic debris, secreting chemokines, cytokines, and growth factors, and fine-tuning the myogenic process. They transition from a pro-inflammatory M1 phase that enhances inflammation and myogenic progenitor cell proliferation, to an anti-inflammatory M2 phase that facilitates myofiber differentiation and fusion. However, recent studies using single-cell RNA sequencing revealed distinct MP subpopulations within the muscle, necessitating further investigation of their … Lire la suite
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2024 — Estimation of corrosion exposure of electric transmission lines in Northern Climates:Résumé
This thesis presents advancements in a corrosion exposure model for quantifying the deterioration of overhead electric transmission conductors. The model considers various factors impacting the rate of corrosion of conductors in proximity to roads. The objective of the research is to improve the current model by considering the exposure to traffic on specific roads as a function of distance from the road considering prevailing wind speed and direction. Models for the generation of spray and splash of chlorides by vehicles as well as by waves for coastal locations are reviewed and a combined model is proposed that accounts for the … Lire la suite
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2024 — Two Essays on Product Management at the Dynamic Interface between Manufacturers and RetailersRésumé
Ma, Yu (Supervisor1) Lire la suite
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2024 — Advancing integrated photonic designs for high-speed datacenter interconnectsRésumé
La demande pour la transmission de données à haute vitesse est en forte croissance due à l'expansion rapide de services tels que le cloud computing, le streaming vidéo et l'analyse de grandes données. Les interconnexions électriques traditionnelles, limitées par la largeur de bande électrique et la consommation d'énergie, cèdent la place aux communications optiques. Les dispositifs photoniques intégrés, offrant des avantages significatifs en termes de performances et d'efficacité, sont devenus essentiels pour répondre à ces demandes. Les techniques de multiplexage telles que le multiplexage par division de polarisation (PDM), le multiplexage par division de longueur d'onde (WDM) et le multiplexage … Lire la suite
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2024 — Dynamic Digital Twins for On-Shelf Availability in the Retail StoreRésumé
À mesure que la technologie des jumeaux numériques est devenue pratique et réalisable, elle a été mise en œuvre dans de nombreux scénarios industriels. Même si les jumeaux numériques actuels peuvent satisfaire à la plupart des conditions et ont été conçus pour répondre à certaines exigences, il existe encore certaines situations dans lesquelles ils ne parviennent pas à simuler, comme dans les magasins de détail, qui nécessitent une mise à jour des modèles de produits de base. Dans un magasin de détail, les clients prennent et déposent toujours des produits et modifient le modèle du jumeau numérique. Par conséquent, notre … Lire la suite
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2024 — Polyphenol-rich cocoa powder improves behavioural functionality and gut morphology in a zebrafish model of autismRésumé
Kessen Patten (Supervisor2) Lire la suite
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2024 — Regenerative bioadhesives for intervertebral disc repairRésumé
Intervertebral disc (IVD) herniation is a leading cause of chronic lower back pain and disability, affecting people's daily lives and causing a substantial economic burden. Current surgical interventions, involving discectomy with or without nucleotomy. Though pain could be alleviated, damages to native nucleus pulposus (NP) and annulus fibrosus (AF) were inevitable, which heighten the risks of recurrent herniations. Bioadhesives hold promise as an alternative solution for IVD repair due to their capacity to fill the NP cavity while sealing defects in the AF, yet existing options are inadequate in restoring the biomechanical properties and fail to effectively prevent re-herniation under … Lire la suite
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2024 — Between Surface and Space: Painted Walls in Middle-period China (8th to 12th Century)Résumé
Les peintures murales chinoises de la période médiane, allant du huitième siècle au milieu du quatorzième siècle, a constitué et constitue toujours des ressources visuelles inestimables pour les spécialistes de l'art chinois afin de comprendre la dynamique de la culture visuelle de l'époque. Les études précédentes se sont principalement concentrées sur l'iconographie des peintures murales, leurs caractéristiques visuelles, les stratégies de représentation picturale, les contextes culturels et sociopolitiques dans lesquels elles ont été produites et les techniques employées pour les réaliser. Ces études ont profondément fait progresser notre compréhension des peintures murales chinoises de la période médiane. Cependant, la plupart … Lire la suite
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2024 — Mining front stability assessment using diametrical core deformation analysis and numerical modellingRésumé
Regularly estimating mining-induced stress is crucial due to variations in stress depending on many factors like depth, proximity to geological structures, and the history, geometry, and orientation of excavations with respect to principal in-situ stresses. As mining operations progress, the stresses near drifts, ramps, and sill drives continually change. These dynamic changes can significantly impact mining stability, potentially leading to various forms of rock failure. Mature in-situ stress measurement techniques are not well-suited for this task because of their high cost and time-consuming, typically conducted only a few times throughout the lifespan of a mining project. Consequently, there arises a … Lire la suite
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2024 — The Impact of a High-iron Diet on the Gut Microbiome and Insulin SensitivityRésumé
Environ 25 % des Nord-Américains souffrent du syndrome métabolique (MetS), avec un risque accru de développer un diabète et des maladies cardiovasculaires. Des études récentes ont montré que la teneur en fer des tissus, provenant de sources intrinsèques et extrinsèques, peut avoir un effet destructeur sur la manifestation du syndrome métabolique. En outre, le microbiote intestinal joue également un rôle essentiel dans l'obésité et les maladies cardiométaboliques. Il a été prouvé qu'un régime riche en fer modifie le microbiome intestinal des hôtes. Cependant, l'altération du microbiome intestinal des hôtes induite par un régime à haute teneur en fer (Carbonyl Iron … Lire la suite
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2024 — Search for a fermiophobic charged Higgs boson in proton-proton collisions with the ATLAS detectorRésumé
Corriveau, Francois (Supervisor1) Lire la suite
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2024 — Predicting Future Winter Subsurface Drainage Dynamics for Subsurface-Drained Croplands in Cold Climates under ClimateRésumé
Subsurface drainage is a commonly practiced agricultural management practice in North America to improve crop yield by removing excess water from the field. However, previous studies also discovered that the nutrient leached from the subsurface drainage was a leading contributor to the nutrient loss to surface water bodies. Recent in-situ experiments in subsurface-drained croplands in Eastern Canada revealed that winter is critical in determining the region's annual subsurface drainage flow and associated nutrient loss. However, it has been observed that the winter meteorological conditions are continuously changing in Canada. This thesis investigates the impact of warmer winter on winter subsurface … Lire la suite
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2024 — Exploring the antiviral defense mechanisms of IFITs in human innate immunityRésumé
En tant que première ligne de défense de l’hôte, le système immunitaire inné détecte les modèles moléculaires associés aux agents pathogènes (PAMP) lors d’une invasion virale. Les PAMP, tels que les acides nucléiques viraux simples brin et double brin, sont détectés par des récepteurs de reconnaissance de formes spécifiques, qui déclenchent des cascades de signalisation entraînant l'expression d'interférons de type I (IFNs) sensibles aux virus. Les interférons induisent en outre l’expression de divers gènes stimulés par les interférons qui inhibent la réplication virale. Parmi les ISG les plus puissamment exprimés figurent les protéines induites par l'interféron avec des répétitions tétratricopeptides … Lire la suite
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2024 — Evolutionary investigations into the heat shock response in freshwater bacterium Legionella pneumophilaRésumé
Par la distanciation et le port du masque, la transmission aérienne des infections est maintenant gravée dans l’inconscient collectif. Ceci rend plus facile de sympathiser avec les civils et les scientifiques de 1976, lorsque le bicentenaire de Philadelphie a été gâché par une éclosion d’une nouvelle pneumonie mortelle. Les épidémiologistes ont écarté les autres modes de transmissions avant de conclure qu’un nouveau pathogène, porté par les mouvements d’air, a atteint les poumons des passants et des conférenciers. La bactérie identifiée est maintenant appelée Legionella pneumophila et la maladie qu’elle cause, la maladie du Légionnaire. L. pneumophila est un pathogène opportuniste … Lire la suite
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2024 — ADAMTS19 Modulates Perinatal Valve MaturationRésumé
Andelfinger, Gregor (Supervisor2) Lire la suite
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2024 — Identification of novel genes and mechanisms responsible for recurrent pregnancy lossRésumé
Approximately 10-20% of clinically recognized pregnancies result in spontaneous loss. The occurrence of at least two of such events before 24 weeks of gestation is termed recurrent pregnancy loss (RPL), which affects 1-5% of couples trying to conceive, and approximately half of these cases remain clinically unexplained. Exome sequencing on patients with RPL revealed a homozygous nonsense mutation in HORMAD2 in a patient with eight recurrent miscarriages and no live birth. HORMAD2 is an essential protein of the synaptonemal complex. Microscopic morphological evaluation of one of the patient’s miscarriages confirmed its diagnosis. Microsatellite genotyping on available DNA from two other … Lire la suite
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2024 — A note on the relation between the cold-V brightness temperature feature and the above anvil cirrus plumesRésumé
The cold (enhanced) "V" brightness temperature feature in the infrared (IR) satellite imagery is often used by weather forecasters to aid their issuance of severe weather warning and is thought to be caused by the above anvil cirrus plumes (AACPs). However, multiple explanations of the cold-V feature have been proposed and its relation to AACP continues to be debated. This note aims to clarify their relation, by using the satellite images synthesized from the high-resolution simulation of overshooting convective storms by the Global Environmental Multiscale model combined with the MODerate spectral resolution TRANsmittance radiative transfer model. It is found that, … Lire la suite
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2024 — Human scanpaths during active visionRésumé
L'une des questions fondamentales de la perception visuelle est de savoir comment et dans quelle mesure les mécanismes visuels intègrent les informations entre les fixations, et si le traitement visuel se fait indépendamment entre chaque fixation. Ce mémoire explore les caractéristiques temporelles de la recherche visuelle lors de recherches orientées sur des images représentant des scènes complexes de la vie quotidienne. Une attention particulière est accordée à l'intégration de l'information et au transfert inter-saccades dans ces scénarios de recherche plus réalistes.Ce mémoire combine les approches d'études précédentes qui ont utilisé soit des caractéristiques temporelles, soit des ensembles de données de … Lire la suite
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2024 — Kinetics and Cellular Viability of Needle and Needle-free Liquid Jet Injection (NFLJI)Résumé
It is reported that up to 9% of the population suffers from a voice dysfunction or disorder at some point in their lives. Voice disorders may occasionally require treatment through the injection of biomaterials, such as collagen or fat, to the lamina propria. Limitations in the conventional use of needles for this application offers an opportunity for the adaptation of needle-free liquid jet injection (NFLJI). Recent work has highlighted benefits of NFLJI in terms of reduced experiences of needle phobia and pain. However, there remains a lack of understanding regarding tissue response to NFLJI, preventing their wider use today.The present … Lire la suite
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2024 — Clinical Accuracy of Serum Neurofilament Light to Differentiate Frontotemporal Dementia from Primary Psychiatric DisordersRésumé
ObjectifsIntroductionLa démence frontotemporale (DFT) est l'une des formes les plus courantes de démence précoce. Parmi les DFT, la variante comportementale (DFTvc) est le sous-groupe le plus fréquent. DFTvc est difficile à diagnostiquer car les symptômes se chevauchent avec les troubles psychiatriques primaires (TPP). Les chaînes légères de neurofilaments sériques (sNfL) ont émergé en tant que biomarqueur discriminatif potentiel pour distinguer la DFTvc (sNfL élevé) du TPP (sNfL faible), car il sert de mesure de la neurodégénérescence. Les facteurs de mode de vie et démographiques ainsi que les comorbidités médicales peuvent affecter les niveaux de sNfL. Des études à grande échelle … Lire la suite
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2024 — Real-world evidence on harm reduction strategies: A multidisciplinary evaluationRésumé
People who inject drugs (PWID) are at elevated risks of adverse health outcomes, including overdose and HIV. To reduce these drug-related harms, several strategies have been employed, including needle and syringe programs (NSP), opioid agonist treatment (OAT), and supervised consumption sites (SCS).Skin, soft tissue, and vascular infections (SSTVI) are the leading cause of morbidity in PWID globally. However, earlier studies examining the effectiveness of NSP and SCS have overlooked these endpoints. For studies comparing OAT medications, treatment retention is the most common measure of effectiveness. Despite available evidence, no studies have unified findings from different healthcare practices to strengthen clinical … Lire la suite
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2024 — Neurexin-dependent circuit activity is required for the maintenance of R8 photoreceptor subtypes in the Drosophila visual circuit.Résumé
In both the human and Drosophila color vision systems, photoreceptor neurons (cone cells in humans and R7/R8 photoreceptor cells in Drosophila) engage in stochastic decisions to exclusively express a single photopigment from their respective family, excluding all others. While recent research has started to unveil the mechanisms behind the development of cone subtypes in mammals, the maintenance of mutually exclusive cone subtypes within the mammalian retina remains a mystery. In contrast, recent investigations in Drosophila have yielded insights into the identification of various intrinsic factors responsible for upholding the identities of mutually exclusive R8 photoreceptor subtypes in adult flies. However, … Lire la suite
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2024 — Foundational Disjunctions: Limit, Function, and Dialectic in Ernst Cassirer and Nicholas of CusaRésumé
Ernst Cassirer is both an eminent scholar of the Western intellectual tradition and a philosopher in his own right. These two facets of his thought cannot be extricated from each other; indeed, his philosophy develops out of his evaluation and narrativisation of the progress of the Western intellectual tradition. Pivotal in this narrative is the 15th c. cardinal and philosopher, Nicholas of Cusa. Cusa, for Cassirer, encompasses all the strands of Renaissance thought and thus embodies the passage from the Middle Ages to Modernity. This thesis argues that Cusa's philosophy is defining for Cassirer's thought. More precisely, Cusa's elaboration of … Lire la suite
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2024 — Resurrecting Revolution: Performing the Radical Past in the Twentieth CenturyRésumé
Depuis les actions préliminaires de la Révolution française en 1789, ces événements ont été joués sur scène et hors scène. Cette mémoire analyse trois pièces historiques du vingtième siècle créées par des artistes féminines de théâtre qui « ressuscitent » la Révolution française, la Révolution haïtienne et les luttes libératoires raccordées menées en Guadeloupe au dix-huitième siècle. S’inspirant des études sur la performance et de l’histoire du théâtre, chaque œuvre est située dans son contexte et dans un genre plus large : le « Trauerspiel révolutionnaire ». Les sources analysées comprennent les textes dramatiques, les productions historiques, les représentations enregistrées, … Lire la suite
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2024 — Why This App? How User Ratings, App Store Rankings, and Other App Store Information Impact Educators' Selection of Educational AppsRésumé
Des recherches indiquent que les éducateurs accordent d’importance aux critères de référence éducatives lorsqu’ils choisissent les applications éducatives des boutiques en ligne (c’est-à-dire : programme d’études, rétroaction, étayage, théorie de l’apprentissage et équipe de développement). Cependant, il n’est toujours pas clair quel impact les évaluations d’autres utilisateurs ou le rang de l’application dans la liste des « meilleures » applications éducatives de l’app store pourrait avoir sur les évaluations des éducateurs. La présente étude examine comment les critères de référence éducatives, les évaluations des utilisateurs et les rangs des applications impactent les sélections des éducateurs. Cent cinquante éducateurs de l’école … Lire la suite
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2024 — Meet me at the wayside cross: a pilgrimage into collective memoryRésumé
Inhabiting the popular imagination of generations of Québécois and yet seldom noticed, over 3,000 monumental crosses adorn the roads of the province of Québec. Once at the center of ritual practices rooted in quotidian farm life, these wayside crosses continue to perform vital functions for Québécois folk by acting as evokers of collective memory. Following an autoethnographic model, this thesis examines how the croix de chemin fosters conversations about Québécois identity. More so, it foregrounds how affect, produced by sensory experiences, shapes an ever-evolving collective memory that remains intrinsically linked to these cultural artefacts Lire la suite
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2024 — Spinal Cell-Type-Specific Translational Control Mechanisms in the Development and Maintenance of Chronic PainRésumé
Mogil, Jeffrey (Supervisor2) Lire la suite
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2024 — Arsenite methyltransferase—a unitasking arsenite methylator or a hidden protein moonlighter?Résumé
Contexte: L’arsenic inorganique est métabolisé par l’arsenic 3-méthyltransférase (AS3MT). Cette réaction forme des espèces d’arsenic méthylées qui sont excrétées plus rapidement. AS3MT est soupçonné de posséder une fonction supplémentaire en raison de sa conservation évolutive ainsi que la réponse au stress et le taux de prolifération plus lent manifesté à la base par les cellules As3mt knock-out.Objectif: La caractérisation des cellules As3mt knock-out et l’évaluation des différences basales qui dépendent de l’expression d’AS3MT d’un point de vue protéomique. L’hypothèse est que l’expression d’AS3MT affecte la fonction cellulaire via une activité basale indépendante de la méthylation de l’arsenic.Méthodes: Les fibroblastes embryonnaires … Lire la suite
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2024 — A Mixed Methods Systematic Review of the Ethical Issues Associated with the Use of Race, Ethnicity, and Genetic AncestryRésumé
L'utilisation de la race, de l'ethnicité et de l'ascendance génétique (RE/GA) dans la recherche en génomique soulève une pléthore de questions éthiques. Bien qu'il existe une abondante littérature académique sur ce sujet, il n'existe actuellement aucune synthèse complète et cohésive. Cette thèse utilise une revue systématique de la littérature avec des méthodes mixtes pour combler cette lacune de connaissance, et explorer trois questions de recherche clés :1.Quelles sont les questions éthiques associées à l'utilisation de la race, de l'ethnicité et de l'ascendance génétique dans la recherche en génomique ?2.Comment la discipline académique d'un auteur affecte-t-elle les types de questions éthiques … Lire la suite
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2024 — Multi-Hop Spatio-Temporal Graph Attention Networks for Epilepsy Diagnosis and PrognosisRésumé
Graph Neural Networks (GNNs) represent a formidable breakthrough in feature extraction from non-Euclidean datasets, particularly in medical imaging such as brain networks derived from functional magnetic resonance imaging (fMRI). However, existing GNN frameworks for analyzing spatio-temporal dynamics within brain networks often overlook indirect node connections, leading to suboptimal performance, particularly across heterogeneous datasets from different sites. To address these limitations, we propose a novel approach called Multi-Hop Spatio-Temporal Graph Convolutional Network (MSTGCN) with Reverse Contrastive (RevCon) learning for identifying temporal lobe epilepsy (TLE) and predicting surgical outcomes. Our approach leverages a graph attention mechanism that incorporates both node and edge … Lire la suite
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2024 — Detecting and understanding climate change using hyperspectral radiative measurementsRésumé
Huang, Yi (Supervisor1) Lire la suite
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2024 — Effects of real-time feedback in the form of biological cues on post-stroke gait symmetryRésumé
L'asymétrie de la marche est un dysfonctionnement commun après l’accident vasculaire cérébral (AVC) qui est caractérisé par une phase d'oscillation prolongée du côté parétique et/ou une longueur de pas plus grande ou plus petite du côté parétique par rapport au côté non-parétique. Il a été démontré que le cerveau humain pouvait facilement déchiffrer une rétroaction (feedback) consistant en du ‘mouvement biologique.’ Présenté en temps réel sous la forme d'un avatar visuel et/ou de sons de pas, un tel feedback pourrait contribuer à minimiser l'asymétrie de la marche post-AVC, bien que cela reste à explorer. Dans le premier manuscrit, nous avons … Lire la suite
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2024 — Fracture mechanics of blood clotsRésumé
Blood clots are naturally derived bioadhesives that adhere to tissues, plug vascular defects and stop bleeding. The mechanical behaviors of blood clots are critical in both hemostasis and thrombosis,and their functions hinge on their resistance against rupture. Despite the relevance, there exist major challenges in understanding the fracture behaviors of blood clots. Challenges include the lack of proper mechanical testing methods for blood clots, limited understanding of the responses of clots under complex loading conditions and the interplay between adhesive fracture and cohesive fracture. To this end, this thesis investigates the fracture mechanics of blood clots, with a focus on … Lire la suite
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2024 — Responsible AI Considerations in Automatic Text Summarization ResearchRésumé
The task of automatic text summarization (ATS) involves automatically producing a shorter version of an input text while preserving important information. As summaries allow readers to quickly grasp the main ideas of textual data, ATS systems have a wide range of applications, ranging from producing news article headlines to summarizing customer reviews. System-generated summaries, however, could be incorrect, biased and even harmful --- e.g., a news headline incorrectly representing the events reported in the source article, thereby misinforming the public. Despite increasing interest in the responsible development and use of artificial intelligence technologies, there is --- for the task of … Lire la suite
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2024 — Efficient anomaly detection using diffusionRésumé
La détection d'anomalies consiste à identifier des données inhabituelles en supposant que les données normales suivent un modèle de distribution spécifique. Elle joue un rôle crucial dans divers domaines tels que la surveillance médicale, la cybersécurité et la détection de fraudes. L'identification des anomalies devient difficile lorsque leur distribution est inconnue, conduisant à l'absence de données étiquetées lors de l'entraînement. Les modèles de diffusion sont des candidats attrayants puisqu'ils sont excellents pour apprendre la distribution des données. Une fois apprise, on peut exploiter la distribution des données normales pour identifier les anomalies. Auparavant, l’erreur de reconstruction était utilisée à cette … Lire la suite
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2024 — The cervicovaginal microbiome in human papillomavirus-associated cervical carcinogenesis: potential value for clinical practiceRésumé
Contexte: L’infection avec un des types haut-risque du virus du papillome humain (hrVPH) est une cause nécessaire, mais non suffisante, du cancer du col de l’utérus et de ses lésions précurseurs, les néoplasies intraépithéliales cervicales (CINs). La plupart des infections au virus du papillome humain (VPH) sont transitoires; une petite proportion persiste et mène au développement du cancer du col de l’utérus. La cytologie sert historiquement de référence absolue pour la détection des anormalités cervicaux. Plus récemment, le test VPH a été introduit comme test de dépistage et de prévision des risques. Le microbiome cervico-vaginale (CVM) pourrait jouer un rôle … Lire la suite
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2024 — Role of citrate in the production of reactive oxygen species during human sperm capacitationRésumé
Sperm capacitation involves a series of biochemical and morphological changes, which are necessary for the spermatozoon to fertilize the oocyte. The process of sperm capacitation requires the production of low levels of reactive oxygen species, an increase in tyrosine phosphorylation, and sufficient levels of different energy metabolites such as citrate. Human spermatozoa are exposed to high concentrations of citrate from the seminal plasma, yet the role of citrate in sperm capacitation is largely unknown. Extracellular citrate can be imported into the cytosol of the spermatozoon via sodium-coupled solute carrier proteins, and mitochondrial citrate can be exported to the cytosol via … Lire la suite
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2024 — Improving SMARCA4 variant classification in the context of small cell carcinoma of the ovary, hypercalcemic typeRésumé
Objectif : Les variants pathogènes germinaux (VPGs) du gène SMARCA4 sont associés au cancer de l'ovaire à petites cellules de type hypercalcémique (SCCOHT), aux tumeurs rhabdoïdes atypiques (ATRT) et aux tumeurs rhabdoïdes malignes (MRT). SCCOHT est une maladie monogénique rare et très agressive qui survient chez les jeunes femmes et qui représente environ 0,01 % de tous les cancers de l'ovaire, l'âge moyen du diagnostic étant de 24 ans. SCCOHT présente des défis importants en termes de gestion clinique dû au manque de recherches approfondies en raison de sa rareté et agressivité, de ses options thérapeutiques limitées et de son … Lire la suite